RNA id: TCONS_00020273



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00020273
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_010260
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 48158309 ~ 48158423 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTGGCAGCCAGCTCTCTGCAATTCTCatatggttgcccactgaagctaagcatggATGAGCCCGATCAGTACCTgaataggagaccacatgggaaagataggttgctgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190150

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021755 lncRNA upstream 158898 47998832 ~ 47999411 (+) True XLOC_010258
TCONS_00021754 lncRNA upstream 393490 47764225 ~ 47764819 (+) True XLOC_010257
TCONS_00020271 lncRNA upstream 727392 47428789 ~ 47430917 (+) True XLOC_010256
TCONS_00021753 lncRNA upstream 768931 47383795 ~ 47389378 (+) False XLOC_010255
TCONS_00021756 lncRNA downstream 509891 48668314 ~ 48677034 (+) False XLOC_010264
TCONS_00020281 lncRNA downstream 512921 48671344 ~ 48677034 (+) False XLOC_010264
TCONS_00020283 lncRNA downstream 512934 48671357 ~ 48677034 (+) False XLOC_010264
TCONS_00022037 lncRNA downstream 512937 48671360 ~ 48677034 (+) False XLOC_010264
TCONS_00020280 lncRNA downstream 513037 48671460 ~ 48677034 (+) False XLOC_010264
TCONS_00020270 mRNA upstream 708305 47428735 ~ 47450004 (+) False XLOC_010256
TCONS_00020269 mRNA upstream 708398 47428721 ~ 47449911 (+) False XLOC_010256
TCONS_00020268 mRNA upstream 814162 47308856 ~ 47344147 (+) True XLOC_010254
TCONS_00020267 mRNA upstream 926163 47207691 ~ 47232146 (+) True XLOC_010253
TCONS_00020266 mRNA upstream 954008 47203422 ~ 47204301 (+) True XLOC_010252
TCONS_00020275 mRNA downstream 302450 48460873 ~ 48573510 (+) True XLOC_010262
TCONS_00020276 mRNA downstream 457797 48616220 ~ 48643191 (+) False XLOC_010263
TCONS_00020277 mRNA downstream 457874 48616297 ~ 48643180 (+) False XLOC_010263
TCONS_00020278 mRNA downstream 468357 48626780 ~ 48643172 (+) False XLOC_010263
TCONS_00020279 mRNA downstream 472989 48631412 ~ 48641181 (+) True XLOC_010263
TCONS_00020272 other upstream 134901 48023293 ~ 48023408 (+) True XLOC_010259
TCONS_00020265 other upstream 1145852 47012341 ~ 47012457 (+) True XLOC_010251
TCONS_00020229 other upstream 2491457 45666735 ~ 45666852 (+) True XLOC_010222
TCONS_00020228 other upstream 2569979 45588214 ~ 45588330 (+) True XLOC_010221
TCONS_00020217 other upstream 3453155 44704372 ~ 44705154 (+) True XLOC_010213
TCONS_00020274 other downstream 98590 48257013 ~ 48257130 (+) True XLOC_010261
TCONS_00020297 other downstream 1389348 49547771 ~ 49547886 (+) True XLOC_010272
TCONS_00020308 other downstream 2081900 50240323 ~ 50254974 (+) True XLOC_010278
TCONS_00020312 other downstream 2348753 50507176 ~ 50507295 (+) True XLOC_010284
TCONS_00020313 other downstream 2582557 50740980 ~ 50803345 (+) False XLOC_010281