RNA id: TCONS_00023027


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023027
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_011560
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 32701705 ~ 32701821 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAGCtgtatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagccaagTAGGGCTGAGCCTGGACAGTAActggattggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183501

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024712 lncRNA upstream 70191 32622931 ~ 32631514 (+) False XLOC_011558
TCONS_00024711 lncRNA upstream 71515 32622931 ~ 32630190 (+) False XLOC_011558
TCONS_00024710 lncRNA upstream 71515 32622931 ~ 32630190 (+) False XLOC_011558
TCONS_00024713 lncRNA upstream 71515 32622943 ~ 32630190 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023023 lncRNA upstream 71764 32624832 ~ 32629941 (+) False XLOC_011558
TCONS_00024473 lncRNA downstream 14376 32716197 ~ 32716792 (+) True XLOC_011561
TCONS_00024714 lncRNA downstream 78881 32780702 ~ 32837239 (+) False XLOC_011562
TCONS_00024716 lncRNA downstream 78881 32780702 ~ 32870816 (+) False XLOC_011562
TCONS_00024715 lncRNA downstream 78881 32780702 ~ 32870816 (+) False XLOC_011562
TCONS_00024717 lncRNA downstream 78952 32780773 ~ 32837239 (+) False XLOC_011562
TCONS_00023018 mRNA upstream 71422 32622933 ~ 32630283 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023022 mRNA upstream 72031 32623931 ~ 32629674 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023015 mRNA upstream 93184 32571584 ~ 32608521 (+) True XLOC_011557
TCONS_00023014 mRNA upstream 150449 32531854 ~ 32551256 (+) True XLOC_011556
TCONS_00023011 mRNA upstream 174385 32374876 ~ 32527320 (+) False XLOC_011552
TCONS_00023029 mRNA downstream 456529 33158350 ~ 33201840 (+) False XLOC_011566
TCONS_00023031 mRNA downstream 525134 33226955 ~ 33230039 (+) True XLOC_011567
TCONS_00023032 mRNA downstream 594615 33296436 ~ 33309689 (+) False XLOC_011568
TCONS_00023033 mRNA downstream 595031 33296852 ~ 33304049 (+) True XLOC_011568
TCONS_00023035 mRNA downstream 609963 33311784 ~ 33339480 (+) False XLOC_011570
TCONS_00023026 other upstream 49200 32652381 ~ 32652505 (+) True XLOC_011559
TCONS_00023025 other upstream 70191 32627924 ~ 32631514 (+) True XLOC_011558
TCONS_00023024 other upstream 71515 32624890 ~ 32630190 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023017 other upstream 72154 32622931 ~ 32629551 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023019 other upstream 73965 32622943 ~ 32627740 (+) False XLOC_011558
TCONS_00023028 other downstream 456473 33158294 ~ 33173153 (+) False XLOC_011566
TCONS_00023034 other downstream 596527 33298348 ~ 33298470 (+) True XLOC_011569
TCONS_00023050 other downstream 883525 33585346 ~ 33585462 (+) True XLOC_011577
TCONS_00023073 other downstream 3213189 35915010 ~ 35915126 (+) True XLOC_011591
TCONS_00023075 other downstream 3912494 36614315 ~ 36614432 (+) True XLOC_011593