RNA id: TCONS_00023050



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00023050
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_011577
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 33585346 ~ 33585462 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGCCACAGCCAGATCACTCTGTAGcctaagaccggttactcacttaagctaagcagggcagagcctggtcagtacctgtatgggagaccacatgggaaatctAGGTTACTGTTGGGC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175592

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00023045 lncRNA upstream 148535 33433566 ~ 33436811 (+) False XLOC_011574
TCONS_00023030 lncRNA upstream 391325 33184337 ~ 33194021 (+) True XLOC_011566
TCONS_00024476 lncRNA upstream 463550 33120580 ~ 33121796 (+) True XLOC_011565
TCONS_00024475 lncRNA upstream 464836 33118538 ~ 33120510 (+) True XLOC_011564
TCONS_00024719 lncRNA upstream 474180 33109706 ~ 33111166 (+) True XLOC_011563
TCONS_00024477 lncRNA downstream 592730 34178192 ~ 34182830 (+) True XLOC_011579
TCONS_00024478 lncRNA downstream 683658 34269120 ~ 34287056 (+) True XLOC_011582
TCONS_00024720 lncRNA downstream 1048636 34634098 ~ 34675436 (+) True XLOC_011583
TCONS_00023069 lncRNA downstream 1658303 35243765 ~ 35244470 (+) True XLOC_011586
TCONS_00023070 lncRNA downstream 1693326 35278788 ~ 35288741 (+) False XLOC_011587
TCONS_00023048 mRNA upstream 86323 33495194 ~ 33499023 (+) False XLOC_011576
TCONS_00023049 mRNA upstream 86757 33496067 ~ 33498589 (+) True XLOC_011576
TCONS_00023047 mRNA upstream 99316 33453689 ~ 33486030 (+) True XLOC_011575
TCONS_00023046 mRNA upstream 144326 33433576 ~ 33441020 (+) True XLOC_011574
TCONS_00023043 mRNA upstream 152249 33415542 ~ 33433097 (+) False XLOC_011573
TCONS_00023051 mRNA downstream 133953 33719415 ~ 33906488 (+) False XLOC_011578
TCONS_00023052 mRNA downstream 182428 33767890 ~ 33905439 (+) True XLOC_011578
TCONS_00023054 mRNA downstream 414168 33999630 ~ 34182538 (+) False XLOC_011579
TCONS_00023053 mRNA downstream 414168 33999630 ~ 34182538 (+) False XLOC_011579
TCONS_00023059 mRNA downstream 414168 33999630 ~ 34185513 (+) False XLOC_011579
TCONS_00023034 other upstream 286876 33298348 ~ 33298470 (+) True XLOC_011569
TCONS_00023028 other upstream 412193 33158294 ~ 33173153 (+) False XLOC_011566
TCONS_00023027 other upstream 883525 32701705 ~ 32701821 (+) True XLOC_011560
TCONS_00023026 other upstream 932841 32652381 ~ 32652505 (+) True XLOC_011559
TCONS_00023025 other upstream 953832 32627924 ~ 32631514 (+) True XLOC_011558
TCONS_00023073 other downstream 2329548 35915010 ~ 35915126 (+) True XLOC_011591
TCONS_00023075 other downstream 3028853 36614315 ~ 36614432 (+) True XLOC_011593
TCONS_00023082 other downstream 3668286 37253748 ~ 37281313 (+) True XLOC_011598
TCONS_00023083 other downstream 3686557 37272019 ~ 37272133 (+) True XLOC_011599
TCONS_00023087 other downstream 3868214 37453676 ~ 37453807 (+) True XLOC_011602