RNA id: XM_036975043.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_036975043.1
length 1805
RNA type mRNA
GC content 0.39
exon number 3
gene id LOC110520487
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 69892951 ~ 69895131 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

CATGTTGACTAATGTGTGGAGCTGCAACTGGTCAACTCACGGATAGAGTTTGGGGTGTTACTATGGGACGTAGTAGGTCCAGCTGGCTGTTGATAGTAGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTAGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGGCGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGGGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATCTAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTAGTGTTTATGTTGATAGTGATTCAGATGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATCTAGGTGGTGTTTATATTGATAGTGTTGCAGGTGGTatgtatgttgatagtgttgcAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGAGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTatgtatgttgatagtgttgcAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCGGGTGGTGTTTATGATGATAGTGATGCAGGTTGTGTTTATGATGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATAATGATAGTGATGCAGGTAATGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGCTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGATGATAGTGATGCAGGTAATGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATATTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTAGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATATTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGGATGTGTTTGTGTTGATAGTGTTGAAGGTAGTATTTGTGTTGATAGTGTTGCAGTTAATGTTTATGTTGATAGTGATGCAGGTGGGGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGTTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGAAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGTTGCAGGTGGTGTTTATGTTGATAGTGATGATAGAGATGTGCGTTATTCTAGTAGTGCCATATGTGTGATGATGCTGTTGGTAAGGGAGCTCGGTATCTATGGCAGTTCATTGACGTTTGTTTTTGTTTCTATTGTTGTATGTTATCATCAATGGATTCTAGAGGCTGTATTTTCCAGCGATTgcaggatttgtatttatttttattgatttcacctttatttaaccaggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU330914 lncRNA downstream 14647 69871658 ~ 69878304 (-) False xk
TU330911 lncRNA downstream 14647 69874614 ~ 69878304 (-) True xk
TU330883 lncRNA downstream 29381 69862058 ~ 69863570 (-) True G291812
TU330901 lncRNA downstream 32640 69860109 ~ 69860311 (-) True G291829
TU330899 lncRNA downstream 38162 69854480 ~ 69854789 (-) True G291827
TU330957 lncRNA upstream 38728 69933859 ~ 69935242 (-) True piga
TU330993 lncRNA upstream 76530 69971661 ~ 69971925 (-) True G291896
TU330976 lncRNA upstream 135633 70030764 ~ 70034763 (-) False G291884
TU330977 lncRNA upstream 135633 70030764 ~ 70034763 (-) False G291884
TU330978 lncRNA upstream 135633 70030764 ~ 70034763 (-) False G291884
XM_036975035.1 mRNA downstream 31950 69775632 ~ 69861001 (-) True sytl5
XM_036975034.1 mRNA downstream 31951 69775632 ~ 69861000 (-) False sytl5
XM_036975036.1 mRNA downstream 31952 69775632 ~ 69860999 (-) False sytl5
XM_036975037.1 mRNA downstream 78143 69775632 ~ 69814808 (-) False sytl5
XM_036975032.1 mRNA downstream 183782 69698559 ~ 69709169 (-) True otc
XM_021583357.2 mRNA upstream 12174 69907305 ~ 69911161 (-) True LOC110504590
XM_021597848.2 mRNA upstream 32530 69927661 ~ 69933360 (-) True asb11
XM_036975044.1 mRNA upstream 38566 69933697 ~ 69938854 (-) False piga
XM_021597845.2 mRNA upstream 38566 69933697 ~ 69938856 (-) False piga
XM_036975045.1 mRNA upstream 38566 69933697 ~ 69938856 (-) False piga
TU330123 other downstream 636407 69256005 ~ 69256544 (-) True G291138
TU329646 other downstream 1042097 68846611 ~ 68850854 (-) True G290713
TU329520 other downstream 1168037 68721808 ~ 68724914 (-) True G290602
TU329515 other downstream 1175566 68710367 ~ 68717385 (-) True G290598
TU329467 other downstream 1245331 68626332 ~ 68647620 (-) True G290567
TU330998 other upstream 85215 69980346 ~ 69996605 (-) True G291901
TU331092 other upstream 212409 70107540 ~ 70107950 (-) True G291977
TU332000 other upstream 824905 70720036 ~ 70720591 (-) True G292753
TU332200 other upstream 1132488 71027619 ~ 71040152 (-) True G292919
TU333405 other upstream 2008183 71903314 ~ 71903908 (-) True G293984

Expression Profile