RNA id: XM_021612959.2


Basic Information

Item Value
RNA id XM_021612959.2
length 13561
RNA type mRNA
GC content 0.44
exon number 13
gene id LOC110530125
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 54058122 ~ 54105410 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU821176 lncRNA upstream 83982 54189392 ~ 54243058 (-) True G722814
TU821132 lncRNA upstream 99278 54204688 ~ 54207815 (-) True G722773
TU821215 lncRNA upstream 141662 54247072 ~ 54247859 (-) True G722849
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XM_036985681.1 mRNA downstream 43688 54008434 ~ 54014434 (-) True cnn2
XM_021612952.2 mRNA downstream 54934 54001129 ~ 54003188 (-) True LOC110530123
XR_005053060.1 mRNA downstream 55555 54002434 ~ 54002567 (-) True LOC118965682
XM_021612960.2 mRNA upstream 21658 54127068 ~ 54131739 (-) True LOC110530126
XM_021612975.2 mRNA upstream 268823 54374233 ~ 54377574 (-) True LOC110530134
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XM_021612982.2 mRNA upstream 340809 54446219 ~ 54465716 (-) True LOC110530140
XM_036985695.1 mRNA upstream 372515 54477925 ~ 54485433 (-) False LOC110530141
TU821019 other downstream 130163 53926228 ~ 53927959 (-) True G722670
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Expression Profile