RNA id: TCONS_00036099


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00036099
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_018342
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 43082949 ~ 43083067 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATCAACAGCAAATGATGACCCTGCAGTCCAAGACCAAatactcactgaagctaaacaggCCTTAGCCAGGTCAggacctggatgggagaccacatggaaaaactagcttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120052

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036098 lncRNA downstream 41644 43039061 ~ 43041305 (-) True XLOC_018341
TCONS_00036097 lncRNA downstream 45877 43036516 ~ 43037072 (-) False XLOC_018341
TCONS_00036497 lncRNA downstream 230619 42849227 ~ 42852330 (-) True XLOC_018338
TCONS_00036496 lncRNA downstream 263836 42806763 ~ 42819113 (-) True XLOC_018337
TCONS_00036495 lncRNA downstream 281524 42793559 ~ 42801425 (-) True XLOC_018336
TCONS_00036102 lncRNA upstream 262815 43345882 ~ 43389320 (-) False XLOC_018343
TCONS_00036103 lncRNA upstream 270024 43353091 ~ 43387167 (-) True XLOC_018343
TCONS_00036951 lncRNA upstream 314656 43397723 ~ 43410305 (-) False XLOC_018344
TCONS_00036104 lncRNA upstream 314656 43397723 ~ 43410358 (-) False XLOC_018344
TCONS_00036952 lncRNA upstream 314656 43397723 ~ 43411607 (-) False XLOC_018344
TCONS_00036095 mRNA downstream 3471 43016437 ~ 43079478 (-) False XLOC_018341
TCONS_00036094 mRNA downstream 110350 42968785 ~ 42972599 (-) True XLOC_018340
TCONS_00036092 mRNA downstream 332678 42748295 ~ 42750271 (-) True XLOC_018334
TCONS_00036090 mRNA downstream 380065 42688488 ~ 42702884 (-) False XLOC_018333
TCONS_00036091 mRNA downstream 380117 42701112 ~ 42702832 (-) True XLOC_018333
TCONS_00036100 mRNA upstream 37065 43120132 ~ 43346049 (-) False XLOC_018343
TCONS_00036101 mRNA upstream 39909 43122976 ~ 43353097 (-) False XLOC_018343
TCONS_00036106 mRNA upstream 349025 43432092 ~ 43436896 (-) True XLOC_018346
TCONS_00036107 mRNA upstream 374358 43457425 ~ 43459761 (-) False XLOC_018347
TCONS_00036108 mRNA upstream 374444 43457511 ~ 43462190 (-) True XLOC_018347
TCONS_00036096 other downstream 3468 43016437 ~ 43079481 (-) False XLOC_018341
TCONS_00036093 other downstream 115561 42967274 ~ 42967388 (-) True XLOC_018339
TCONS_00036086 other downstream 677737 42405098 ~ 42405212 (-) True XLOC_018330
TCONS_00036072 other downstream 1729989 41352846 ~ 41352960 (-) True XLOC_018324
TCONS_00036071 other downstream 1854770 41228064 ~ 41228179 (-) True XLOC_018322
TCONS_00036136 other upstream 1265875 44348942 ~ 44349057 (-) True XLOC_018363
TCONS_00036148 other upstream 1829146 44912213 ~ 44912331 (-) True XLOC_018369
TCONS_00036178 other upstream 3100120 46183187 ~ 46249185 (-) True XLOC_018394
TCONS_00036182 other upstream 3367411 46450478 ~ 46457256 (-) True XLOC_018396
TCONS_00036189 other upstream 3653615 46736682 ~ 46738314 (-) False XLOC_018401