RNA id: TCONS_00036136


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00036136
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_018363
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 44348942 ~ 44349057 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCGCcaactagctctctgcaactcttaaattgtcgcccactaaagctaagctaGGTGTGCGCCCGGCCAGTACCTGGATGGTAGATCACATGGGAATGccaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174916

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036965 lncRNA downstream 1420 44346749 ~ 44347522 (-) False XLOC_018362
TCONS_00036958 lncRNA downstream 72954 44157340 ~ 44275988 (-) False XLOC_018361
TCONS_00036959 lncRNA downstream 72954 44157340 ~ 44275988 (-) False XLOC_018361
TCONS_00036957 lncRNA downstream 72954 44157340 ~ 44275988 (-) False XLOC_018361
TCONS_00036956 lncRNA downstream 72954 44157340 ~ 44275988 (-) False XLOC_018361
TCONS_00036966 lncRNA upstream 997 44350054 ~ 44361396 (-) False XLOC_018362
TCONS_00036501 lncRNA upstream 3077 44352134 ~ 44361231 (-) True XLOC_018362
TCONS_00036502 lncRNA upstream 115288 44464345 ~ 44465813 (-) False XLOC_018365
TCONS_00036967 lncRNA upstream 1019588 45368645 ~ 45405742 (-) False XLOC_018370
TCONS_00036503 lncRNA upstream 1202454 45551511 ~ 45560420 (-) True XLOC_018371
TCONS_00036135 mRNA downstream 258282 43996248 ~ 44090660 (-) True XLOC_018359
TCONS_00036134 mRNA downstream 258294 43996248 ~ 44090648 (-) False XLOC_018359
TCONS_00036132 mRNA downstream 258318 43996041 ~ 44090624 (-) False XLOC_018359
TCONS_00036133 mRNA downstream 293819 43996248 ~ 44055123 (-) False XLOC_018359
TCONS_00036131 mRNA downstream 293847 43994848 ~ 44055095 (-) False XLOC_018359
TCONS_00036137 mRNA upstream 23688 44372745 ~ 44460789 (-) True XLOC_018364
TCONS_00036138 mRNA upstream 115288 44464345 ~ 44496245 (-) True XLOC_018365
TCONS_00036139 mRNA upstream 158610 44507667 ~ 44543639 (-) False XLOC_018366
TCONS_00036140 mRNA upstream 160219 44509276 ~ 44557037 (-) True XLOC_018366
TCONS_00036141 mRNA upstream 217882 44566939 ~ 44576949 (-) False XLOC_018367
TCONS_00036099 other downstream 1265875 43082949 ~ 43083067 (-) True XLOC_018342
TCONS_00036096 other downstream 1269461 43016437 ~ 43079481 (-) False XLOC_018341
TCONS_00036093 other downstream 1381554 42967274 ~ 42967388 (-) True XLOC_018339
TCONS_00036086 other downstream 1943730 42405098 ~ 42405212 (-) True XLOC_018330
TCONS_00036072 other downstream 2995982 41352846 ~ 41352960 (-) True XLOC_018324
TCONS_00036148 other upstream 563156 44912213 ~ 44912331 (-) True XLOC_018369
TCONS_00036178 other upstream 1834130 46183187 ~ 46249185 (-) True XLOC_018394
TCONS_00036182 other upstream 2101421 46450478 ~ 46457256 (-) True XLOC_018396
TCONS_00036189 other upstream 2387625 46736682 ~ 46738314 (-) False XLOC_018401
TCONS_00036196 other upstream 2534303 46883360 ~ 46883487 (-) True XLOC_018405