RNA id: TCONS_00036233


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00036233
length 108
RNA type snRNA
GC content 0.34
exon number 1
gene id XLOC_018434
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 48607137 ~ 48607244 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACTGATGTTTCTCTTCATATAAAtatttcgccttttactaaagatctCAGTGTAGAGGAACACTATGATTACTGACTATTTTTTGATGTCCTGCTTCACTGTAGGATG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120797

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036232 lncRNA downstream 3010 48602238 ~ 48604127 (-) True XLOC_018433
TCONS_00036987 lncRNA downstream 494775 48110532 ~ 48112362 (-) True XLOC_018427
TCONS_00036986 lncRNA downstream 753698 47829454 ~ 47853439 (-) True XLOC_018422
TCONS_00036985 lncRNA downstream 1120170 47480436 ~ 47486967 (-) False XLOC_018418
TCONS_00036984 lncRNA downstream 1120170 47480436 ~ 47486967 (-) True XLOC_018418
TCONS_00036237 lncRNA upstream 131643 48738887 ~ 48788681 (-) True XLOC_018436
TCONS_00036516 lncRNA upstream 193525 48800769 ~ 48802522 (-) True XLOC_018437
TCONS_00036988 lncRNA upstream 351362 48958606 ~ 48979359 (-) True XLOC_018439
TCONS_00036989 lncRNA upstream 889196 49496440 ~ 49533803 (-) False XLOC_018443
TCONS_00036990 lncRNA upstream 964695 49571939 ~ 49605188 (-) False XLOC_018443
TCONS_00036228 mRNA downstream 2484 48588679 ~ 48604653 (-) False XLOC_018433
TCONS_00036230 mRNA downstream 2516 48588704 ~ 48604621 (-) False XLOC_018433
TCONS_00036229 mRNA downstream 2888 48588684 ~ 48604249 (-) False XLOC_018433
TCONS_00036231 mRNA downstream 2938 48598414 ~ 48604199 (-) False XLOC_018433
TCONS_00036227 mRNA downstream 90372 48488954 ~ 48516765 (-) True XLOC_018432
TCONS_00036235 mRNA upstream 86812 48694056 ~ 48700370 (-) False XLOC_018435
TCONS_00036234 mRNA upstream 86812 48694056 ~ 48700370 (-) False XLOC_018435
TCONS_00036236 mRNA upstream 87938 48695182 ~ 48701593 (-) True XLOC_018435
TCONS_00036238 mRNA upstream 203657 48810901 ~ 48898560 (-) False XLOC_018438
TCONS_00036240 mRNA upstream 253424 48860668 ~ 48877458 (-) False XLOC_018438
TCONS_00036200 other downstream 1529044 47077979 ~ 47078093 (-) True XLOC_018409
TCONS_00036196 other downstream 1723650 46883360 ~ 46883487 (-) True XLOC_018405
TCONS_00036189 other downstream 1868823 46736682 ~ 46738314 (-) False XLOC_018401
TCONS_00036182 other downstream 2149881 46450478 ~ 46457256 (-) True XLOC_018396
TCONS_00036178 other downstream 2357952 46183187 ~ 46249185 (-) True XLOC_018394
TCONS_00036239 other upstream 204051 48811295 ~ 48898458 (-) False XLOC_018438
TCONS_00036251 other upstream 1205900 49813144 ~ 49813254 (-) True XLOC_018446
TCONS_00036257 other upstream 1744295 50351539 ~ 50351653 (-) True XLOC_018454
TCONS_00036258 other upstream 1753815 50361059 ~ 50361175 (-) True XLOC_018455
TCONS_00036263 other upstream 2571067 51178311 ~ 51186565 (-) True XLOC_018458