RNA id: TCONS_00043352



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043352
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_021877
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 36491114 ~ 36491234 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGCCGCAGTCATATCacactgcagcccaagactggttactcactgaagctaagcacggctgagcctggtcagtaccttgaTGGtaaccacatgggaaaactacaGTAGGttactgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117441

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044683 lncRNA upstream 19279 36460041 ~ 36471835 (+) False XLOC_021876
TCONS_00044682 lncRNA upstream 24671 36458347 ~ 36466443 (+) False XLOC_021876
TCONS_00044874 lncRNA upstream 70836 36418119 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00043349 lncRNA upstream 70836 36418138 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00044875 lncRNA upstream 70836 36418149 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00044684 lncRNA downstream 93945 36585179 ~ 36585751 (+) True XLOC_021878
TCONS_00044876 lncRNA downstream 351398 36842632 ~ 36845980 (+) True XLOC_021885
TCONS_00043359 lncRNA downstream 400495 36891729 ~ 36895369 (+) True XLOC_021886
TCONS_00044877 lncRNA downstream 535116 37026350 ~ 37038409 (+) True XLOC_021887
TCONS_00044685 lncRNA downstream 622053 37113287 ~ 37118114 (+) True XLOC_021889
TCONS_00043351 mRNA upstream 2485 36460239 ~ 36488629 (+) True XLOC_021876
TCONS_00043348 mRNA upstream 137008 36340520 ~ 36354106 (+) True XLOC_021873
TCONS_00043346 mRNA upstream 180699 36308428 ~ 36310415 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043344 mRNA upstream 181497 36306539 ~ 36309617 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043347 mRNA upstream 181545 36308717 ~ 36309569 (+) True XLOC_021870
TCONS_00043353 mRNA downstream 110750 36601984 ~ 36605837 (+) True XLOC_021879
TCONS_00043354 mRNA downstream 125483 36616717 ~ 36645135 (+) True XLOC_021880
TCONS_00043355 mRNA downstream 162142 36653376 ~ 36655640 (+) True XLOC_021881
TCONS_00043356 mRNA downstream 239479 36730713 ~ 36750301 (+) True XLOC_021882
TCONS_00043357 mRNA downstream 280359 36771593 ~ 36798620 (+) True XLOC_021883
TCONS_00043345 other upstream 180696 36307661 ~ 36310418 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043339 other upstream 361022 36130001 ~ 36130092 (+) True XLOC_021866
TCONS_00043331 other upstream 402918 36088091 ~ 36088196 (+) True XLOC_021861
TCONS_00043305 other upstream 1021255 35426577 ~ 35469859 (+) False XLOC_021842
TCONS_00043302 other upstream 1030105 35402697 ~ 35461009 (+) False XLOC_021842
TCONS_00043358 other downstream 298989 36790223 ~ 36790332 (+) True XLOC_021884
TCONS_00043361 other downstream 594931 37086165 ~ 37093123 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043368 other downstream 947600 37438834 ~ 37438950 (+) True XLOC_021894
TCONS_00043373 other downstream 1001501 37492735 ~ 37492851 (+) True XLOC_021899
TCONS_00043375 other downstream 1247629 37738863 ~ 37798412 (+) False XLOC_021904