RNA id: TCONS_00043368



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043368
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_021894
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 37438834 ~ 37438950 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tGTCACTTCCATATCACTCTGCTGCCCacgaccggttactcactgaagctaaacagggctgagcctggttagtacctggatgggagaccacatgagaagaCTAGGTTGCTGTTCAAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174698

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00043364 lncRNA upstream 5605 37227206 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044880 lncRNA upstream 5605 37227218 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044881 lncRNA upstream 5605 37227224 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044882 lncRNA upstream 5605 37227593 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044886 lncRNA upstream 5605 37293522 ~ 37433229 (+) False XLOC_021891
TCONS_00044687 lncRNA downstream 25421 37464371 ~ 37464746 (+) True XLOC_021896
TCONS_00044889 lncRNA downstream 85940 37524890 ~ 37546006 (+) True XLOC_021900
TCONS_00044890 lncRNA downstream 140161 37579111 ~ 37582640 (+) False XLOC_021901
TCONS_00044688 lncRNA downstream 140165 37579115 ~ 37610542 (+) True XLOC_021901
TCONS_00044891 lncRNA downstream 221728 37660678 ~ 37661442 (+) True XLOC_021902
TCONS_00043365 mRNA upstream 112873 37323962 ~ 37325961 (+) True XLOC_021893
TCONS_00043363 mRNA upstream 239944 37185247 ~ 37198890 (+) True XLOC_021890
TCONS_00043362 mRNA upstream 344629 37090889 ~ 37094205 (+) True XLOC_021888
TCONS_00043360 mRNA upstream 348653 37086159 ~ 37090181 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043357 mRNA upstream 640214 36771593 ~ 36798620 (+) True XLOC_021883
TCONS_00043369 mRNA downstream 5983 37444933 ~ 37453984 (+) True XLOC_021895
TCONS_00043370 mRNA downstream 19652 37458602 ~ 37466323 (+) False XLOC_021896
TCONS_00043371 mRNA downstream 28017 37466967 ~ 37480785 (+) True XLOC_021897
TCONS_00043372 mRNA downstream 43777 37482727 ~ 37490249 (+) True XLOC_021898
TCONS_00043374 mRNA downstream 140157 37579107 ~ 37720166 (+) False XLOC_021901
TCONS_00043361 other upstream 345711 37086165 ~ 37093123 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043358 other upstream 648502 36790223 ~ 36790332 (+) True XLOC_021884
TCONS_00043352 other upstream 947600 36491114 ~ 36491234 (+) True XLOC_021877
TCONS_00043345 other upstream 1128416 36307661 ~ 36310418 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043339 other upstream 1308742 36130001 ~ 36130092 (+) True XLOC_021866
TCONS_00043373 other downstream 53785 37492735 ~ 37492851 (+) True XLOC_021899
TCONS_00043375 other downstream 299913 37738863 ~ 37798412 (+) False XLOC_021904
TCONS_00043376 other downstream 311384 37750334 ~ 37768156 (+) True XLOC_021904
TCONS_00043378 other downstream 412880 37851830 ~ 37854622 (+) True XLOC_021906
TCONS_00043382 other downstream 653055 38092005 ~ 38094560 (+) False XLOC_021909