RNA id: TCONS_00046336



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00046336
length 186
RNA type mRNA
GC content 0.28
exon number 7
gene id XLOC_023425
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 21603588 ~ 21637183 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgtcatcatggcaaagataaaagCATATAtaatgtgacacagatcggatatggcccatTGATGAACAAGGAAATATTGAGCAATGCTTTATCAATTCAATTTAATATCAgaattgaaaGCTTCAGACATTCAAAAACTCACAAAACTTTTGTAGAAAGGGTAAAATttaattataaaagaaaaatt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189379

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046855 lncRNA downstream 233834 21331016 ~ 21369754 (-) False XLOC_023421
TCONS_00046322 lncRNA downstream 234008 21368211 ~ 21369580 (-) True XLOC_023421
TCONS_00047176 lncRNA downstream 372417 21226533 ~ 21231171 (-) False XLOC_023420
TCONS_00046320 lncRNA downstream 372417 21228869 ~ 21231171 (-) True XLOC_023420
TCONS_00046319 lncRNA downstream 374635 21226533 ~ 21228953 (-) False XLOC_023420
TCONS_00047177 lncRNA upstream 416626 22053809 ~ 22066831 (-) True XLOC_023442
TCONS_00046366 lncRNA upstream 434038 22071221 ~ 22074272 (-) False XLOC_023443
TCONS_00046367 lncRNA upstream 434038 22071221 ~ 22077479 (-) False XLOC_023443
TCONS_00046370 lncRNA upstream 486703 22123886 ~ 22149868 (-) False XLOC_023444
TCONS_00046373 lncRNA upstream 1053800 22690983 ~ 22701598 (-) False XLOC_023444
TCONS_00046333 mRNA downstream 14674 21584074 ~ 21588914 (-) False XLOC_023423
TCONS_00046334 mRNA downstream 16253 21586310 ~ 21587335 (-) True XLOC_023423
TCONS_00046329 mRNA downstream 91163 21372393 ~ 21512425 (-) False XLOC_023422
TCONS_00046338 mRNA upstream 9134 21646317 ~ 21674996 (-) False XLOC_023426
TCONS_00046339 mRNA upstream 9136 21646319 ~ 21674950 (-) True XLOC_023426
TCONS_00046340 mRNA upstream 50093 21687276 ~ 21689146 (-) True XLOC_023427
TCONS_00046341 mRNA upstream 54756 21691939 ~ 21713883 (-) True XLOC_023428
TCONS_00046342 mRNA upstream 113627 21750810 ~ 21808816 (-) False XLOC_023429
TCONS_00046316 other downstream 459288 21139322 ~ 21144300 (-) True XLOC_023418
TCONS_00046297 other downstream 944920 20647475 ~ 20658668 (-) False XLOC_023409
TCONS_00046286 other downstream 1072002 20450027 ~ 20531586 (-) False XLOC_023407
TCONS_00046292 other downstream 1132498 20470954 ~ 20471090 (-) True XLOC_023407
TCONS_00046277 other downstream 1416158 20187316 ~ 20187430 (-) True XLOC_023401
TCONS_00046357 other upstream 325869 21963052 ~ 21963168 (-) True XLOC_023437
TCONS_00046358 other upstream 326867 21964050 ~ 21968116 (-) False XLOC_023436
TCONS_00046365 other upstream 434038 22071221 ~ 22097763 (-) True XLOC_023443
TCONS_00046371 other upstream 671761 22308944 ~ 22309058 (-) True XLOC_023445
TCONS_00046372 other upstream 734803 22371986 ~ 22372100 (-) True XLOC_023446