RNA id: TCONS_00046371



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00046371
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_023445
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 22308944 ~ 22309058 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AAAAAAGACCATATCACCaagcagcccaagaccggttactcactgaggctaagcagggctgagcctggtcagtgcctggataggagaccacttgggaaaaccaaggttgctgttg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116952

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046370 lncRNA downstream 159076 22123886 ~ 22149868 (-) False XLOC_023444
TCONS_00046367 lncRNA downstream 231465 22071221 ~ 22077479 (-) False XLOC_023443
TCONS_00046366 lncRNA downstream 234672 22071221 ~ 22074272 (-) False XLOC_023443
TCONS_00047177 lncRNA downstream 242113 22053809 ~ 22066831 (-) True XLOC_023442
TCONS_00046337 lncRNA downstream 688688 21611602 ~ 21620256 (-) True XLOC_023424
TCONS_00046373 lncRNA upstream 381925 22690983 ~ 22701598 (-) False XLOC_023444
TCONS_00047178 lncRNA upstream 381925 22690983 ~ 22731551 (-) False XLOC_023444
TCONS_00047179 lncRNA upstream 419406 22728464 ~ 22732001 (-) True XLOC_023444
TCONS_00046376 lncRNA upstream 441900 22750958 ~ 22756509 (-) True XLOC_023447
TCONS_00046857 lncRNA upstream 569883 22878941 ~ 22923061 (-) False XLOC_023448
TCONS_00046364 mRNA downstream 205359 22070290 ~ 22103585 (-) False XLOC_023443
TCONS_00046363 mRNA downstream 293193 22014810 ~ 22015751 (-) True XLOC_023441
TCONS_00046362 mRNA downstream 305913 22002090 ~ 22003031 (-) True XLOC_023440
TCONS_00046361 mRNA downstream 317174 21990964 ~ 21991770 (-) True XLOC_023439
TCONS_00046360 mRNA downstream 319538 21978230 ~ 21989406 (-) True XLOC_023438
TCONS_00046374 mRNA upstream 431485 22740543 ~ 22756508 (-) False XLOC_023447
TCONS_00046375 mRNA upstream 432475 22741533 ~ 22756566 (-) False XLOC_023447
TCONS_00046384 mRNA upstream 932386 23241444 ~ 23323526 (-) False XLOC_023449
TCONS_00046383 mRNA upstream 932386 23241444 ~ 23323526 (-) False XLOC_023449
TCONS_00046385 mRNA upstream 933256 23242314 ~ 23320223 (-) True XLOC_023449
TCONS_00046365 other downstream 211181 22071221 ~ 22097763 (-) True XLOC_023443
TCONS_00046358 other downstream 340828 21964050 ~ 21968116 (-) False XLOC_023436
TCONS_00046357 other downstream 345776 21963052 ~ 21963168 (-) True XLOC_023437
TCONS_00046316 other downstream 1164644 21139322 ~ 21144300 (-) True XLOC_023418
TCONS_00046297 other downstream 1650276 20647475 ~ 20658668 (-) False XLOC_023409
TCONS_00046372 other upstream 62928 22371986 ~ 22372100 (-) True XLOC_023446
TCONS_00046386 other upstream 964184 23273242 ~ 23273359 (-) True XLOC_023450
TCONS_00046400 other upstream 1661998 23971056 ~ 23977285 (-) False XLOC_023458
TCONS_00046409 other upstream 1793663 24102721 ~ 24118395 (-) False XLOC_023462
TCONS_00046414 other upstream 1826844 24135902 ~ 24163110 (-) False XLOC_023462