RNA id: TU2442908


Basic Information

Item Value
RNA id TU2442908
length 904
RNA type TUCP
GC content 0.57
exon number 2
gene id G2136189
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 39943153 ~ 39945834 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome
species rainbow trout
(Oncorhynchus mykiss)

Sequence

gtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttgatgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttgatgatgggatgtggggtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggtccttgatgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtgggggtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttgatgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttgatgatgggatgtggggtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggtccttgatgatgggatgtggggtccttggtgatgggatgtggggtcattgatgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtgggggtccttgatgatgggatgtgggggtccttgatgatgggatgtggggtccttggtgatgggatgtggggtccttgatgatgggatgtggggagtccttgatgatgggatgtggggtccttgatgatgggatgtggggtccttgatgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggtccttgatgatgggaTGGGACgagtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtggggtccttgatgatgggaTGGGACgagtccttggtgatgggatgtggggagtccttggtgatgggatgtgg

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU2442814 lncRNA downstream 21376 39758853 ~ 39921777 (-) False G2136122
TU2442813 lncRNA downstream 21376 39918226 ~ 39921777 (-) True G2136122
TU2442889 lncRNA downstream 74266 39867458 ~ 39868887 (-) True G2136172
TU2442887 lncRNA downstream 77749 39861263 ~ 39865404 (-) True G2136170
TU2442888 lncRNA downstream 79603 39862937 ~ 39863550 (-) True G2136171
TU2442917 lncRNA upstream 7525 39953359 ~ 39956704 (-) False G2136195
TU2442922 lncRNA upstream 7525 39953359 ~ 39956704 (-) False G2136195
TU2442923 lncRNA upstream 7525 39953359 ~ 39957388 (-) False G2136195
TU2442924 lncRNA upstream 7525 39953359 ~ 39956704 (-) False G2136195
TU2442925 lncRNA upstream 7525 39953359 ~ 39956704 (-) False G2136195
XM_036966460.1 mRNA downstream 73217 39843311 ~ 39869936 (-) True ndufv2
XM_036966458.1 mRNA downstream 113946 39778552 ~ 39829207 (-) False LOC110509145
XM_036966455.1 mRNA downstream 113947 39778552 ~ 39829206 (-) False LOC110509145
XM_036966457.1 mRNA downstream 113947 39778552 ~ 39829206 (-) False LOC110509145
XM_036966459.1 mRNA downstream 113947 39778552 ~ 39829206 (-) False LOC110509145
XM_036966544.1 mRNA upstream 27533 39973367 ~ 40103148 (-) False LOC110508256
XM_036966545.1 mRNA upstream 29680 39975514 ~ 40103148 (-) False LOC110508256
XM_036966923.1 mRNA upstream 169567 40115401 ~ 40127201 (-) True LOC110509140
XM_036966347.1 mRNA upstream 222577 40168411 ~ 40317511 (-) False LOC110508253
XM_036966056.1 mRNA upstream 506482 40452316 ~ 40563499 (-) False LOC110508251
TU2442821 other downstream 113974 39803795 ~ 39829179 (-) True LOC110509145
TU2442402 other downstream 937103 39005461 ~ 39006050 (-) True G2135837
TU2441345 other downstream 1416233 38519571 ~ 38526920 (-) True G2135034
TU2440825 other downstream 1812746 38128129 ~ 38130407 (-) True G2134625
TU2440638 other downstream 2003310 37766718 ~ 37939843 (-) True LOC110509127
TU2442946 other upstream 44729 39990563 ~ 39997046 (-) True LOC110508256
TU2442992 other upstream 105805 40051639 ~ 40121899 (-) True G2136243
TU2444084 other upstream 469469 40415303 ~ 40415540 (-) True G2137086
TU2444112 other upstream 526254 40472088 ~ 40475701 (-) False G2137111
TU2444111 other upstream 526421 40472255 ~ 40475701 (-) False G2137111

Expression Profile