RNA id: TCONS_00005634


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00005634
length 1276
RNA type mRNA
GC content 0.35
exon number 1
gene id XLOC_003074
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 44239844 ~ 44241119 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

atactcaggtaggctgtggcgttgatgctcaattggtactaatgaacccaaagaaaatctcccccacatcattacaccaccacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtatctatctatctgtctatctatctatctatctgtctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctatctctctatctgtctatctctctatttgtctatctatctatctgtctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgttcgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgttcgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctatctgtctatctctctatctgtctatctctctatttgtctatctatctatctatctgtctatctatctatctatctgtctgtctgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctatctctctatctgtctgtctatctgtctatctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcatctatctatctgtctatctgtttgtctatctgtttgcctgcctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctatctgtctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatccatccaaccatctg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000164480

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00005608 lncRNA downstream 699660 43499529 ~ 43540184 (-) True XLOC_003062
TCONS_00006132 lncRNA downstream 699676 43453171 ~ 43540168 (-) False XLOC_003062
TCONS_00006134 lncRNA downstream 699800 43499529 ~ 43540044 (-) False XLOC_003062
TCONS_00006133 lncRNA downstream 743628 43484627 ~ 43496216 (-) True XLOC_003063
TCONS_00006131 lncRNA downstream 1369881 42819956 ~ 42869963 (-) True XLOC_003053
TCONS_00005635 lncRNA upstream 1117 44242236 ~ 44253104 (-) True XLOC_003075
TCONS_00005636 lncRNA upstream 27362 44268481 ~ 44275885 (-) True XLOC_003076
TCONS_00006135 lncRNA upstream 139799 44380918 ~ 44387802 (-) True XLOC_003080
TCONS_00005646 lncRNA upstream 252800 44493919 ~ 44501719 (-) False XLOC_003084
TCONS_00005645 lncRNA upstream 252800 44493919 ~ 44501719 (-) True XLOC_003084
TCONS_00005633 mRNA downstream 212453 44021224 ~ 44027391 (-) True XLOC_003073
TCONS_00005632 mRNA downstream 213475 44021147 ~ 44026369 (-) False XLOC_003073
TCONS_00005627 mRNA downstream 222192 43999263 ~ 44017652 (-) False XLOC_003072
TCONS_00005630 mRNA downstream 222202 44008288 ~ 44017642 (-) False XLOC_003072
TCONS_00005628 mRNA downstream 231603 43999266 ~ 44008241 (-) False XLOC_003072
TCONS_00005637 mRNA upstream 55744 44296863 ~ 44341288 (-) True XLOC_003077
TCONS_00005638 mRNA upstream 61101 44302220 ~ 44305180 (-) False XLOC_003078
TCONS_00005639 mRNA upstream 61101 44302220 ~ 44306399 (-) False XLOC_003078
TCONS_00005640 mRNA upstream 61101 44302220 ~ 44306636 (-) True XLOC_003078
TCONS_00005641 mRNA upstream 68878 44309997 ~ 44355534 (-) True XLOC_003079
TCONS_00005629 other downstream 222179 44008209 ~ 44017665 (-) False XLOC_003072
TCONS_00005631 other downstream 224105 44009952 ~ 44015739 (-) True XLOC_003072
TCONS_00005619 other downstream 407176 43831882 ~ 43832668 (-) True XLOC_003068
TCONS_00005616 other downstream 480312 43718760 ~ 43759532 (-) False XLOC_003066
TCONS_00005617 other downstream 480365 43735286 ~ 43759479 (-) True XLOC_003066

Expression Profile

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