RNA id: TCONS_00062775



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062775
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_032115
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 30787928 ~ 30788044 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tggcacagccatatcaccctgcagccaaaGACCGCTTACTCACTGAACCTAAGCAGAGCTGAGCCTAGTCTGTaccaggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttgtaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193408

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062762 lncRNA upstream 715684 30048270 ~ 30072244 (+) False XLOC_032106
TCONS_00062761 lncRNA upstream 770417 29964639 ~ 30017511 (+) False XLOC_032106
TCONS_00064859 lncRNA upstream 937667 29846495 ~ 29850261 (+) False XLOC_032105
TCONS_00064861 lncRNA downstream 491287 31279331 ~ 31284128 (+) True XLOC_032116
TCONS_00064862 lncRNA downstream 574304 31362348 ~ 31365216 (+) True XLOC_032117
TCONS_00064863 lncRNA downstream 643083 31431127 ~ 31435669 (+) True XLOC_032120
TCONS_00064864 lncRNA downstream 970354 31758398 ~ 31780483 (+) False XLOC_032121
TCONS_00064865 lncRNA downstream 977586 31765630 ~ 31780483 (+) False XLOC_032121
TCONS_00062774 mRNA upstream 79805 30703828 ~ 30708123 (+) True XLOC_032114
TCONS_00062773 mRNA upstream 86721 30689239 ~ 30701207 (+) True XLOC_032113
TCONS_00062772 mRNA upstream 111854 30668098 ~ 30676074 (+) True XLOC_032112
TCONS_00062770 mRNA upstream 194981 30491129 ~ 30592947 (+) False XLOC_032111
TCONS_00062771 mRNA upstream 194981 30533504 ~ 30592947 (+) True XLOC_032111
TCONS_00062777 mRNA downstream 580027 31368071 ~ 31429161 (+) False XLOC_032119
TCONS_00062780 mRNA downstream 1258158 32046202 ~ 32059110 (+) True XLOC_032123
TCONS_00062783 mRNA downstream 1538030 32326074 ~ 32404633 (+) False XLOC_032127
TCONS_00062784 mRNA downstream 1538141 32326185 ~ 32340231 (+) False XLOC_032127
TCONS_00062786 mRNA downstream 1550290 32338334 ~ 32357279 (+) False XLOC_032127
TCONS_00062767 other upstream 666059 30120081 ~ 30121869 (+) True XLOC_032108
TCONS_00062766 other upstream 672517 30113769 ~ 30115411 (+) False XLOC_032108
TCONS_00062763 other upstream 715684 30070570 ~ 30072244 (+) True XLOC_032106
TCONS_00062752 other upstream 993689 29754141 ~ 29794239 (+) False XLOC_032102
TCONS_00062747 other upstream 1317823 29469991 ~ 29470105 (+) True XLOC_032099
TCONS_00062776 other downstream 577402 31365446 ~ 31365526 (+) True XLOC_032118
TCONS_00062778 other downstream 625869 31413913 ~ 31417621 (+) True XLOC_032119
TCONS_00062785 other downstream 1548257 32336301 ~ 32337054 (+) False XLOC_032127
TCONS_00062789 other downstream 1605013 32393057 ~ 32403099 (+) False XLOC_032127
TCONS_00062791 other downstream 1622804 32410848 ~ 32415854 (+) False XLOC_032128