RNA id: TCONS_00062883


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062883
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_032184
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 38087495 ~ 38087611 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccATAGCCACATTACCCTACAGCTCAAGACTGGTtattcactgaagctaagcagggctgactctggtcagtacctggatgggaaaccacatgggaaaactaggttgatGTTGAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181562

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062878 lncRNA upstream 361570 37725309 ~ 37725925 (+) True XLOC_032181
TCONS_00064904 lncRNA upstream 611394 37470116 ~ 37476101 (+) False XLOC_032178
TCONS_00062868 lncRNA upstream 611394 37474977 ~ 37476101 (+) True XLOC_032178
TCONS_00064903 lncRNA upstream 771586 37314337 ~ 37315909 (+) True XLOC_032175
TCONS_00062864 lncRNA upstream 780724 37305338 ~ 37306771 (+) True XLOC_032173
TCONS_00064905 lncRNA downstream 271070 38358681 ~ 38360443 (+) True XLOC_032185
TCONS_00062888 lncRNA downstream 430608 38518219 ~ 38590172 (+) True XLOC_032188
TCONS_00062900 lncRNA downstream 792831 38880442 ~ 38885538 (+) True XLOC_032192
TCONS_00064906 lncRNA downstream 865870 38953481 ~ 38955126 (+) True XLOC_032194
TCONS_00062917 lncRNA downstream 1282724 39370335 ~ 39378734 (+) False XLOC_032204
TCONS_00062881 mRNA upstream 32644 37894220 ~ 38054851 (+) False XLOC_032183
TCONS_00062882 mRNA upstream 32644 37894914 ~ 38054851 (+) True XLOC_032183
TCONS_00062880 mRNA upstream 239620 37754763 ~ 37847875 (+) True XLOC_032182
TCONS_00062879 mRNA upstream 305527 37752781 ~ 37781968 (+) False XLOC_032182
TCONS_00062876 mRNA upstream 356588 37655078 ~ 37730907 (+) False XLOC_032181
TCONS_00062885 mRNA downstream 294346 38381957 ~ 38513525 (+) False XLOC_032187
TCONS_00062886 mRNA downstream 339746 38427357 ~ 38476961 (+) False XLOC_032187
TCONS_00062887 mRNA downstream 339959 38427570 ~ 38513578 (+) True XLOC_032187
TCONS_00062889 mRNA downstream 539073 38626684 ~ 38726402 (+) False XLOC_032189
TCONS_00062890 mRNA downstream 539315 38626926 ~ 38730530 (+) True XLOC_032189
TCONS_00062877 other upstream 370385 37715272 ~ 37717110 (+) False XLOC_032181
TCONS_00062866 other upstream 752532 37334559 ~ 37334963 (+) True XLOC_032176
TCONS_00062862 other upstream 871307 37193908 ~ 37216188 (+) True XLOC_032172
TCONS_00062861 other upstream 1096811 36990570 ~ 36990684 (+) True XLOC_032171
TCONS_00062849 other upstream 1545393 36472721 ~ 36542102 (+) True XLOC_032162
TCONS_00062884 other downstream 289480 38377091 ~ 38377211 (+) True XLOC_032186
TCONS_00062893 other downstream 685807 38773418 ~ 38782158 (+) True XLOC_032190
TCONS_00062894 other downstream 758065 38845676 ~ 38858302 (+) False XLOC_032191
TCONS_00062919 other downstream 1283009 39370620 ~ 39371875 (+) True XLOC_032204
TCONS_00062936 other downstream 1956004 40043615 ~ 40049445 (+) True XLOC_032217