RNA id: TCONS_00006310



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006310
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_003199
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 6327978 ~ 6328093 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACCACAGCCGTattaccctgcagcccaagactggttattcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatatgAACACTAGGTTGCTGATGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177691

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006309 lncRNA upstream 3676 6322998 ~ 6324302 (+) True XLOC_003198
TCONS_00006303 lncRNA upstream 103858 6205969 ~ 6224120 (+) False XLOC_003195
TCONS_00008385 lncRNA upstream 103936 6214094 ~ 6224042 (+) True XLOC_003195
TCONS_00008531 lncRNA upstream 104679 6213943 ~ 6223299 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006304 lncRNA upstream 107041 6206357 ~ 6220937 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006314 lncRNA downstream 115364 6443457 ~ 6444163 (+) True XLOC_003203
TCONS_00006316 lncRNA downstream 128055 6456148 ~ 6457303 (+) False XLOC_003204
TCONS_00006317 lncRNA downstream 128067 6456160 ~ 6457261 (+) False XLOC_003204
TCONS_00006318 lncRNA downstream 128078 6456171 ~ 6457195 (+) True XLOC_003204
TCONS_00008532 lncRNA downstream 132531 6460624 ~ 6513018 (+) False XLOC_003205
TCONS_00006308 mRNA upstream 11260 6295370 ~ 6316718 (+) True XLOC_003197
TCONS_00006307 mRNA upstream 34269 6281647 ~ 6293709 (+) True XLOC_003196
TCONS_00006302 mRNA upstream 122611 6169312 ~ 6205367 (+) True XLOC_003194
TCONS_00006300 mRNA upstream 152921 6152643 ~ 6175057 (+) False XLOC_003193
TCONS_00006301 mRNA upstream 153225 6159595 ~ 6174753 (+) True XLOC_003193
TCONS_00006311 mRNA downstream 46355 6374448 ~ 6378070 (+) True XLOC_003200
TCONS_00006312 mRNA downstream 94281 6422374 ~ 6423160 (+) True XLOC_003201
TCONS_00006313 mRNA downstream 103040 6431133 ~ 6434600 (+) True XLOC_003202
TCONS_00006315 mRNA downstream 128053 6456146 ~ 6457748 (+) False XLOC_003204
TCONS_00006320 mRNA downstream 322873 6650966 ~ 6656271 (+) False XLOC_003207
TCONS_00006305 other upstream 104679 6209170 ~ 6223299 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006306 other upstream 104679 6209911 ~ 6223299 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006299 other upstream 183335 6136321 ~ 6144643 (+) True XLOC_003192
TCONS_00006283 other upstream 290425 6034242 ~ 6037553 (+) True XLOC_003188
TCONS_00006273 other upstream 404237 5880575 ~ 5923741 (+) False XLOC_003185
TCONS_00006329 other downstream 534159 6862252 ~ 6862368 (+) True XLOC_003212
TCONS_00006340 other downstream 821896 7149989 ~ 7150082 (+) False XLOC_003217
TCONS_00006341 other downstream 822181 7150274 ~ 7150366 (+) False XLOC_003217
TCONS_00006342 other downstream 822454 7150547 ~ 7150640 (+) True XLOC_003217
TCONS_00006343 other downstream 822727 7150820 ~ 7150906 (+) True XLOC_003218

Expression Profile


//