RNA id: TCONS_00006329


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00006329
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_003212
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 6862252 ~ 6862368 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccaCAGGCATATCAGCCTGCAGCCCAAGGCCGGTTACTCACTAAAACTAAGCaaagctgagcctggtcagtaattggattggagaccacatgggaaaactaggttactGTTGTAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178467

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008386 lncRNA upstream 46247 6808096 ~ 6816005 (+) True XLOC_003210
TCONS_00006322 lncRNA upstream 184043 6658656 ~ 6678209 (+) True XLOC_003208
TCONS_00006321 lncRNA upstream 208629 6651134 ~ 6653623 (+) True XLOC_003207
TCONS_00008533 lncRNA upstream 219765 6636422 ~ 6642487 (+) True XLOC_003206
TCONS_00008532 lncRNA upstream 349234 6460624 ~ 6513018 (+) False XLOC_003205
TCONS_00006335 lncRNA downstream 84223 6946591 ~ 6953380 (+) False XLOC_003215
TCONS_00006336 lncRNA downstream 84429 6946797 ~ 6956379 (+) True XLOC_003215
TCONS_00006337 lncRNA downstream 232808 7095176 ~ 7103536 (+) True XLOC_003216
TCONS_00006338 lncRNA downstream 286703 7149071 ~ 7152007 (+) False XLOC_003217
TCONS_00008534 lncRNA downstream 286820 7149188 ~ 7152007 (+) False XLOC_003217
TCONS_00006328 mRNA upstream 11659 6819050 ~ 6850593 (+) True XLOC_003211
TCONS_00006326 mRNA upstream 68108 6752468 ~ 6794144 (+) False XLOC_003209
TCONS_00006323 mRNA upstream 68877 6684968 ~ 6793375 (+) False XLOC_003209
TCONS_00006327 mRNA upstream 68877 6764207 ~ 6793375 (+) True XLOC_003209
TCONS_00006324 mRNA upstream 69360 6739433 ~ 6792892 (+) False XLOC_003209
TCONS_00006330 mRNA downstream 18633 6881001 ~ 6889563 (+) False XLOC_003213
TCONS_00006331 mRNA downstream 19681 6882049 ~ 6895981 (+) False XLOC_003213
TCONS_00006332 mRNA downstream 19994 6882362 ~ 6891090 (+) True XLOC_003213
TCONS_00006333 mRNA downstream 39938 6902306 ~ 6934585 (+) False XLOC_003214
TCONS_00006334 mRNA downstream 40578 6902946 ~ 6958042 (+) True XLOC_003214
TCONS_00006310 other upstream 534159 6327978 ~ 6328093 (+) True XLOC_003199
TCONS_00006305 other upstream 638953 6209170 ~ 6223299 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006306 other upstream 638953 6209911 ~ 6223299 (+) False XLOC_003195
TCONS_00006299 other upstream 717609 6136321 ~ 6144643 (+) True XLOC_003192
TCONS_00006283 other upstream 824699 6034242 ~ 6037553 (+) True XLOC_003188
TCONS_00006340 other downstream 287621 7149989 ~ 7150082 (+) False XLOC_003217
TCONS_00006341 other downstream 287906 7150274 ~ 7150366 (+) False XLOC_003217
TCONS_00006342 other downstream 288179 7150547 ~ 7150640 (+) True XLOC_003217
TCONS_00006343 other downstream 288452 7150820 ~ 7150906 (+) True XLOC_003218
TCONS_00006353 other downstream 399636 7262004 ~ 7274378 (+) False XLOC_003222