RNA id: TCONS_00064020


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064020
length 102
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_032955
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 33726047 ~ 33726148 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCTCTGCAATattcacatggtcacccactgaagctaagcagggctgtgcccggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117950

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065183 lncRNA downstream 515659 33190582 ~ 33210388 (-) True XLOC_032952
TCONS_00065182 lncRNA downstream 596784 33118841 ~ 33129263 (-) True XLOC_032951
TCONS_00064010 lncRNA downstream 756433 32967396 ~ 32969614 (-) False XLOC_032949
TCONS_00064008 lncRNA downstream 894397 32829516 ~ 32831650 (-) True XLOC_032948
TCONS_00064748 lncRNA downstream 1038661 32687002 ~ 32687386 (-) True XLOC_032946
TCONS_00064028 lncRNA upstream 186728 33912876 ~ 33915570 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064029 lncRNA upstream 186728 33912876 ~ 33916720 (-) False XLOC_032957
TCONS_00065184 lncRNA upstream 186728 33912876 ~ 33916722 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064034 lncRNA upstream 192665 33918813 ~ 33921694 (-) False XLOC_032958
TCONS_00065185 lncRNA upstream 257722 33983870 ~ 33984665 (-) True XLOC_032960
TCONS_00064018 mRNA downstream 18769 33674089 ~ 33707278 (-) False XLOC_032954
TCONS_00064017 mRNA downstream 40722 33668573 ~ 33685325 (-) False XLOC_032954
TCONS_00064013 mRNA downstream 596735 33104544 ~ 33129312 (-) False XLOC_032951
TCONS_00064014 mRNA downstream 597002 33105630 ~ 33129045 (-) False XLOC_032951
TCONS_00064012 mRNA downstream 650471 33070766 ~ 33075576 (-) True XLOC_032950
TCONS_00064021 mRNA upstream 148989 33875137 ~ 33878665 (-) False XLOC_032956
TCONS_00064022 mRNA upstream 149144 33875292 ~ 33875919 (-) True XLOC_032956
TCONS_00064024 mRNA upstream 185006 33911154 ~ 33916788 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064025 mRNA upstream 185007 33911155 ~ 33913184 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064027 mRNA upstream 186193 33912341 ~ 33916756 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064019 other downstream 44963 33678377 ~ 33681084 (-) True XLOC_032954
TCONS_00064015 other downstream 282592 33443334 ~ 33443455 (-) True XLOC_032953
TCONS_00064000 other downstream 1320206 32394502 ~ 32405841 (-) False XLOC_032943
TCONS_00063998 other downstream 1411173 32309688 ~ 32314874 (-) True XLOC_032941
TCONS_00063952 other downstream 3523010 30202921 ~ 30203037 (-) True XLOC_032918
TCONS_00064023 other upstream 185006 33911154 ~ 33916702 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064026 other upstream 186041 33912189 ~ 33916660 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064030 other upstream 187039 33913187 ~ 33916714 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064031 other upstream 187218 33913366 ~ 33916722 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064032 other upstream 187647 33913795 ~ 33916713 (-) False XLOC_032957

Expression Profile

//