RNA id: TCONS_00006417



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006417
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.61
exon number 1
gene id XLOC_003250
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 11345803 ~ 11346099 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccgggttcagtggcgcgcgcctgtaatccaagctgctgggaggctgaggctgcggatcgcttgagctcagggcttctggGCTGTAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCGCTAAGTTCGGTATCGATATGGTTCTCCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTCGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAGcaacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190083

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006410 lncRNA upstream 73489 11267906 ~ 11272314 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006406 lncRNA upstream 104859 11239448 ~ 11240944 (+) True XLOC_003247
TCONS_00008390 lncRNA upstream 280011 11065500 ~ 11065792 (+) True XLOC_003244
TCONS_00008552 lncRNA upstream 672795 10669135 ~ 10673008 (+) False XLOC_003241
TCONS_00008553 lncRNA upstream 672795 10669452 ~ 10673008 (+) True XLOC_003241
TCONS_00006420 lncRNA downstream 7360 11353459 ~ 11380887 (+) True XLOC_003252
TCONS_00008391 lncRNA downstream 13322 11359421 ~ 11359715 (+) True XLOC_003253
TCONS_00006441 lncRNA downstream 157915 11504014 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006446 lncRNA downstream 158268 11504367 ~ 11513412 (+) True XLOC_003268
TCONS_00006447 lncRNA downstream 241979 11588078 ~ 11590676 (+) True XLOC_003269
TCONS_00006415 mRNA upstream 25950 11303458 ~ 11319853 (+) False XLOC_003249
TCONS_00006416 mRNA upstream 26628 11303500 ~ 11319175 (+) True XLOC_003249
TCONS_00006414 mRNA upstream 70884 11272490 ~ 11274919 (+) True XLOC_003248
TCONS_00006408 mRNA upstream 70886 11267829 ~ 11274917 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006407 mRNA upstream 71445 11267493 ~ 11274358 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006418 mRNA downstream 932 11347031 ~ 11348705 (+) False XLOC_003251
TCONS_00006419 mRNA downstream 1078 11347177 ~ 11348146 (+) True XLOC_003251
TCONS_00006421 mRNA downstream 14542 11360641 ~ 11362457 (+) False XLOC_003254
TCONS_00006422 mRNA downstream 14700 11360799 ~ 11361768 (+) True XLOC_003254
TCONS_00006424 mRNA downstream 27922 11374021 ~ 11375944 (+) False XLOC_003256
TCONS_00006412 other upstream 71203 11271934 ~ 11274600 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006409 other upstream 71246 11267890 ~ 11274557 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006384 other upstream 1447173 9898513 ~ 9898630 (+) True XLOC_003238
TCONS_00006353 other upstream 4071425 7262004 ~ 7274378 (+) False XLOC_003222
TCONS_00006343 other upstream 4194897 7150820 ~ 7150906 (+) True XLOC_003218
TCONS_00006423 other downstream 26787 11372886 ~ 11373182 (+) True XLOC_003255
TCONS_00006426 other downstream 40263 11386362 ~ 11386658 (+) True XLOC_003257
TCONS_00006431 other downstream 71934 11418033 ~ 11418323 (+) True XLOC_003260
TCONS_00006434 other downstream 83294 11429393 ~ 11429689 (+) True XLOC_003262
TCONS_00006437 other downstream 95361 11441460 ~ 11441756 (+) True XLOC_003264