RNA id: TCONS_00006439



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006439
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_003266
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 11460806 ~ 11461102 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTTCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGTTACTAGGAGGCTGAGTCTGCGGatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGTATTATGTCGATCGGGAGTCCGCACTAAGTTCAGTGTCGATATGGTGCTCCTGAGGGAGCTCAGGATCACCAGGTCGTCTAAAGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGTTCGCACCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189283

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006420 lncRNA upstream 79919 11353459 ~ 11380887 (+) True XLOC_003252
TCONS_00008391 lncRNA upstream 101091 11359421 ~ 11359715 (+) True XLOC_003253
TCONS_00006410 lncRNA upstream 188492 11267906 ~ 11272314 (+) False XLOC_003248
TCONS_00006406 lncRNA upstream 219862 11239448 ~ 11240944 (+) True XLOC_003247
TCONS_00008390 lncRNA upstream 395014 11065500 ~ 11065792 (+) True XLOC_003244
TCONS_00006441 lncRNA downstream 42912 11504014 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006446 lncRNA downstream 43265 11504367 ~ 11513412 (+) True XLOC_003268
TCONS_00006447 lncRNA downstream 126976 11588078 ~ 11590676 (+) True XLOC_003269
TCONS_00006451 lncRNA downstream 316265 11777367 ~ 11780863 (+) True XLOC_003270
TCONS_00006452 lncRNA downstream 331306 11792408 ~ 11796299 (+) True XLOC_003271
TCONS_00006435 mRNA upstream 28327 11430552 ~ 11432479 (+) False XLOC_003263
TCONS_00006436 mRNA upstream 29107 11430725 ~ 11431699 (+) True XLOC_003263
TCONS_00006432 mRNA upstream 39700 11419186 ~ 11421106 (+) False XLOC_003261
TCONS_00006433 mRNA upstream 40481 11419359 ~ 11420325 (+) True XLOC_003261
TCONS_00006429 mRNA upstream 51062 11407892 ~ 11409744 (+) False XLOC_003259
TCONS_00006442 mRNA downstream 42912 11504014 ~ 11513979 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006443 mRNA downstream 42912 11504014 ~ 11513985 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006444 mRNA downstream 42961 11504063 ~ 11513985 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006448 mRNA downstream 258473 11719575 ~ 11781232 (+) False XLOC_003270
TCONS_00006450 mRNA downstream 289904 11751006 ~ 11781911 (+) False XLOC_003270
TCONS_00006438 other upstream 10364 11450155 ~ 11450442 (+) True XLOC_003265
TCONS_00006437 other upstream 19050 11441460 ~ 11441756 (+) True XLOC_003264
TCONS_00006434 other upstream 31117 11429393 ~ 11429689 (+) True XLOC_003262
TCONS_00006431 other upstream 42483 11418033 ~ 11418323 (+) True XLOC_003260
TCONS_00006426 other upstream 74148 11386362 ~ 11386658 (+) True XLOC_003257
TCONS_00006440 other downstream 1204 11462306 ~ 11462602 (+) True XLOC_003267
TCONS_00006445 other downstream 43159 11504261 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006457 other downstream 701650 12162752 ~ 12163048 (+) True XLOC_003281
TCONS_00006459 other downstream 710193 12171295 ~ 12171591 (+) True XLOC_003283
TCONS_00006462 other downstream 726204 12187306 ~ 12187602 (+) True XLOC_003285

Expression Profile


//