RNA id: TCONS_00006457



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006457
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_003281
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12162752 ~ 12163048 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTTCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGCGGATCGCTTGAGCTCAGGGTGTCTGGGCGGCAGTGGACTATGTCGATTGGGTGTCTGCACTAAGTTCGGTATTGATATGGTGCTTCTGGGGGAGCTCGGGACCACCAGGTTGAGTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGACGGAGACGGAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGATCGCGCCTAAGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAGcaacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182669

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008558 lncRNA upstream 259242 11891240 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008557 lncRNA upstream 259242 11891240 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008559 lncRNA upstream 259242 11891550 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008560 lncRNA upstream 259242 11891552 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008561 lncRNA upstream 259242 11891553 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00006458 lncRNA downstream 3438 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008393 lncRNA downstream 303718 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 330824 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 359722 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 555061 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006456 mRNA upstream 70574 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 182898 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 312757 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006453 mRNA upstream 358032 11797026 ~ 11804720 (+) True XLOC_003272
TCONS_00006450 mRNA upstream 380841 11751006 ~ 11781911 (+) False XLOC_003270
TCONS_00006460 mRNA downstream 12114 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA downstream 13279 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006495 mRNA downstream 556896 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 556940 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 557123 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006445 other upstream 649340 11504261 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006440 other upstream 700150 11462306 ~ 11462602 (+) True XLOC_003267
TCONS_00006439 other upstream 701650 11460806 ~ 11461102 (+) True XLOC_003266
TCONS_00006438 other upstream 712310 11450155 ~ 11450442 (+) True XLOC_003265
TCONS_00006437 other upstream 720996 11441460 ~ 11441756 (+) True XLOC_003264
TCONS_00006459 other downstream 8247 12171295 ~ 12171591 (+) True XLOC_003283
TCONS_00006462 other downstream 24258 12187306 ~ 12187602 (+) True XLOC_003285
TCONS_00006463 other downstream 26677 12189725 ~ 12190024 (+) True XLOC_003286
TCONS_00006464 other downstream 45861 12208909 ~ 12209205 (+) True XLOC_003287
TCONS_00006465 other downstream 52280 12215328 ~ 12215628 (+) True XLOC_003288

Expression Profile


//