RNA id: TCONS_00006462



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006462
length 297
RNA type misc_RNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_003285
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12187306 ~ 12187602 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCCGGGTGCAGTGGCGCGCGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGCGAATCGCTTGAGTTCAGGGCTTCTGGGCTGCAGTGGACTATGTTGAGCGGGTGTCCACGCTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTAGGGGAGCTTGGGACCACCAGGTTGTTTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAGACGGAGCAGGTCAAATCCCCCGTGCCAATCAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGACACTGCAGTGCAGCCTGAGcaacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185045

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 20516 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 283796 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 279164 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 306270 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 335168 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 530507 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 557033 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 2763 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 3046 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 95128 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 207452 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 337311 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 532342 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 532386 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 532569 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 532706 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 556973 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006459 other upstream 15715 12171295 ~ 12171591 (+) True XLOC_003283
TCONS_00006457 other upstream 24258 12162752 ~ 12163048 (+) True XLOC_003281
TCONS_00006445 other upstream 673894 11504261 ~ 11513412 (+) False XLOC_003268
TCONS_00006440 other upstream 724704 11462306 ~ 11462602 (+) True XLOC_003267
TCONS_00006439 other upstream 726204 11460806 ~ 11461102 (+) True XLOC_003266
TCONS_00006463 other downstream 2123 12189725 ~ 12190024 (+) True XLOC_003286
TCONS_00006464 other downstream 21307 12208909 ~ 12209205 (+) True XLOC_003287
TCONS_00006465 other downstream 27726 12215328 ~ 12215628 (+) True XLOC_003288
TCONS_00006466 other downstream 35860 12223462 ~ 12223758 (+) True XLOC_003289
TCONS_00006467 other downstream 60086 12247688 ~ 12247984 (+) True XLOC_003290

Expression Profile


//