RNA id: TCONS_00006477



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00006477
length 288
RNA type misc_RNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_003300
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 12431978 ~ 12432265 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTCCGACCAATGTTTACTGGGAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGCGGatcgcttgagctcagggcttctggACTGCAGTGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCCGGGTGAGCTCGGGACCGCCAGGTCGTTTAAGGAGGAGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAGCTCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGATCGTGCCTGTGAATAGACACTTCAGTTCAGCCTGAgcgacacagagagacgcagacttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000126698

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006458 lncRNA upstream 265188 12166486 ~ 12166790 (+) True XLOC_003282
TCONS_00008571 lncRNA upstream 528468 11891591 ~ 11903510 (+) False XLOC_003278
TCONS_00008393 lncRNA downstream 34501 12466766 ~ 12467060 (+) True XLOC_003302
TCONS_00006480 lncRNA downstream 61607 12493872 ~ 12494177 (+) True XLOC_003304
TCONS_00008394 lncRNA downstream 90505 12522770 ~ 12523029 (+) True XLOC_003307
TCONS_00006494 lncRNA downstream 285844 12718109 ~ 12718402 (+) True XLOC_003319
TCONS_00006501 lncRNA downstream 312370 12744635 ~ 12752361 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006460 mRNA upstream 247435 12175162 ~ 12184543 (+) False XLOC_003284
TCONS_00006461 mRNA upstream 247718 12176327 ~ 12184260 (+) True XLOC_003284
TCONS_00006456 mRNA upstream 339800 12052791 ~ 12092178 (+) True XLOC_003280
TCONS_00006455 mRNA upstream 452124 11974708 ~ 11979854 (+) True XLOC_003279
TCONS_00006454 mRNA upstream 581983 11842724 ~ 11849995 (+) True XLOC_003277
TCONS_00006495 mRNA downstream 287679 12719944 ~ 12728353 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006496 mRNA downstream 287723 12719988 ~ 12727230 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006497 mRNA downstream 287906 12720171 ~ 12727529 (+) False XLOC_003320
TCONS_00006498 mRNA downstream 288043 12720308 ~ 12727651 (+) True XLOC_003320
TCONS_00006499 mRNA downstream 312310 12744575 ~ 12770546 (+) False XLOC_003321
TCONS_00006476 other upstream 25963 12405730 ~ 12406015 (+) True XLOC_003299
TCONS_00006475 other upstream 43131 12388547 ~ 12388847 (+) True XLOC_003298
TCONS_00006474 other upstream 58016 12373666 ~ 12373962 (+) True XLOC_003297
TCONS_00006473 other upstream 77848 12353834 ~ 12354130 (+) True XLOC_003296
TCONS_00006472 other upstream 86590 12345092 ~ 12345388 (+) True XLOC_003295
TCONS_00006478 other downstream 8391 12440656 ~ 12440952 (+) True XLOC_003301
TCONS_00006479 other downstream 43177 12475442 ~ 12475702 (+) True XLOC_003303
TCONS_00006481 other downstream 70286 12502551 ~ 12502847 (+) True XLOC_003305
TCONS_00006482 other downstream 84668 12516933 ~ 12517229 (+) True XLOC_003306
TCONS_00006483 other downstream 104019 12536284 ~ 12536580 (+) True XLOC_003308

Expression Profile


//