RNA id: TCONS_00076175


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00076175
length 4347
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 8
gene id XLOC_038710
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_003336847.1
NCBI id KN150679.1
chromosome length 14065
location 255 ~ 12836 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TAATTGATGATCTGGTGGTTATTTGCAGGCATTCGTTCCTGGATGATCATTATGTGGAGTTCAGCAAACTCTCTCAGGACAGAGTCATAGGAACTAAAGAGCACATCGCACATATTTATGACATTCAGACTGGACAGAAGGTGCTGACGCTGAAAAACCCAGATCTGGCCAATAACTACAAGCGCAACTGTGCCACCTTCAACCCGACAGAAGACCTGGTGCTGAACGACGGCGTCATGTGGGACGTGCGCAGCTCGCAGGCCATTCACAAGTTCGACAAGTACAACATGAACATCAGCGGCGTTTTCCATCCCAACAGCCTCGAGGTCATCATCAACACGGAGATCTGGGATCTGAGGACGTTTCATCTTCTTCACACGGTGCCGGCTCTAGATCAGTGCAGGATCGTCTTCAACAACAACGGAACCGTCATTTATGGAGCGATGCTGCAGgctgatgatgaggatgatatGATGGAGCAGCAGATGAAGAGTCCGTTCGGATCCTCCTTCAGGACTTTTGATGCCACCGACTACAAACCCATCGCCACCATTGACGTGAAGAGGAACATTTTTGACCTCTGCACAGACACCAAAGACTGCTATCTGGCTGTCATCGAGAACCAGGACTCGATAAATATGGACACTGTGTGTCGTCTGTATGAAGTGGGTCGACAGAGACTCGCAGAggaggaagaggacgaggaagaTCAGGAGGAAGATGATCAGGATGAAGAGGATGATGATGACTCTGATGATGACATTGACGATATCGACACCGACCCCCTGCTGGCCGAACTGGAGAACGACAACAACGGGGAAGAGGAGGAGGACGGAGAGCAGGATTTCTCTCCGTCTGATGATGAGGAAGTGGCTCGCCTGCTGGATGAAGAGgcggatgatgatgatgatgacgatgatgatgacgacgacgatgatgatgatgaagatgatgatgacgatgatgattcTGATGATAATGAGCAAGATGCGGAGCTGGTGCTGGACAACAcgGACAGCTCTGATAACTCTGACCTGGAGGACGACATCATTCTCTCTCTGAACGAGTGATGACGGAGGAGTgacagatgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgctcttTATGCACACGAACACACAGCAGCTCATATAAAGCAGATGACTCTGCTAGTCTGCTCTCCGGCGGTGTCTGATCACTGTTGAGGAGAAGTGATGGATATGAAGAGAGTCCAACCTTCAACACTGAGCAGGAGTGTGTCAGTCTGTCATTCACGTtcgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggcaccTGGGGTTGCACGCACATGTGTCTATACATATGTGTGGTCATATAGGTGCGTGTGGGTTTGCTTGTGTGAGCGTGCATGTGTGGTCATATGGgcacgtgcatgtgtgtgtgcttgcacaTGTGTACATGCATATGGGTgaatgcatttgtgtgtgcgtgtccaTCCATGCACATGTACATACATGTGTGTGCGTGTCCATGTGCATGTGTCTGTATGTATGCGGTTGTGTGTGCatcattgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgcgtgagtgccAGTGACCCCTGACCTGCCCAGCCAGCGCTCGTCAGGTGATCTCTGTAGTTTGATTATCGGCAGCATCTGAAGGCTAGTTGTTTAGACGTGTAGTTCTCCATTTTGCTTTTTGAATGCTAGTTTTGTTAGCAATCGCCTTGGTTTGATTTGACGAGAACGCGCTTTTCAGCGCTTGTGTGACTGATTGGATTAGCTGACGTTCACCGAGCAATAATTTGTGTTGATTCTGGATCGCTGTAAAGGAGTGTGAGGCCTGTGCTGGACCTGCAGCGGCGTCCGACTCTCTCCTGGAGGAAGTCAAGCGCCTGCGTTTGTCTTAAACTGCGTTTGACATGAAGTTGGACATTTTTAAACATCAGTGTACAGCTTCCCTTTACTTTCATGGTTTTGTTCATGCCTTTCCAAAAGGAAAGCTCTGAGGCCACATTGTGTACAGAAtgtatgaaaaatatttttactataCATGTTATTACAATAAAAGAGAGtcaattgttttcttttattttttgagtggTTTCCATCAGCTGTGAAACAGTCAGACTCGCACACAGGGCTCtaatttaatgatctaggcgcaaagtctaaagcgcatggagCAAAAGGGGTAAGGttatgtccgaatccacttttaaggatgggaaaaacaGTCTGTGAAGCAGGCGCATgctctaacagggctgtgctgattctcttcatgagttctgggtgtgttttgagcagaacctgcattaaaccaatcagagtctcgtctctcattccctttaagagttagttgtgtcgctccatggtgcatttgctctttacatggCGACTTcataagtgtaaaaactgaacacttcactagtgagaacacagttaaacagagcatctgcagcacgaagATAAAGAaccagcctcctccattcagcctctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactttactcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttaatttattcctttactttattcctttactttattcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactttactcctttactttattcctttactttattcctttactttactcctttactttactcctttactttattcctttactttactcctttactttattcctttactcctttactttactcctttactttattcctttattcctttactttactcctttactttattcctttattcccttactcctttactttattcctttactcctttactttactcctttactttattcctttattcctttactttactcctttactttattcctttactcctttactttactcctttactttactcctttactcctttactttactcttttactttggtgaagtgaggaaacggtggtaactctctccactgaacacatccattagcccacatgtttaatttcctttgttaaacacaaagatttgcttcagaactatttctaaattcaattctaatctccagcagagaaataaatgaacaataataataaagtgtggtcagaaaactgagttatatccaaacacacgtcctgttcttatccacatatgctaatgcagacgtctccaaaaccccacagctggacacatctacacttgtgtttattataaatctgcAGATCATCAATAACACTGATagtaataatcacattatacagatgcagatggtcatcaataaactgaagaagccccccgaggtgaagaaggcctggaggcagtgctgtttatattgatggaGAACATCATCATTTCTGGATCATTTTAATCCTGTAATTGTTCATccgtaaagatatttgtgttgctgttcatcctgtgtgtattcagcagtgtgtgagtgtttagaCCTGCATAAGTGCATAACTAACACACACTGctgactttagagcagcttttagttggtcaatggtgctgtTGGTCTATTTCAGCTCTTCAGAATAGCAGCGTttcaacaatgcaccttaacacaccttcatacgccagcacacacacatgagTCTGCAAAGATTTGGCATTTAAACAACATgtcacaaaatgtgaaaattactgttgcactggtctgaaaatagccaaacaccaaacacgtcttgcacctcattgagtgtatgatagagcccaatGAGTCTTTGAGTATTTTGTCTCTGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178069

JBrowse2

Expression Profile

//

Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000050_00931338_00939002.mRNA True 1076 mRNA 0.52 8 CI01000050 931338 ~ 939002 (+)