G243062



Basic Information


Item Value
gene id G243062
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000056
NCBI id null
chromosome length 2086016
location 1233645 ~ 1246110 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU275873
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TTAAGAGCAAAGAATAGAATAGAGTACATAGTTTGACTGTCTCTCTTTATATGCACTTTCGACATCATGACTAAAATGGAATCTCATAAGTGACTGGTTTGGAAGTCTCTTCATTGGTAACAGCTTTATTATTGACAAATCACAAGCAGCACACAAGACACTTGAAAGAGACTACAATGTAAGAAGTTAATGCCTCAACTTTTATCAACACAAACATATACGTACAATTGGGTGTAGCAGTGCATTTCTAATTAAATGTACTATAACTACATCAGATGTGTTTCAGTAGTCAGAATACATTTACAGTTGACATTTCCCTGGTAATAAATGTTTCATTCTGGGTTTGTCTTATCGGCAAATACAGTTGCCTTTGATTTTGGCAGCAAAATCTTATGAGACACCATTATGCTGCCTAGTGTTTGGAACAGCCTTGTCCTTGAAAATACACCTATGAAACAGAGCAAATATTTATCATGACATGGACCATGACTCTGCCATAGAATTGCACCATGTAATGTTATACAGGGCCAGTCCTTCTGGAGCAACCTGGGGATAAATGCCACAATCAAGGGCACAATAATGACATTTTAGAACCTGCAACCTTACCAGAGTCTATCTTTAACCTCCATGATATACCTCCCCCGTAGATCAGTACAGTGATGACATATTTTTGTAATCCAACCCGGAAGATGACCACAATGGTTCCCTCGACAAAATAAATAAATACATAAATAACAATAGGATTTTTCCATTGGCTTTTGGATTACTGCATTAAATAAGATCTGTGACCAACAAAAGTTTGATTCTTACACATTTTGTTCATCATGGTAATCTTCATAAATGTACACAACTTATGAATTTTGAAGCCTAAATACAATCATCAGAAGTAAAAAGCTAAAGGTAGGCTATAAACAAACTACACCACCGTTGCATGATTTCAACGTCACCACTATTAAAGGGTTAGTTCACCCAAAAATGAAATTTCAGTCATTAATTACTCACCCTCATGTCATTCCACACCCGTAAGACCAAGGTTCATCTTCAAAACACAAATTAAGATATTTTTGATAAAATCCAAGGTTTTTGCAACGTAATTACTGTCATTCAAAGTCCATAAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU275873 True 11118 lncRNA 0.36 6 1233645 1246110

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000056_01211952_01214139 NA coding downstream 19506 1210867 ~ 1214139 (-)
CI01000056_01120219_01167748 NA coding downstream 65845 1119817 ~ 1167800 (-)
CI01000056_01062016_01069920 NLGN1 coding downstream 163725 1061819 ~ 1069920 (-)
CI01000056_00736991_00911660 NAALADL2 coding downstream 321985 736991 ~ 911660 (-)
CI01000056_00613163_00620891 NA coding downstream 612119 612644 ~ 621526 (-)
CI01000056_01292701_01294007 NA coding upstream 46533 1292643 ~ 1294074 (-)
CI01000056_01462807_01467593 NA coding upstream 215938 1462048 ~ 1467593 (-)
CI01000056_01489840_01520989 ECT2 coding upstream 243262 1489372 ~ 1521353 (-)
CI01000056_01531219_01585175 MCF2L2 coding upstream 285109 1531219 ~ 1585175 (-)
CI01000056_01626198_01642589 SLC4A10, SLC4A10A coding upstream 379738 1625848 ~ 1642589 (-)
G243056 NA non-coding downstream 38752 1127510 ~ 1194893 (-)
G243057 NA non-coding downstream 85628 1143332 ~ 1148017 (-)
G243067 NA non-coding downstream 120227 1112894 ~ 1113418 (-)
G242510 NA non-coding downstream 616422 616780 ~ 617223 (-)
G243065 NA non-coding upstream 1335 1247445 ~ 1254801 (-)
G243064 NA non-coding upstream 24237 1270347 ~ 1277062 (-)
G243201 NA non-coding upstream 52831 1298941 ~ 1303356 (-)
G243220 NA non-coding upstream 143033 1389143 ~ 1389366 (-)
G243225 NA non-coding upstream 160782 1406892 ~ 1407120 (-)

Expression



Co-expression Network