CI01000072_04225105_04268007 (SIK2B, SIK2)


Basic Information

Item Value
gene id CI01000072_04225105_04268007
gene name SIK2B, SIK2
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000072
NCBI id null
chromosome length 5473029
location 4224789 ~ 4268148 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

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>TU324710
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Function

symbol description
sik2b Predicted to enable protein serine/threonine kinase activity. Predicted to be involved in cellular response to glucose starvation; intracellular signal transduction; and protein phosphorylation. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human SIK2 (salt inducible kinase 2).
sik2 Enables ATP binding activity; magnesium ion binding activity; and protein serine/threonine kinase activity. Involved in intracellular signal transduction and protein autophosphorylation. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be active in cytoplasm.

GO:

id name namespace
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

id description
K16311 SIK2; serine/threonine-protein kinase SIK2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000072_04225105_04268007.mRNA False 3208 mRNA 0.54 15 4224789 4268148
TU324710 True 11374 lncRNA 0.37 2 4224838 4238644

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000072_04218108_04222857 LAYN, LAYNB coding upstream 1511 4218108 ~ 4223278 (+)
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CI01000072_04095246_04107965 DRD2A, DRD2 coding upstream 116119 4095246 ~ 4108670 (+)
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CI01000072_03987009_04043360 NA coding upstream 180534 3986806 ~ 4044255 (+)
CI01000072_04329947_04337502 NA coding downstream 61359 4329507 ~ 4338038 (+)
CI01000072_04338747_04342064 SDHD coding downstream 70599 4338719 ~ 4343266 (+)
CI01000072_04346264_04350998 BCO2B coding downstream 78016 4346164 ~ 4351370 (+)
CI01000072_04353484_04415940 SORL1 coding downstream 84716 4352864 ~ 4415940 (+)
CI01000072_04471801_04478691 NA coding downstream 203354 4470142 ~ 4479874 (+)
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G286471 NA non-coding upstream 44947 4177979 ~ 4179842 (+)
G286469 NA non-coding upstream 56906 4167506 ~ 4167883 (+)
G286459 NA non-coding upstream 74954 4149569 ~ 4149835 (+)
G286458 NA non-coding upstream 75557 4149028 ~ 4149232 (+)
G286477 NA non-coding downstream 866 4269014 ~ 4275631 (+)
G286505 NA non-coding downstream 12450 4280598 ~ 4280835 (+)
G286513 NA non-coding downstream 55075 4323223 ~ 4323835 (+)
G286514 NA non-coding downstream 57380 4325528 ~ 4325764 (+)
G286525 NA non-coding downstream 159064 4427212 ~ 4427529 (+)
G286470 NA other upstream 49138 4169104 ~ 4175651 (+)
G285428 NA other upstream 248575 3970257 ~ 3976214 (+)
G284742 NA other upstream 2239649 1981530 ~ 1985140 (+)
CI01000072_00338411_00351144 NA other upstream 3873501 337071 ~ 351288 (+)
CI01000072_04757636_04762507 NA other downstream 492163 4757583 ~ 4762510 (+)
G286564 NA other downstream 534305 4802453 ~ 4802948 (+)
CI01000072_04831647_04834194 NA other downstream 561250 4831557 ~ 4834707 (+)

Expression


Co-expression Network