G302902


Basic Information

Item Value
gene id G302902
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000091
NCBI id null
chromosome length 1322612
location 121975 ~ 130074 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU344064
TCAACTGCTATTGGGAAACTGCAACTGATGTTAGCTGAATGCAGCCATGACCTTACCTGAACTCTGCAGCCATTCTGTCATCGTCTGTTTCACATCAAATGAGAGCCAGCGATTGGACCAATCCTTGGAGACAAAGCGGGTGCCCAGATATCGAGCCTGATCACCTACTCCACGATACAGTTCCAGCCTCTGCTCTTGGTCCATGGTGGGATTCTTAATCCGAAGCCGTAACTCAGCTTGAGACAGCAGCCGGTAGTCTGGAATACTCTGTCTCATCTCTGATACATTAAAAAACATCTGATGCTTTGTGCCATTCTGAGCTAGAGATAAAGTGAGAAATAGAAAAGTTCATGGTTGTTTTATAGCTCAGACAACAGACCACTTTTTTGTCAGATAAACCACCAAAGCAAAAATAAGCCATAGATTCGCCTGGTTAATGGCATCAAATCTTTGATAGATATTCAGAGTTTTGTTTGAGGGACTGGGTATCCATGAGCATCCAATCATATATTCTGCTTTGTTTGATTTTTTTTTTTTATCTTTTCATATCAGTCAGATGGACTATTTCTGTTTCAGTAGGTGGTTCGTAGTCAGAATCACCTGCTAACTGCTACCACAGTTTACAATACAGGTAAGACAGCATTAATGTTGTATGTCTAAATGAGACTTACTATATGCTGCCCTTGTCTATATTTTGGCTGAAGCTGTAATTTAAAGAGAAAGCCATCATTAAGCTGTGTTTGGGGTTGCTATAGCCTAACTGTTTTTGCTGATGTTTAATATAGGGAGGAGGCCCATGGTGTGGGATGAGTTACACACCATAGTTTAATATTTATGATTTCATTTGAATAAAATCTTAATCGTAATTGTGTCACATTATTGGTGGCTATATGTTTACTTGGAAACATATAGAAATCAACTGAGATGGAGCCAATGGCAGACTGAGATGAAGTCGGTGGAAGTGGAGAAAGTGTGGAGCCAGGGAGTGGAGCCAGGGTGCCAGAGGACTGGGGATAAGCCGGTTAGATTAAGGACCAAGGCAGAATCAGAGGAAAGGCGAAGCCCGATGGAGCCAAAGGGGTGGAGGGATGAAGTACAGCTGAAGGCCGGGAAGTCTATGGCACAGGCTAGAGTGATGAATGACCAAGACAGAACCAGAGGGATGAGGGAGCCCAGTGGAGCCGTAAGGATGATGGTTCCATGTGGAGTCGAGGGAGGGAGGAGCTAAGGTGGAGCTGACTGGTCAGTGAGCTGAGGTGGAGTGAAGAGTTCAGCTGCTAGAGGCAAAGCCAAGGGATCCTCTTGCCAAGGTGGAGTTGGAGACTGGAAGACTCAAGACAGATCCACATGATCCGCAAGACTGAAGGAAAATAGCTGAGGTGGGACCAGGGAACTGGCTGTCTTAAGTAGAGGGAGTGGTAGAGGGAGGATGGGCAGTGTGGGCAGGGCTTCTTTCAATCCTCTCGTACTCCACAAGCATGTCCACTGGAACTTGACAGTTGAAATCCTATAGAAGGAACATAAGCCGTCTTGCTGGCTTATGCACCTGGTCAGACTCTTCGTTAGGCTCAGGCTCTGGGGCAATGGTCTTGCTCTCTGGCCTTGCATTGCAGCAGGCTCAGGCTCTGTCTCTGCGGTGGGCTCCTGGCTGGGTTCCGGGTCCAGAGTGGGCCTGGTAATGTCCTCCTCAGTGGGGCAGATGGTAAATGGAGATCAGTTTGTCCCCAGCACCCACTCCACGAATACGGCAAATGTCTCTCGAGGACCTTCACCGGGCAGGCGTGCCTTGGTTCGCTCATCAGTCAGTGGTTTGGAGCGTGTATCAAACTGCCAAAGTCACGTGAGCTATTGAAATTTCGAAACACTTTTGACATATCACATGACTTTGGCGATCCGAACCACTGATTCGAAACCAAAAGATTTGTAAAGCTTCGAAGCTTCATGAAGCAGTGTTTTGAAATCGGCCATCACTAGATATTGTTGAATAAAGCCGTTATTTGTTTGTTTTTTTTGGCGCACAAAAAGTATTCTCATCGCTTCATAACATTAAGGTTGAACCACTGTAGTCACATGAACCATTTGAAATATATTGTTGGTACCTTTCTGAGCATTTGAAAGTGTTATTTGAAAGTATATTATTATCTTGCTGTCAATGCAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTCATCAAAAATATCTTAACTTGTGTTCCGAAGATGAACGAAGGTCTTGCGGGTGTGGAACGACATTAGGGTGAGTAATAAATGACAGAATGACAGACATTTTTGGGTGAACTAAGCCATTAAGATTTTGAGGTAGTTCAAACATTAGTATTCAGGTAACAAAGACCTCAGAAATTTAACAAAATAATCACATGTAAAATAACGCCATATTCTTCACTGTATAAATTAAATATAGATTATCCTTATTAAAGCTTCAAAAGTTATTCAGTCAAGAGCAGTTAGTTAATTTCTCTTTGTCTTTTGTTCTTTGATTAACATTAATGACACAAAATGCAACCAGTATATTAGGCTGCTGTCACTACCGATCTCAAATCAGTACTGACGTGCTGTCTGTGAAGCTGCTTTCTATGCCCGCATTTCAGGTGTGTGCACATAGAAAAGCTTCACAGACAGCGTGTCAATACCAAATTTAGTTCTCTTTTGCATCTTATCATGCTTGTATGGTTTAAAAGGCCTTGAATAAATGATTGGCTGATATTTATGCTTTAATATAATTTCTTTTGTTTTCTTTTGGCCTCGCGTTGAAATGTGACCTGTACATGCTTTCATAGTATATTAAGATCTTTCTCTAAAGCAATGGGAAACAGATGATTCTCATAAGCTTGGTGCTACACTTTAATGGCATGTTCTATTCACCATCCACTGTTAAGGGATATAATGTATTGATTATATTCAGTATGGGTTCCATGCATCAACACCTGTGATCACACATAAAAAGGCTCAATGAACTACTAGAGAATAGGGTGGAGTGGGATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGCGCGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACAGGCTGGTGCTCAGGTAAGCTCAGGACAGCTGTCCTAACAGGCACTGAGACAGACCTATCATTAGTAGTGGGTGCAACCAGATTCCAGCAGGCTTAAAAATCTGCCTTTCCAACACATGCTTTACCCTTCCTGTCCTCTTACCGTCGCCTTGCATAGAATCACAACTCTCTCTTTTCTTAACTATTCTGTTCCAATCACATTAAGCCATGACACACTTTTCCGGGCAGATGAGCTCTGCAGTCAGCACAATCTTTGACATGTAATAACATGATATGAAAAGTAGCACATATACAATAAAACAGACTGATTAGTCTAAAGAAAAACATGGAAAATTAGACATGCCTGCAGGACATGACTGTACATAGAGTGCTCTCTATTTGACAACATAATTTATGATTACACAACTGTATGGTCAGTACTAGCTAGAAGGCAAAATCTCTTTCTACCTTCAACTAAAAGATATCAAGTGTAGCAAGCTATAAGGAAAAATAAAGGTTTCAAATAAAAATAATGCAGCCTGATACTATTAGTTTCAAACTAGTATAACTTTTTTGTTTTGTTTTATAGCTGTGGTCAGTACACATGCTCGAGACATAGACAAGTGTTGATGGCAAAATCGGCAACCAGTTTTGGGTCTGCCCTGAGTGTCATGTATGTGTGATACAATGTGACAAAATCTGCAATGTAGCTCTTTGTCAAGCCAAACAACTATGCTACTGAAAAAGTCTTAATGGGTAGAAGGATAGGAACACCATAGATGATGACAGCAATTCCTGCAAAAGCAAATCTGTAATCCTGAAAAATATTTTAACATACATTCATTGCTAAAGTTAGTGGTTCTGACAGACCTATTTCAAAATGGACAACACTATACATAATATGTTTTTCTGGTAACACTTTACAATAAGGTTCATTAGTTAACATTAGTTAACTACATTAGTTAACATGAACTAATAATGAACTGCACTTATACAGAATTTATTAATCTTTGTTAATGTTAATTTTAACATTTACTAATACATTATTAAAATCTTGTTAATGTTAGTTAATGCACTGTGAACTAAGATGAACAAACAATGAACAACTGTATTTTCATTAACTAAAGTTAACGAAGTACATACAGTAACAAATGTATTGCCCATGGTTAGTTCATGTTAGTTAATACATTAACTAATGTTTAACTAATGAACCTTATTGTAAAGTGTTAGCGTTTTTCTGTTCATGTTCAACAGGCCAAAAATATTTTATTGTATTCTTAAATGCATTTAAATGTATTGCAACAATATAAATCATAAATATATAATATATATTAATATATTGGTTTTTGTAAAGCAAGCATGCTATTTCTGCTAGTAGAACAACCTCTAACCCTAAATAAAACATTTTGCCACATAACTGACCCCACACCCCACACTGTTTATGCTGCAGACAAGAATTATACCTCAAATTATGTAGTGTTGCTTGTAACCACCCAGCAACATCCCAGAACACCCTAGCAACCACACAGCAATGTTTTTAAAACACTTATCAAAATCTTAGCAACTGCAGTGCAACACCCTGGCAACCACCCTAGCAGTGCAGCAGGGTGGTTTTCCTTGGTTCAAGCACAATATTCTTCAGTAAATGTAAAAACCTAGGTATTCACAAACAATTGTGGCTCCGATTGCGGAGTGTGATGTTGTGTAATGTTGTATTGCGAAAGAATGCAATTACTACATTACTGATGGTTGTAAATACTGAGTGTGGGAGGCCTTGCAATTGCATCAATGTATTCCACCTTAAACAAATGTAAGAAGCTTTATGCAAACACAAAACATAAAGAAGAGTTTTGTCCCTCAAGGGGAATTGCAAGAGCAGGAATGGTTGCTATTTAGGACTATTTCCTCGCAATCTTAGTCACACCTCAGAAACAAGCAAC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>TU344066
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU344064 False 8080 lncRNA 0.40 2 121975 130074
TU344066 True 8078 lncRNA 0.40 2 121975 130074

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000091_00108499_00117102 CDKL1 coding downstream 2866 108220 ~ 119109 (-)
CI01000091_00265846_00269683 NA coding upstream 135766 265840 ~ 270360 (-)
CI01000091_00337653_00338300 CLDN3A coding upstream 207573 337647 ~ 338587 (-)
CI01000091_00346274_00346930 NA coding upstream 215943 346017 ~ 347510 (-)
CI01000091_00348777_00349430 NA coding upstream 218393 348467 ~ 349729 (-)
CI01000091_00400737_00412559 NA coding upstream 270366 400440 ~ 412559 (-)
G302504 NA non-coding downstream 78069 42712 ~ 43906 (-)
G302924 NA non-coding upstream 21129 151203 ~ 151551 (-)
G302931 NA non-coding upstream 34129 164203 ~ 164408 (-)
G302934 NA non-coding upstream 36683 166757 ~ 166971 (-)
G302937 NA non-coding upstream 39876 169950 ~ 170450 (-)
G302938 NA non-coding upstream 41160 171234 ~ 171527 (-)
G303047 NA other upstream 344528 474602 ~ 562944 (-)

Expression


Co-expression Network