G314830


Basic Information

Item Value
gene id G314830
gene name NA
gene type unknown
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000098
NCBI id null
chromosome length 3223972
location 2063338 ~ 2100817 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU357987
ATCATCAAAATTAAAAGAAATAAACATTTGAAATATATCAGTCTGTGTGTAATGAATGAATATAATATACAAGTTTCACTTTTTGAATGGAATTAGTGAAATAAATCAACTTTTTGATGATACTCTAATTATATGACCAGCACATATACTAAATCTGTTTGTTTATCGAAGCCAACAATCTCATTCAGTGTAAGTCCTGCTTTATGCAAAGCATATCTGAAAATCTTAAGTTGGCATCACACAGGTCTTTACAAATAGGTTCAAGGAGTGGAAATTTTGAAGTATGTAACTACTAGTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTCCCTTATGCAGTTAAAAAGAATAGTGACTTGAGCATTCAAGCTTCCTTTCAAGTCTTCTGAAATCATACGATAGCTTTCTGTAAGGAAACAAAGAACTTTATGACCAGATCATTGAACTGGACCAGTCCTATATGTGAGCAAATAATTTAAACTGGTTTTGTGAATTGGATCAAGCAATTCATTTAAATAATAATAATAATTTGGTCACAAATGTAGCTTTTTTTACATCTCTCATAAACATTTCAAGGTTCCAAAAAATGCCCAAGACCAAATTGGATATACATTTTTGTCAACTAAATAGAATAAACATTAAATGAAACACACACACGATTGCTAACAGAATTCAGTTGCTTATATATTGGATTTAAAATAAATAACACCATTTCAGCATAGGCTTTTTTCATTGATGTACACACATGTACATCTTTGAGGCTACCGATAATGACTAGCTCAAAATGCATATTCTTCATATACTTTAAAATATGTGAAAAGCTGTAAAAGAATTCTGTAGTTGTTGTAGGGCATAAACATGTGTGGCACAGCACTAGGGATGGAATTGGGACGAAAATGGGAAACAGTAATTAAACCCTGAAGAATAGATGGAGTTAGAGTCACTTTATGCAATGGGTACATGTAGATGCCATTTTCTGCATCCTAATGAAGCACTGCAGATATGTTACAGCAGTACACACACTAAACTGTATGTGGCTTTTAATACTTGTCATGCATACAAATTCAATGTGTGTGTGTGTGTATGTATACTGTATATACACATATACTATATTGGCAAAAGTATTGGGACAGCCCTCCAAATCATTGAATTCAGGTGTTCCACAGGTGTATAAAATCAAGCACCTAGGCATGCAGACTGCTTCTACAAACATTTGTGAAAGAATGGGTCGCTCTCAGGAGCTCAGTGAATTCAAGCGTGGTACCGTGATAGGTTGCCACCTGTGCAATAAGTCCATTTGTGAAATTTCCTCACTACTAGATATTCCACGGTCAACTGTTTGTGGTATCATAACAAAGTGGAAGCAATTGGGACCATGTAAATTAGGCCATGTAAAATCACAGAGCGGGGTCAGCGCATGCTGAGGCACACAGTGCGCAGAAGTCGGCACCTTTCTGCAGAGTCAATAGCTACAGACCTCCAAACTTTGTGTGGCCTTCAGATTAGCTCAAGAACAGTGCGTAGAGAGCTTCATGGAATGGGTTTCCATGGCTGAGCAGCTGCATCCAAGCCTTACATCACCAAGTGCAATGAAAAGCGTCGGATGCAGTGGTGTAAAGCACGCCGCCACTGGACTCTAGAGCAGTGGAGACGTGTTCTCTGGAGTGACGAATCATGCTTCTCTGTCTGGCAATCCGATGGACGAGCCTGGGTTTGGCGGTTGCCAGGAGAACGGTACTTGCCTGACTGCATTGTGCCAAGTGTAACGTTTGGTGGAGGGGGGATTATGGTGTGGGGTTGTTTTACAGGGGTTGGGCTTGGCCACTTAGTTCCAGTGAAAGGAACTCTTAATACTTCAGCATACCAAGACATTTTGGACAATTTCATGCTCCCAACTTTGTGGGAACACTTTGGGGATGGCCCCTTCCTGTTCCAACATGACTGCGCACCAGTGCACAAAGCAAGGTCCATAAAGACATGGATGAGCGAGTTTGGTATGGAGGAACTGGCCTGCACAGAGTCCTGACCTCAACCCGATAGAACATCTTTGGGATGAATAAGAGCAGAGACTGCGAGCCAGGCCTTCTCACAAAACATCAGTGCCTGACCTCACAAATGCGCTTCTATAAGAATGGTCAAAAATTCCCATAAACACTCTCCTAAACCTTGTGGAAAGCCTTCCCAGAAGAGTTGAGGCTGTTATAGCTGCAAAGGGTGGGACAACTCCATATTAAACCCTACGGATTAAGAATGGGATGTCATTAAAGTTCATGTGCATGTAAAGGCAGGCGTCCCAAAACTTTTGGCAATAGAGTATATATATATATATATATCCCAATATGATGTGAATATTGTTTTTTTTCATTGTTGTATCTGTTGTCTGTCTGCACTTGTGTCTCTCTTATGTAGTGAGAAATCAGGGAGGGTGATATGAATATGACTTTAGAGAAACAGAGATGTTTGTTCATCTGGAGCGGATTAGAGTATGTGCAGTTAAAAAGACCAAAGCAGAACGTCAGTGTGTGAGTCTGGTTTTCTCCACATTGTTGGGACTGAATGTCCCCGCAAGGATAATAAAACCTGAAATCAGCTACGTTATTGGGAGCAGCCAACGGTCCTCTTGAGCAAAATGGCTTAATAAACATACTAAATAATGTCTTGATGAAAATGTAAGAATGCAGCAAGGTTTTTGTAAGGCTTAGTTTCTGGGTGTAGAGGTAGGGTTAGTCAAAGGACATTCCCCACCATGATAGCCAAAAAGAAAAACGTTTTGGAAAAAAAATCCATATAAATTTTGATTTATTTATTGAGTACTCTGCTTGAGTCCACTCACTCATGAATATTGCTTTAGACTTGAATCCTCCGCTTCAGTGAAATTAAGTTTCTTTTCAACTGTATCAGCTTGCTGGAACGGTCAGTCTTGGTCATTGTGAGTTTTTAGAGCATACTCTAGACCTCACTTCAGGTCCAACATATACTAAATCTGTTTGTTTAAAAAACAAAACAAAAAAACGAACTTAAAGTGTGACTTTGCCAATTTTCAACCTGCTTTGTATTGTTACAGTATTGTTAGTATATGTAAATGAACAATGTTTTCTCGTTTTCCTTGTTACCAGGACCAAAAAATTCATGTTTATTTGTCAGCAAAAGTCAGCTGGATGATGCAATATTTTTACAACATATCTTTGTTTTAAAGCATTCCTATTATGCCCTTTTACTAAGTCTTGAATTTGTTTTTAGGGTGTACTAGAATAGGTTTTCATGCTTGATTGTTAAAAAAAACTCATTATTTTTCACATATTTTACATTAAGCTCCTCTCTTCCCAGTCTGTCTTAAACGTTCTATTCAGTTCCTGTTTCGATGAAGCCCTTCCTTCCGAAATACGAAATGTGCTCTGATTGATTTGCTGGCCCAGTGTGTTGTAATTGGTGAACCGCTTAGAGCGTGTTCCGGAAATGTCACGCCCCTTACCATAACCGTGAGTTTCATCTGCATATAAGCATAAATGTTTGTTCACAAACTTTACTTGTGTAGTTATATAATGTACTCTTAGGGTTTCAAGTATACAATCAGTACACATGCAAAAACTTCCAACAGGCAACAAATAATAATTTAATATGTTTCTGCTTTTTAACATTTTTACATTTCTTCACAATTATTACAATACAACTACAATAATAATACATAGAATAAATACAGTAACAATATTTAGTGTATGTTTAATTTAACTGCTACTCAACTATTATTCAACTACTTTGCCATCTTTTCAGATCATTAGTCATCAGATGTTCAGTAAAAGCTGTATGTGTCATTATGGTCAGCTTTAGTTTAACCAAACTCAGGCACTGTCTTCCATGCCTCCATCACTGATATTTGTGTGAGCTTTGACAAGGAGTTTTGCTCACCTTTGTCCAAATCTAATTATTAATGAATGCAGTATGTGTGTGGTCAGGCTTGGCAGCATGTCAGTGCATCTTCACACTGATGGGGAATTCATCCTGACATTTCAGACAGGAGTGCATGAAAAACACACTCTTTGCCTGACACTTGTTTTTTTTTGTCTTCTCCCTCCTCTCCTCTTCCTCTACATGTTTTTTTCCTTGTGTTTAGTCATGTTTCAGCTGAGATGTGTAAAACTGGAATGAGTATTAAGTATTAATCTGATTAATCAGATCCAGGGTGAAGGGTCAGCCTACTGTGCTGAATTTTAATTGTATTTATTTATTTATTTATAAATAGACTTTTCCAGATTACGCATGATGTCATCCGCCTCCTGATACTATTTGTCTTTCCATTTATGCAGTTCTGTGTAAATGTCACTTGACATTTACTTTTGGTAACACTTTATTTTACAGTGTCCTTGTTACATGTGTTACATGTAGTTACTATAGTAAATACTTCATTGTTCTGAGTATAAGACATTTTTTTTCATCTTATAATCAGGGTAATCTTATATTCGGAACAATACGTACTATAAATTGTGCACCCTGTAGTAAAAAATATGTAGTTAATTATTAATACTCAGTACTTAAATGTATAATTACACTGTAATAAGGACACTTAAAAATAAAATGTAACCTTATCTCTCTGGGGTCTGAGGTGTTTTCTGGGCCCTGGAGGTGTTTTGACATGCGCTGACATTTGTGCTTATTTCTGTTACTTATAACATTTTGATGGCAAAAGTCTGATTACACTGTATTCAGATCAAACTCTGCTACAATAATATGTGAGCAGCATGTATGTAAAAGTTTGTAGTTTTGAGAAAATGACATTTATGCGTGATTTTTTGAGGTAAAAAATTGTCACTAAAATAAGGCCATAAAACCCATACTGAATATTTGTTCACAAGACTTTAGAAAAAATCTATCTTGTAGCCTAGAATTTTTGCTTCAAAACGATGTGAAAATCATCCTGACCACTCATTCACATAAAACAATATATTGATTTAAAATTTGTAAGACATGTTTTGTGTCTTGAAGGCTTATGTGGGGAGGGTGTGAATGATCATGAATATTAATTTGATTTTGAGACAAGTGATGTCGCTGCAAGAGGGAGGGGAAGTTATTTTGATTAAACATTTTGAGGACACATGAATTTAAAACATGATTTGCACAAATAAATTATTTATTGTATATGCTGCAATATTCCATATTTCTTGGTGACTTTATATCCCTTTAAGATCTTAATCTATTTCTGAGGCCTTATTTTCCAAACAAGCATGCAAATTGTTGAATATTAAGTAAAATGTTTCTCCCTCAAATAAATTAATAAATAAATAGAGCAAACTTATGGACACTGGGTCACCGTCCCCCTTCGTGCCCCCTTTAGAGCTTCTCCTGATACCAATAAACGTAACACACTGTTTGCCATTTTGAAGTTGTGGAAACAAGACATGCTGGGAAATGTGTTTGGTGTGAAACAGACATATGAACTGCTATGAGCAGTTGGAGTTTGTTTGGCTCATCCATCTGCTTTTTTTTGGCTGCCTGTATTGGTTGTAGCCAAGCACAAACTGTTGTATATCACTGCCCGTGCTGCTTCACTCACTCAGGTTGGGTGAATCAGTGAAGCGGGCTGGGCAGGGCTCTGCTGGGGGACAGATTGCCCTCCCCCCCGGTGGGCCGCAGGGGACAGAGACCCAGCCAAGGCCCCGGGCAGAGCCGCCTTCCTGTTTGCTCACTCATACCTGACCTGCTCAACAGCACTTCCACTCCCTGAGTGCTACACGCTGAGATGAGCCCGAGGACGAGGTGAATAACTGAGCAAAGAGCTGATACAAAGACCTTGATGAAGCTTTGCTAAAGCAAAGAGAAGTCAGTATTAAGTCGAAAATATCCGTTTTCCTTTTCAATCATGAGTCATTATTGTCCTGTGATTGATCATCATTAAAAATCTCTGCAATCAGCTTTTAAAAAAGATATTTCTCCTTTATTGAAGGAATGCAGAGGCGTTCTGATCAATATCAGGTCTCGGCAGTCTGCAGTTTTAGTCTCGATCAATGTTTTCTCGCACAGTAAATCTGGAGAATATGAGTGACTGTCCTAGTTTTCACGTCCCAATCTTTCATTTGTCTCTGTCTTTCTGAGTGTCCACCTGTGCTGTGTGATTTCTGGGACACTGACTAAGTGTTAGTGCGTGTGCTGGGGCACATGTGTAAATGTCGACAAACCTGTCCTGCTGCTCTCCTGTGGTCGACAGGAAGCTGTTTATATCAGACGCCAGTGCTCTGATCTCACAATACCCCTGTGAAAAAGAAGAGTGCTCAATTGTATTGATTGTGCACTTGTAGTGTACTACAAATCTTAAAAGTATATAGTTAAAAAAACTGTAATAATATTAATGAAACAAAAGGCAACTTAAAAAGAGTGCACTTTAATTCTTAACACTTCTAGAAAGTGCGATTTGTAATAAGTACATTTTTAATAACCTCTTGTTGTGTTTTTAATTTTTACTAACATTCTAAAGCACATGTAAAGTACTTGCAGTTATGTTGCCTGTCTCTTAAAATGCTTGAGCTCTTTAAAACAGGATGGATTCTGATTTGCTGTCAATGTTTTTAATCGTTCATCAGCTGGAAAAAAATAGTTCCGAAAGTGATTCCAACGATATCGGTTCTCTCTGTGCCATTATCGTTATGGTTGTGGTGTTGACTGCTATTCTTTTAGAATGATTTTTAGAACTAATCATAATCAGGTCTCATAACAATGGTATAAAATATACTGAAAACTATTTTACTGGTTTATTGGAAACAAATTCTTTTCTAGTGATATTTGGCTAGATTATGTTTTTCTCAGCGGTCCGGGAATTTAGGTCAGCATGATGCAATCACAGCTGAAGAGTCAGTAACTGGCCTCCTGAACAAGATTAAACATTCTTAGCCATCGCCTGTTTGAAATTATGATGGCTGTAGATAAGAGGAGAAAGCCTCTAGCTGATCTACAAGTGAAATACATCAAGGCATTCCTATATTACACAAGTAATGGAGCCTTCGAATGTTGAAACCTCACATCGGAAGTAATATTCCAGCTTAAATACAGTTTAAAGAACTAAGTTATGTTGTGTTTTATTTCAGACACCTCTAGACTGAATACACTTAAAGGGTTAGTTCACCCCAAAATGAAATTTCTATCATTAAGTACTCACCCTCATGTCATTCTAAACCCATAATACCTTTGTTCATCTTTGGAACACAAAGTAAGATATTTTTGATGAAATCCAAGGTTTTTTTTATCCCTGATAGAAAGCAACATAATTACCGTCATTCCGTCATTCCAAAGTCCAAAAAAAATACTAAAGACAATAGTCAACGTAAATAGTCAACGTAACTGCAGTGGTTCAGCCTTAATGTTATGAAGCGACGAGAATACTTTTTGTGTGCAAAAACAAAACAAAAACAGCAGGCCCTATTTTAACGATCTAAACGCACTGTCTGAAGCGTACGGCGCAAGTGGACTTAGGTCGTGTCCGAATCCACTTTTGCTAATTTAACGATGGGAAAAATGGTCGAAGCACCTGGCGCATGGTCTAAAAGGGTTGTCCCTATTCTCTTAATGAGTAATGGGTGCATTTTGGGTGTAACATGCAATAAACCATTCCCTTTAAAAGCCAGTTGCGTGCCATGGCGGATACGCTATTTACATGGCGGAATTTGCAAGCAGAAAAACTGAACGCTTCTCCAGAGAGGAATCCTTTTATTTTTAATATTTAAAAATGTTTGTGTGCTGCTGCACGTCCCTGTGTGTGTAACAAGCAGAGTGTACATGCATTATATAGCCTATAGGCGCATATTACTAACGTGCCCTTTAAATAACAAAAAAAATATTGCAGTCTATTTCAGTTGCCTCAAAATAGCAACGCGCCAACAATGCGCCTGAACACACCTCGTTTTCAGACCAGCACACCCATGGGTGCACAAATGGGCGCAAATACATTTGCTATTTAAACAATGTGGCACAGCACATGAAAATGATAACTGCATCGGGCTGAAACTAGCAAAAAACACTTGCGTCGCACCTGGCGCAGCATTGTGCAGGGTGTATGATAGGGCCCAATGACTTTATTCAACAATTTCTTCTCTACCCTGTCAGACACATTTGTACATATTTGACGCAGTGAACGCAGTTCAGCGCTTCCATGTTTACGTCCAAACGCCAGGTATTTACGCTGCTTTCAATTGGGGATAAACCTCTTGGATTTCATCAAATATCTTAATTTGTGTTCCGAAGATGATCATACTTATTGACAGAAATTTCATTTTTGGATGACCTAACCCTTTAACATGATCATATACAGCTGTGCTTTAAGTTCTACATAAGTGTCGCTGTCCGTTGTAGCACACGCTTGTATTTTGCCTAATTAGCCTAATTATCTTCACCTGATGTGCATTTGCTATGAGGACAAAAATATATACAAGCACATACCTAAAAGTGGAGACATCAGCAAAATGGCTGAACCAAAAATCTAATTTATTTGTGTTCAGTCATGTAATTTTTATTTTATTTCTTTATTCATTCTTATTTCTTTATTGAATTAAGTTAGATGAATTTAAGCAACAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAGTCACACTGGACATGAGTAAAGTTTAGGTGCAATTTTCCAGTTGTCCTAGAGGTGACCTCATAACGCTGTCTCCTTACGATGCACTTAGGGATTAATGATTACTTCAGAGCACTCGTAGTTCTGCGAAGATTTTCAAGCACTACTTAAGTTACAATGGTTTTGGGAAATGCAGCCCTGTTCATTATCGCCCTCACAGCTCATCACATTTTCCTCAGTATGAGGACATTTCCGTTTTGACATGTTTTCATGTAATTTCTTCCTGTCTACTTCCTTCTTTTGAGTGACTACACCTGTGGGCTGTTAGTTAGCAACATACTGTACGGTGACCTTAGGACATATTCACTCCTTACATTTTAAGCTAGGTGTACACTGTGCGATTTATAACAGTCCTTTACAATTATTGCTTGTCAGACTGTACGAACATGATCCTCACGTCACACTGTGGGATCTCAGCCCTCATTTATGTCAGACTGTACGACAGTCAAGACGCATTAAAAACGGATGTGCACATGAAAACTCGTCCGGGGTTTCATCATCAACCCACACACGTTTGGTGACTGTGAGCTGCATTACACACGGGACTGAAATGGTGGCTAACAAAGACATCTCTAGCGTTAATTTTAATCACGGCTTGTCTTGAAAAACGAAGACAATTTGACGTTTGTTGTAGGAGAAGTCACACTGCAGGACTGTGCGCCAAATCTTCTGACACTGCCAGAATTTCGTTGGAGGAAAAATTTGATCGCAACGGATGTCGGTGAACATGTCAAACTAGCGATCAAAGACTACAGATTTTAGCCTAGGATTACAGGAATCTTTTAGGATTCTCAAAATTTGTCTTAGAAGACCAGATCGTGGCCAAAATCGTACAGTGTGCACCCGGCTTTAGATAACTTCTAAATGTTAAAAGAAGGAACTCTAAGTAACACAATAAACACATATTTGACAGTTCAGCACCTTTTTACATAGTAACTTGTTTACCAGCAATAAATAATTACCAAAATTAAGTTATAATAGTTCATCTATATAGACCTTATGTAGCCCCACCCCTTTTCAGCGCTGCGCTCATTGTGTTCTGTCTTGTGGTTTGTATTTCCACAGCATGAAGGTAAGATCTTACGGATTTATGAATGTTTTAAAATCTTCCCAGTCTACTGACTTTTGTTATGACATCCGCTTCAAATGTTACAATACTCATTGATAACTGTCGTTAACTCTACAATAAGTAAATCCACTTCACCAGCTAATTACTCTTCAACAGCGATGGCGTGGAAATATACAGAGCTACCACAAAAACGGAAGTTCAAACAACAACAAAAAATTCTAAAGATTGCTGCACACTTGTTTCTCTGGCAGCCAGAGAAACAAGGTCTAAAGAAGCCATTAAAATAATTTTGTACTGTATATACTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU357987 True 9984 TUCP 0.38 3 2063338 2100817

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000098_02053731_02059911 ZNF521 coding downstream 3427 2053402 ~ 2059911 (-)
CI01000098_02023150_02033196 ZNF521, ZNF423, ZNF521.S coding downstream 28459 2022875 ~ 2034879 (-)
CI01000098_01954977_01956154 NA coding downstream 106254 1954744 ~ 1957084 (-)
CI01000098_01921142_01930710 NA coding downstream 132628 1921060 ~ 1930710 (-)
CI01000098_01749704_01753851 NA coding downstream 308320 1749522 ~ 1755018 (-)
CI01000098_02137212_02147761 SS18 coding upstream 36395 2137212 ~ 2149263 (-)
CI01000098_02289414_02291955 NA coding upstream 188214 2289031 ~ 2292432 (-)
CI01000098_02293810_02295494 NA coding upstream 192529 2293346 ~ 2295851 (-)
CI01000098_02323797_02348141 NA coding upstream 222660 2323477 ~ 2348141 (-)
CI01000098_02405598_02411336 NA coding upstream 303836 2404653 ~ 2411336 (-)
G314858 NA non-coding downstream 65578 1997301 ~ 1997760 (-)
G314823 NA non-coding downstream 113809 1949314 ~ 1949529 (-)
G314807 NA non-coding downstream 154268 1908575 ~ 1909070 (-)
G314806 NA non-coding downstream 156864 1906261 ~ 1906474 (-)
G314795 NA non-coding downstream 180014 1883115 ~ 1883324 (-)
G314877 NA non-coding upstream 70130 2170947 ~ 2188382 (-)
G314882 NA non-coding upstream 73082 2173899 ~ 2175711 (-)
G314875 NA non-coding upstream 87908 2188725 ~ 2247971 (-)
G314874 NA non-coding upstream 106250 2207067 ~ 2268577 (-)
G314895 NA non-coding upstream 113805 2214622 ~ 2217707 (-)
CI01000098_00525874_00530211 NA other downstream 1534783 525701 ~ 530266 (-)

Expression


Co-expression Network