G398346


Basic Information

Item Value
gene id G398346
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000242
NCBI id null
chromosome length 629286
location 571671 ~ 577089 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU456864
TTAAATATGTTTTTAGTACCTTTATGGATCTTGAGAGAGGAAATGTCATTGCTCCCTATGCAGGCCTCACGGAGCCATCGGATTTCAACAAAAATATCTTAATTTGCATTCCGAAGATTAACGAAGGTCTTACGGGTGTGAAACGACATGAGGGTGAGTAATAAATGACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAAATAACCCTTTAACGCTTCATTCACGTCTGGTGTGAACGCACCATTAGAAGTAAATAGAAACCAGGTTTAAAATGAAATGCATTAAAAATATTTATTCAAATTTAAAGTATCTCAGCTTTCTTCCATCCCACATCACAGACTCCTTCGGGGATTATAAGATGTAGTATTGTCTTCCTGTACTCGAAAGGTTAAACTGAATTAGATTCAGTCCAGATTCAGCAATGTAAAATGTCTCAGTGGGTTTTTAAAGCACACAGTAAATGTGTACTGACATGCTCAGTGAAGCACGCCGGGCCTGTAGCTTTCATTTGGACAGCGGCCCTGATATCTGAGGGTAGGAATGAGATTTCATCTGGATCAGTTCCATCTCATCCAAATGCTTTAAGAAATATTCTTGGTTTAATGCATATTATGTCAACATGTGTAATGTGTAAGTATTACTGATTATACTTTCATTAGAGTTCAGAATAGTAGCGTATTTTAAATCCGTGCCGGTGACAGAGTCTGTCAACAGAGTTTAAGTTTTATTTATTTGTGTGTCTTTAAATATATGAATGGATAGCATTGTCTGTTCAACATAACATACAGCAACATTTAATGTGTGGGCAATGCATTGTTTTCTGTTTTCTTAATAATTAAACAAACAATAATGCATTTTATTAAGAGCGCCTTCTCATGGCATAGAGTAAAAATGCACAGAAACATAACAAGAATATACATCATTATTGTACATTACAGATCCAAGATACAAAATGGAAAAAGTAAAAGCTCTTCTAAAGACAAATGTTTCAGGGTTGGATTTAATGAGTCTGTAATGTGTCTGGGTAGTGCGTTTAGGGGCATAAAAAGGAAAAAGCCTCAAGTTCATTTTCTACACAAGCAGGCACACATTTATCAGATGGCTCAAGGTCAGCGGCTGAAATGAGCCGTGGTGGAGTGTTTCCGGAAAGCGTTTTGGTAGAATAAAGAATTATGTTTAGCCTCGCCGTGGCTTTAAGTGCTTTATCAGTGCTAGTTTGAATAGTTGTACACAACTTGCTTATGTAAGAGTGAACTTCTCAATCTGTTGGAGAATAGCCTGAAAAGAAATGCTGCATCAGTGTGTGTGTAAATATGTGTGCTGTGGTCAGTGCGCACTGGCTTTGGCATGTGAGTGCACTTGCTGAAACAGCTAAATGGATGAATCACTGCGCATGTGGGAATGTTTGTATGTGTGACAGAAGAGAGAGGGAGAGAGGATGCTTTATGGTGAATCTTCTGTCCAGGTCACCAAATTTAAAATGAAAAATGTAAGAATTTATATTTTGAAGGCTGATTTTTTGCTATATGACAGTTAAGAATCTTTCCAACCGATGGAAGGCAAGCTGAGTGTTTGGGAATCTCCATTTTACTATTTTTGCAGTCTTTATTTTTGCATTCGGTGATGCTAAAAAAGGTTCCATATAGAGCCTTAACCCTCTGGTGCTGTTGGAACATTTTTGACCCAAAAATATTGCGTTTTGGGGGTTTTTAGAATTTCTTTACTTCATCGGAATGGTACAAAACTTGATAAAGGTTTTGGCACTTGCTGCGTGAACACACAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATGGACATGATTTGAAAAGGTTAAATTGTCCTGAAAAAAACAGTCACACATATATTGTTTGCAGTCAAAAAGGATCGCATTGGAAGCGAATGGGAGACGGATTCCATCTAGTGGAAACATTTGGTACTGCACCCAAACAAAATCTTACCAAAAGCTCATTTTTTGAGATATCAACCTCAAATTTGGAACACACATTGTTTAGATTTATGGCTTTGATTTTTTGGCTTTGAAAATATATATTTCATATAAAATCTAAAAACTAACAGTCTAGTACAGTCTACTAATACTCTAATGACTGCTAGTTGACATGTAGTTGCAAAGTTACTTATAGTTAGTAGAATGTCTAAAGTGGACCATCGAAATAAAGTGTAACTAATAATTTTGTTTTAATTCATTTTAAATAAATTTTATGAATTAAGCAGCTCGTAACATACTTTATCACTAGAAAAATGTAAACCTGAACATGAAAGTATTACGCAATCATTTAAGACAGTTCTCCACTTTGGCATAAAGGGTTCTTTAAACTGAGTCAATATCCCTAGGATTCTATATAGAACTCAATTTTTTTAAGAGCATAGTGATGCAGAAATGACTTGAACTTGAAAATAATGTCACAGTTGAAGTCAATAATTGACTGAAAGGGAAGGGGAGCCATTTTCATGTGAATTTGGATCCATGAGTAATTTGTAGTAATGTAGTAATTTGCAGATGCTCCTTTAATAATCTGCAGAGTGGGCAAACTTCTTTTTTTTTTTTTTTACAAAATAAAATCTAAAAAGCTCCTAATTATAAGTTTAATTTTCTTGATTTCCTATTGATTTTGTGATTAAAATTTGACCCAAACATGTTTCCGACAGGTTCCGTGAGATTCATCCAAATATTGGCTTTCAGTCCAATACTTTATTTAGTGTTTTTACTGTTTTATTTACTGTCTTTCTGCTCAGTTTCTCTGTGATGTATCACTCTCACCAACTCTTCAGTGGGGTCGCTGTGGAAAGGTTCTGGTCGTGGGGGGAATATCTATGAGCCGGACCCCCACATTGCAACTTTCTCTCTCTCCTTTCAAAACACTTTAATAGCATGATAAACATTGCAAAAACATTAAATGGGACCTATTATGACCTATTACAAAGCTTTGATTTTATATGTTTTCATGCTTGAATGTTCAAAAAACACATTATTTTTCTCATATTCTCCATTGTTGCAGCTCCTCTCTTCTCAGTCTGTCAGTAACTCTCTGTTTAGTTCCTGTCTCTATGAAGCCCCTCCTTCTGAAAAGCACAGTGTGCTCTGATTGGTCAACTGGACCAGTGTGTTGTGATTGATCAAGCTCTTCAAGCATGTTTGGGAAATATCCCGCCCCTTACCATAACTGTGAGTTTCAACACACTACTAACTAACTCAACCAGGCCCCGCCCCTTTATTCTGTGTACGCCTTTGGCGGGAATTATTTAAAAGAGGAATATTGTTTGATAACCTTTTCCATTATAAAGAACCTTTTGTGCAATGGAAATATTCCATGCATGTTTAATGTTCATAATGGAACCAAAGATGCCAAAAAAGAACCTTTTATTTTTAAGAGTGTACAAACAATAAAGGCATCAGTTTTTATTGTTTGGCAAGGCAAGCATCACTATTATTATTGCTCATACTTTGGGATAGATGCCTTGTTTTTATGTGTCTTTTTACGTCTCATATCCTGCGGCTCAGTTTGAAATTTGTATTTGTTTGATTTTGAATGAATCGCATTCAGTTTTTCTGGTTCTCTCTCAGTGTCTGTCATTTCATCTTCTCATAAGCTGTGAGCAAGATCCCCTCACACTCTTCTGTGATCTCCAAAGCATCTGTTTTGTACCTCCTTTAATATGCCGTTTTAAAAGAAACATGAGTTCAGTGCAGGTTCTGTCCCTGAGGTGGTTTTGCAGCAGAAACAAACACAGATTCTTCATCCAGGTTATTTTAGCTCATACCATATTATGACTCAGTCTTTGCCAGGCTGCTATATTTGGGGGTTTGGCTCTCCGCAAATGACAAGCTCGCAGTCAAACGAGTGCTGTTACGTCAAGAGAGAGAGATGCTCTGGTAATGAGAGGAAATGATGGGGCAACCCACTAACCTCCGTGCAACCCATCACTGCGTGAAACACGAGCACAATGCAGCTCTGTCTTGCTGTTTAGTATTCTGAGTGAGGGCAGAGAGAGCAGTTCAAACTTTGTTTTAGACACAGAGCTACACTGTGATGGAATAAGGCCATTTAGAAAGAGACAATAGAAAGAAAAAGAAGGGTGAGTGAGTATGGATAGTGTGCTCTGAATTTAGAAAAATCTAGATGTCTGTAAACTTATATTTAAAGAGAGAGAGAGAGAACAGTGCGCCCACTCGCACTTATGTTTGTGTTATAGATCAGCATTAGATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGAAAGAAAAGTCACTAATGAGATCTCTAATGTCTCAAATTTTCTTCTAGACAACAGTTAGATTACATAGTGTTCTGCTTTTCAGATGTTTCTCCTGAGAAAAACACTTGATAATGTTTAGGAGTAGACCTCGAATGGTGCTCAGATACCAAAGTACTGTATGCAATCAAATTGCTCAAAGTTTGCTCTTTCATAGCTAAGGAGACTTAAAGGGGTAGTTCACCCAAAAATTAACTGAAAATTATCCCATAATTTACTCACCCTCAAGCCATCCTACGTGTATATGGCTATCTTCTTTCAGTCAAACACAATCTGAGTTATATTTAAAAATATCCTGGCTCTTCCAAGCTTTATAATGGGAGTGAATGGTACCCAAGTTTTTGAAGCTCAAAAAAAGTGCATTCGTCCATCATAAATATAATCCATACAGCTCCAGGGGGTTAATAAATACCTTCTGAAGCTAAGCGTTTTTGTAAGAAAAATATCCATATTTATAACTTTATAAACTATAATCACTGGCTTCTAGTAACGGCTGCACATGAGTCTAGTTCCGGCGGAAGAGTGAACTTTGTCCCGAAGCATTACGTCTTGATGAACACAGAAGTGCAGAGGATGGTGCAAAACAAAACACCGGTCACGAATTACAAGTCTAAAACAATCATTTTTAGAGAGAAATTTCTGAGGATTTTTATATAGAAGAGGAGCTTGAGTTTGTTGCCCAGCCATATCTGTTTGAACCACGAGAGACGTCTACTCTCACCTAAGCTTACG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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU456864 True 5398 lncRNA 0.37 2 571671 577089

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000242_00546022_00570147 SLC8A2A, SLC8A2B, SLC8A2 coding downstream 1288 545037 ~ 570383 (-)
CI01000242_00508735_00531321 NA coding downstream 40026 508561 ~ 531645 (-)
CI01000242_00499626_00500135 KCNE4 coding downstream 70981 499541 ~ 500690 (-)
CI01000242_00475400_00477268 NA coding downstream 93611 475357 ~ 478060 (-)
CI01000242_00457985_00464094 FLJ13639 coding downstream 107577 456146 ~ 464094 (-)
G398343 NA non-coding downstream 28159 543162 ~ 543512 (-)
G398337 NA non-coding downstream 72930 497978 ~ 498741 (-)
G398308 NA non-coding downstream 133915 429683 ~ 437756 (-)
G398325 NA non-coding downstream 173068 397860 ~ 398603 (-)
G398341 NA non-coding upstream 20409 597498 ~ 598788 (-)
G398345 NA non-coding upstream 21839 598928 ~ 604457 (-)
G398342 NA non-coding upstream 29462 606551 ~ 614248 (-)
CI01000242_00300190_00331091 NA other downstream 240295 300147 ~ 331091 (-)

Expression


Co-expression Network