G426352


Basic Information

Item Value
gene id G426352
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 14115749 ~ 14123481 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU489578
ACTATTATAGTATTTAATAATATTTTGAATTACCTTTTATTTTTAATTTTGTTTCGTTTTAGTGTTTTTGATATGTTGCTTTGTATTTAGCTTAAATGTATTATTATTTCAACTTTTAGTTTTCATAATCTTAGTACGAAATTTAAACTTTTTTTTTTTTCATTAAGTTTTTCATCTAATATATTCATCTAATATTAATACTTTCATTTCAGCTTTATAAAAATCACTTTCAAACAATGCGGCTTTCTGTTGGTCAGCGTGGTGAATCCGCTTGACCAACATCAGCGCGTAGCAAAATCTTGGGAAAATTTTTCAACCTCAAGCGAAATTCCCAATCATGTGGATTCCTAATGAAATTTTTGGACATGAAAATTTTCACTGAACCTTTAGTCCACTAAACAACTATTCTTGCATTGCCAGACCTTTAGACTGATGGTAGAAGAACTGGACTCTATAGCAGCTGTCATTGGACAAGGACTGCACATAGGCTGTCTGACTGACATGTAAAGCAACCAATCACAATTTGCTTTGTTCAGCGGGGTGTGAAAATGTAACAACAAATGTCCCTACAATAACAGACTGGAGTGTAAATCTAACGGATGCATTTTAAAGAGTCTATGCCATACTTTTTTCACATACCTTTAAAAATCCAGTGTTTATTTTCTGATAAGCACTAATTGTCACAGTTGTACACACAACAGCTTTCTTCTTCCATGAAGGGGCGGACAGTTAAAGTCCATTAAATCCTGAAGGATTCATTCAATCAGATGACGACTTTAAAACTCCTGAAGTGTTTCCAATTTTTTGTGCCATATGCATCAGACATTTAGGTAACAGTCCATGGGCGTGATGTCTGACACTGAGACTACTAAACAACTACCCAGAACACCCTAGCAACTGCATGGCAACACAGTAAACACCCGCTCAGATCACCTTCTCAGATCACCGGAATCTACACAGCAATGCCATACATCTCACAACAGCTATATCTCTGTTCATATTCAGTATGAGTGACACTATTTTGCCACGGTTGTCTCAACAAGGGCAGAATATCTACCACAGACAGTCATTATTTTCCTGGGGCATGCAACGTGAATTCAAGGAGTTTGAATTTGTTCCATTAGCATACTAATTGTTTTCAGGTCTTCTCATTTTTGTCACATCACTATAACTAAAGCGCTTATGTCTGTCCTGAAGCATGAGCTTAATGAAATTGGCTCCGGGGTCTTATGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGGAGGTGAGCTCATTAGTCTGTTCATAGACTGCTTTGTTTTGAAGGGGTTTTAGGAGTCAGGACTTCTGATGTTTCCAAAAGCATACACACCTTACACGCACTCAGTGTGTTTGGAGAGTTACAGGGGTCAGCTATGTATTTTAAAATGTAGTCTGGGCAGAAAACAGTGATTTTCAGTGGTTTTGTTTTGACAGTGTGGGATTTCTTTTCGTGAATAGACTCTTAGAGGCCTATTAAGTTGCACGTGAAAAGCACTTTACCTTTTGCTTATTGCCAACTGCTGCTTAGGGGAGTATATTATTTCTGCACCTCTATCATCAGACAGAATTGCAGATTGTTTCTAAATAATCTGCCTTGCACTGTAGAAAAAATATCCTATTAAATTTATAATTTAAAAAATAAAAATGCAGCTGTGCTTGCCAGAAAGTCACTTTAAAAATATGGTGACAAGGTTTCAGGTATTATGATATGGCATACTATATGTGCTTGTATATTTTACAGCTTATAATCATATATTTAATTATGTGGTATAATGTTAATATAACCATCTACTGTTTAACTTTAAATGTACTGGTTCATAATAATACATCATAATAATGCAGGTGGTAAACTATAAAAACCACATAATGAATCAGTTCATCATAAGTGGTCTGTACATAACACATGACCAATACTCGTATATAGATGGTGCACAGGCTCATACACACAAAGATAAAACACCATCAGGGCAGCACACAACACTAAAATTATGTAACAATCATTAACACAAAATTCAACAAAACACCCCAACGCATAAACAAACCAAATTATTTATACAAATTATAATCATATGTGGTGTGTCATGCAGGGACTTCTGGGAATGTCCTTTTGCTGTTTTATACAATAATTCATATATTTACTTGCAAAACCACAAATTTTACAGTAATTTAAGTAAAAATGCATGTGATGTTAAACCATTTACAGTTTTTGACTTTGTATAGTAATATAATTTATAGTTAACCAATTAACAGGTTTTTACAGTAGCATTTTAAGTTGGTGATTTTTACAATCACCTCTTTTAAAGGAATAGTTTACCCACAAAATTATTATTTTATATCATTTACTCACCCTCATGTTATTTCAAACCTTTGTGGAAAATCTGAGTGTTTTGATCCATACAATGAAAGTCAGTGGGGTTCAATGTTGTTTTTGACCCCAGCATTCCTCCCAGTGGCTTAATTTGTATTGTGCGAGGGTGAGTGAATGATGACAGAATTTTAATTTTTAGGTGAACTAACCCTTTAAAACTTATTATGAGAATCACATTAAGAAAAAAAACTGATTCACAAATAAATAATCTTAACGTTGAATCTGTTGAATTGAAGAATTACATGAGAGAGCAGAGAGATGCTTCCAGAGCTTTAGAGAACAGACAGTAGAGTCACATATGTTACCCATCTGTTTCTCTTTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCATTACAACATTAATTATAGAACCTGTTGCTGAGCTCAAATACATGTTTTATAGTATGTTTAACAGTTGAATTAGTAAAATATGTTAGCAAAGTCCTTGTTGAAAACTGCTCTACACAGTTTGCAGCCATCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATAAGCTGATTGGTGCTTTTAAATTAATGGCGGAACTTCCTTATCTGCAGTATATTTGCCGTATTGAGCATTGCAATATCTTGTTGCTAATGTCTCCTCCACTTATAATATCAGTGTCAAAAAAATAATGTCAAATAATGTCAAAGTTAGATATTTAACCAGTGAGAAGGTGTAGTGTTTTGTCAAAGCAAAAGCATCTTATTCATTAGCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTTTCTCTCTCCTCACACAAGTGCTGAGGAAGGTCATTCTTAACCAAAGCAAACATGGTGATATGAATACTAAAATGTCTCCATAATTGCAGATTAAGCAACTGGGGATTATAAAAGAGGACAAATTTAGGTGCCCTGATCAGTCCTTAGAGACTGTTTGAAATGCATCCTTTAAGCAAAATGCTGTTTTGAAAGTATGAGTTTTTAATGGTGATGAAATGTCTGTTTGGGCCAAATCACTAATGAAAAGTGAATATTTTGAACTCGACTGTCACTCTGTGACTATATTGATTTGTCTCAGTTATTGTAACAAATCCCAGCATTGATGTTTTATAGACAGGACACATGCTATTGTTTCCTCCCATCTTAAAGTTTGTCTTCTTTTTTTAAAACCATGAATGCAGTCAGATCCTGGCAGTTGCCTGGTAACAGATGTGCCCGACTGAAATGTTTTTAATAATCAGACCCACGCTTGAATCTGACCTTGTTATTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGTGTGACCTTCACCCTGTATCTCTAATGAGTGTAAGTAGCTCTAACAGGGTTATGCTGCACTGCAAGTGCTAAACGACAGAGAGAATGTGAAGTGTGTTTTACTGACAGGGTTTTGGGAACCTTCAGGACCCGATGCACAGCACAAGTTTATGTTGTTTTTGCTCAGCTCATTATATGTCTGCCCACTGTGTCTTCCTTTTTGAAATAAAAAAGATAACTCAATAGATTATGGCTTGCTTTTTTATATATATATATAGAGTAAGTGCTACCTGTCCATGTTTGTCGATCACATACAGGGGCATACCATAATGACTTTTAAAAATGACTAAATTCGCCCAGATATTTTAAAGAGGTTTGTTTTTTCTTAAACAGTGTGAATGAGGAAAAAAAGTACCTTGTCACATTTTACAATCAAGCAGTTGTTTGCTTTCACAGTGGGCTAAATGAACATGTAAACGGTGAAATGTAATCCCACTGTGGCTAAGGCTACATACTAACATCCACCTTTTAGCAAATCATTTTTTTTATCCTTTAAATAATAAAATAATGTATGAATATATGAATAATAAGTCATTTATGAATATTCATAACCCAAACCATGCCTGTCACAGTTTGTGCATTGAGCTGCTGACAGAAAGTAAACTGCCTTTGAAGAGTTTTATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATTTATATATACAGTATCTCACAAAAGAGAGTACACCCCTCACAGTAACTATTTTAGCATATCTTCTTAAGGGACAATACTATAGAAATGAAACTTATATATATTTTAGAGGAGTCAATGTGCTGCTTGTATAGCAGTATAGATTTACTGTCCTCTGAAAATAACTCAACATACAGCCATTATTGTCTAAATAGCTGGCAACAGAAGTAAGAACAACACTGTTGTGTTGTAAACAAATAGTCATATTTTATCACAATTATATAACTACATAAGCGTGATGCAGTGCAGACCAACATTCCAGTTGGATTCCTTACAATTTGGTTTTTGGTACTGAAAATATAAGTTATCCAAATTTAGATTATAACATGCACATCATTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCAAGCCGTGTAAATGTAACCATATTTAACACTGTGAATCAGTAATGGCAGCTGTATTCTCCTGCTGTGAAAACACAGCCTTTTTTTTAAACCCATATCACATTTCACTGTTCTGGTGAAAAATAAGTGGACTGTAGGTCTACTAAGGTCCAAATCTCTTCCTGTCCTCAACCTTCTGTATCTATCAGACTCAAGAGCTCTTATCTACCTCATTCCCCTGCTGCTGTGCACCACTCTGCTTTTACACTTCCAGATTTGTGTCGGAGTGTCTAAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU489578 True 7592 lncRNA 0.36 2 14115749 14123481

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_14108490_14112755 NA coding upstream 2688 14108490 ~ 14113061 (+)
CI01000304_14011581_14044797 NA coding upstream 70789 14011326 ~ 14044960 (+)
CI01000304_14005720_14006514 CREBZF coding upstream 108889 14005720 ~ 14006860 (+)
CI01000304_13989055_14004354 SYTL2A coding upstream 111223 13989055 ~ 14004526 (+)
CI01000304_13947668_13967998 PICALMA, PICALM, PICA coding upstream 146559 13946158 ~ 13969190 (+)
CI01000304_14131633_14155156 NA coding downstream 7358 14125318 ~ 14155278 (+)
CI01000304_14179009_14221165 NA coding downstream 55528 14179009 ~ 14223133 (+)
CI01000304_14231227_14261460 NA coding downstream 107592 14231073 ~ 14262163 (+)
CI01000304_14304022_14317252 HYOU1 coding downstream 180541 14304022 ~ 14318025 (+)
CI01000304_14331169_14331855 HIST1H2AD.L, HIST2H2AB, H2AFX.L, HIST1H2AH, HIST1H2AJ coding downstream 207583 14331064 ~ 14331973 (+)
G426375 NA non-coding upstream 20127 14085038 ~ 14095622 (+)
G426362 NA non-coding upstream 53705 14051748 ~ 14062044 (+)
G426307 NA non-coding upstream 137587 13976965 ~ 13978162 (+)
G426592 NA non-coding upstream 242631 13872905 ~ 13873118 (+)
G426526 NA non-coding upstream 374189 13739700 ~ 13741560 (+)
G426343 NA non-coding downstream 112396 14235877 ~ 14241431 (+)
G426379 NA non-coding downstream 150996 14274477 ~ 14288222 (+)
G426675 NA non-coding downstream 272902 14396383 ~ 14396619 (+)
CI01000304_13578347_13595075 NA other upstream 536902 13578049 ~ 13595097 (+)
G425718 NA other upstream 1676663 12436554 ~ 12436605 (+)
CI01000304_10555326_10571933 NA other upstream 3560045 10555216 ~ 10572164 (+)
G424251 NA other upstream 3922854 10188822 ~ 10189404 (+)
G424246 NA other upstream 3988427 10116343 ~ 10127322 (+)
G426312 NA other downstream 206567 14330048 ~ 14330886 (+)
G426828 NA other downstream 825409 14948890 ~ 14950592 (+)
G427860 NA other downstream 1761973 15885454 ~ 15889591 (+)
G428017 NA other downstream 1959749 16083230 ~ 16083714 (+)
CI01000304_16505174_16506124 NA other downstream 2381381 16504764 ~ 16513625 (+)

Expression


Co-expression Network