G678447


Basic Information

Item Value
gene id G678447
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01180000
NCBI id null
chromosome length 11503085
location 65156 ~ 111016 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU799086
ATCCAAATATGTGTTCAGCAGAGCAGAGAAACTCATACAGGTTTAAAATGAATAAATGATGGCAGAATTTTCATTTTTGTGTATCCCTTTAAATCAGATTAAGCTGTTTTAAAATGGTCCCACAGCCTGACCAGCTGAAACCAGTTTCAAATATATCACTCACAGGAAGCACTATGGTAGATTATCCTAGTTTTTAGACCATACTTTTATGTAAATACCATGGTAATGATACTATCACTGTAACATTTTTGTTTTAAACGATATGACTGTACAATACCAATTTACAGTGTTGTTCATGATAATTTACATATCTGAGGTGAAAGAAGGTCCAGATATTGAAATGAAAGTAAGCACTCTAAGAAGTCGACATGCATTTTTAAGGTCACATTTGTCATTTTACACTGCCTCCACACGTCTTACTTTTAGTTTCCAGTAAAAACCTGTTACTGGTGGCAATGAAACTTACATTCATAAAAATGCCTTGCTGTGTCTATTGTTCTGTTTCAGATGGGTTTGAAATGACTGTACGTGATCTTCTACTGTTCGGCAGTAGTTTGGTTTAGTTCAGGGGATATAGATCACACCTCGTATTTCAAAGTTGATGCAATTCATCTTTGGCTCTGAGGTTGAGTATGCGAGAGGGAAATCTCTAAATCACTGGGCCTGATTTCTGTCTGATCAGTCAGAATAGAAAAAGCAAACAAGAAGATAAAGAGTGATTAGAAAACCAGCCGTGCGGCCCATAAACTGATGATTTTGAGGGCCTCATGTTTCTCCTAGGTTTCTCTGCCATCTAGTGGACATTTCTCTTAGCTAGCTTCTGAAGTGAAAGCACATTGTCAAAACAGTGATTACTTACAATATTTAAAAAAAAATCAATCATGCTAATAAAATATCTATTTTTATCTACTACTGTACCAAATATTACAAAAGTATTACTTTATGTATGACAATATTCACTTTGAATAAAGACATTTAATACAAGTTTGATCATTTAAACACTCTAATTACATACATTGTAATGTAAATATATAAAATAAAAATATATTTGACACAATTGAATATTTACGCTTGTGAAGAAACAATTTAATTATAATAAAAAGCAACTATTAAGATAAAATGAGTATTGTTTTTAAGTTGATACGTAACTTTGTATATATTGTATGGTAATGGTTTATATCAGCAAATTACGTCATCAGCAGTGAAACATGAAGACCTGTGCGTTTCTAATTTGCTGCTTTTGTCCACTAGGTGGCAGTATTTTCAACATTTTTGACATATGGCCCTTGGTGCAGAACCTGATTTCACTAAGTACTACGTCTTTGTTGATCCTGGAACAACATTCCAATCATCCAATCAGATTTGAGGGACAGTTTATGTCAAGTTTAGTCTTACAAACAAGGTGCTTCTACATCAGTGTTATTCACCTATTCAGGGATAACTTATGGGTAGGTTTTGGGGTAGGGATAGGACTACATTTTTGAAAAGAAATGAAAAAAATATGTTGACTCAGGAACGCGTCTAACTCGGGACGTGCGGCCCTGCGTAACCTAAACTTGCCATACAGTTAATAATCACCGCAGGAAGTCCAGCGTTAATGTTCTGTTAATCATAAACGAATATAGATGAAGTGGTTTCTGCACGTCCTGCACTGGAGTACTGTGTAAACAACATTATATGTGAATGTTGTAATCATATAGTATCATGGTTTAAATTAGTGTAACATAATAATATCATACCCTTAACCCTTAAAAAATTTACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATACACATACTGTACACACATATTTATAATAATGTATCTGTAATAATAATAATAATACCATCTGATATGATCACTGTACCATGGTACTACCACAGTACACACAATATATATATATATACACATCTATATATATGTATATGTATATAGATGTATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATGTATATGTATGTATATTTATATNTATATATATAAGATGGTTTGATGTGATAACAGATAAATGTTACGGTATATAAATAGAAAAAGCATTCACTATGATACACCACAGTGTTAAACAGCCTAGTTATTAATTAGACAGATCAAGATAAGCAGCGATAATGCGTTCACTCCTGCAGTCCTGCACGGTCATTTCTACAGTGAACCTGCTCTGTCATAACCTCCTGATCAACAGCCAGCAAACCTACATGTGAAGCGAGCATCAGTCATCATGTGTCAGGAGGAACGCTGCTCTGTAACCTCTGCAGGATTAAATGCACCGGTCATATGAGCTCAGTCAAATGATTATTGATCGTCTTTAGAGGTGCTCTGTAGCGGAGAGGGCCTATTGTGTTTGACACGCAGCTCTCAGGGTTTGATGGGATACACTGGAGTATCCGTGTCCCTGGAGGAGAGTGTAATAGGAGAGTATTGATCAGGGGTTTTGTGCAGACAGCAGTGAGAATGAATCTAGAGTTTGTTCTCACAGGGTCAGCGGACGAGAGACCCAGCTGCACGCGGGACAGAGGGGGCGTGTCTTTAACAACCCAGCCGTCTTTACTGACACTTATTGACTGTGCATTTATTTTCGGTTTGTTTATAGACATTCCTGCATGCAGAACGCATCGGTATTAGTGTGTAGGAAGCTCTCAGTGCTCTCGCAGGCCAGAGGAACAGTAAAATCCTCTTCAGCCTGTTTTGTCATGCAAATGATGTGCAGTTCCTGTTGATGTAATTGATGCTGCTTGTTTTAGTCAGTAGAGGTGTCACCACAAAATGTTCCAGTTTCATTTTTCAAACTTTTAAACCCATTTCCCAGGTGAAAACGAGAGTGGTAGGAGTTGAGAGTGGATGCATTTTTACCTCAAGTGTGAAACGTCACTGAAGGGCCAAAACTGTGGATGTTTTGACGATCATTTTAGTGTGTTTTATTACAGGTGAACCGTGCAGTTATTTCAGTGTTTAAATTGCTATTTTGTATCCCAGTTTAAGGCAAAACATCACGGGTGAATAAAGTCAAATTTCCCTAGTCAATTAATCACAATACATGAAGGCAATTGTTTTTATTTACAACTTTTCCTAAAATGTTATGTATAAATATTAGTTTTATCGCAATTCGATTAATCGCATCTAACATAAAAGTTTGTAAATATATAGTGTGTCGCAATTAATCGATTTGACAGCACTAATATTTAGTTTTTTCAATCGCGATTAATCTCATCTAACAAAAGTTTGAAAATATTTGTGTGTGTG
>TU799084
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>TU799085
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU799086 False 3284 lncRNA 0.35 2 65156 69558
TU799084 False 517 lncRNA 0.36 2 66915 109709
TU799085 True 1838 lncRNA 0.38 2 66915 111016

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01180000_00009241_00055691 ANAPC1 coding upstream 9206 9241 ~ 55950 (+)
CI01180000_00250154_00256723 LHCGR coding downstream 139138 250154 ~ 258668 (+)
CI01180000_00263000_00297934 MERTK coding downstream 151984 263000 ~ 298466 (+)
CI01180000_00306160_00314770 NA coding downstream 195144 306160 ~ 315744 (+)
CI01180000_00361420_00364335 NA coding downstream 250404 361420 ~ 365126 (+)
CI01180000_00368639_00375465 ZC3H6 coding downstream 257623 368639 ~ 376247 (+)
G678454 NA non-coding downstream 2756 113772 ~ 118958 (+)
G678455 NA non-coding downstream 21784 132800 ~ 138730 (+)
G678446 NA non-coding downstream 62795 173811 ~ 174711 (+)
G678472 NA non-coding downstream 69532 180548 ~ 180803 (+)
G678477 NA non-coding downstream 77317 188333 ~ 188553 (+)
G678440 NA other downstream 36918 147934 ~ 151652 (+)
G678751 NA other downstream 948827 1059843 ~ 1066091 (+)
G678637 NA other downstream 1038535 1149551 ~ 1155672 (+)
G678946 NA other downstream 1407337 1518353 ~ 1612547 (+)
G679076 NA other downstream 1684154 1795170 ~ 1799433 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
tiger barb (Puntius tetrazona) G94913 NA non-coding NC_056711.1 CM032080.1 18900618 ~ 18956194 (+)