XLOC_019734


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_019734
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 32655957 ~ 32660440 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00039669
TGCTAACTCAAATCAAAATTGTAAGTTGGGTGGACATATTTTGAGCTCAGTGTTgagtttacttttaaaaatgagttaactGAAGGTGTAAAACTGGTTTGTTCAATGAAAGTAAATACTTAAGTTGAGCAGACTTTACATTTTGAGTTCTTCACTGGATCATCTACTTCCCGTCTTTGCACATGCTCAGTCTGTCTTCGGGTGCCATTTTGCACGAGGTGTCCTCTCACCAGCAGCAGCTGCCATCTCCTGATTCAGGTAAGCTTTGTTTTAGCTTTATTATCAAAATTAATCTAAATAGCGTGCAAAtctaaagtaaaatgtaatgttatgttcCCAAAAAACTAAGTTACATCGTGTGAAGATCATTTCTGACAAGCTCGGGCTAACAAGCTAGCCACCTGTGAAGTTTGCTTCATTTGAAGGACTGTTTAACGTTAATTTGCTTCTTAAACTGGAGGGAAATGTAGTGAAATATTGTTGTTGCAAACAGACATATCTGAGCGGCCGGTCACCACTGTATTGTTAACCCTGTTGTGTCTGTATTAAAACAGCAATGCGATAacattaaaaccacttcaaaataATATTTAGCATACCACTTTAAATATACAGTCACTAGTAGTGTACATATAGTATTCCAGGAGCTTgtggtttttatgattatttatttggcATACATTAACCATTTATGAGTTAAgtaacatgtatgtatgtattatttaaatcttctctttttatgtttgcaatatttattttatattgtgctttttaaaaacatcagtttaatttatgaaaacaatttgacctgcaatgttacatttttatttacttttttataggtTTGGAATGCAGTGTAAGTTTTGCAAATTTGTAAACAGTAGCTGAGAAGTTACACTACAGGCTACATCGCTATCAAGGACCATCCTGGCAGCAGCCTTGTTTGTTCGCAGACTGCTTCTGCACTTTAAAGACTGTAGGTGCATTAAAATCACATTTGACATTAGCACATTAACAGTCTGCTGCAGTTACTgactatttgatttttttaacctCCTGTAGCCGATGTCCGAAAACAGTGGCCTGCATGTTTTTGGGAGTTTAGGCAAGTTTGCATTTgagattatttatttcaaaatgtataaccCTTGTTCACAATTCAtactattcatttttttatggtCTGTTTGTAGGTCTATGCTGAGTTTTACAGGATTACTCAAACCAACCTCAAAGATACCTTCTCTTTTTCGGATGAATACGCTATCAAGTTTTATGGATCATGTGGTGGGCGATATGGAGAGATAATAAGGACCGCCCTGGACCAACTGGACAATCAAGTAATTATTTAGCATTCAATCATATCACTGAAAAAAGGGGGGCATATTAAACTTTATGGAGTTTACCATGGAGTTTCTCTTTTTGTGTGCAATATTGGAATTCATGCAGGTAATTTATCTTTGAAGTTACAAAACAGTTTGTTCCCTAAAAGAAAAGTTTGTAGCACTGTTTTCACCTCAGTAAAGGATGCTACATTTTCATCACTTAGTCTTTAGTAGAACAACCATGACTGAGTCCGGCTGACCAGGGAGTGAAAACAGGTGCtgcaacaataattataaagcaaatttcatttttaataattaaaacatgttgGGAATTTCTGATGAAAATGACTAACCTGTGAATAACCATAATTAATGCCCTTCAATTGTAAAGTGGTGCCACCTGTCATCTCTCAGGGTCAGAGCATCTGGTTTAATGTGACAATAGCTAATGacctatggcaagccgttttaacttttattctatagcccctactagtatctattttcttgttactagtacttatattttagatactagtattttttacattaagtactagtacttatttattagatactagtacttatttattagatactagtacttatttattagatactagtacttatttattagttactagtacttattaaatagatactagtacttatttgttagttactagtacttatttgttagatactagtacttatttattagttactagtacttatttattagatgctagtacttatttattagatactagtacttatttgttagttactagtacttatttattagatactagtacttattaaatagatactagtacttatttattagatgctagtacttatttattagatactagtacttatttgttagttactagtacttattaaatagatactagtacttattaaatagatactagtacttatttattagatgctagtacttatttattagatactagtacttatttgttagttactagtacttattaaatagatactagtacttattaaatagatactagtacttatttattagttactagtacttatttattagatactagtacttatttattagatgctagtacttatttattagatactagtacttatttgttagttactagtacttatttgttagttactagtacttattaaatagatactagtacttatttattagatgctagtacttatttattagatactagtacttatttgttagttactagtacttattaaatagatactagtacttattaaatagatactagtacttatttattagttactagtacttatttattagatactagtacttattaaatagatactagttcttatttgttagttactagtacttatttattagttactagtacttatttattagatactagttcttatttattagttactagtacttattttaatagtgactagtTACTATTCTGTTGTTACTCGTAATGAATTAAACATTTTCCCATTCATTTCTATGGGATCTCTAATTGAGATATcaactattcagttttgactagtatgtaTTCCAGCTGTGACTAGTGCATATTTTTATCTACTAGTAGTTAATCATTAGGTACTAGTACCTGTTACTGAGATGCTACTACCTaattaatagatactagtacttatgtaTTAGATACTAGTCCTTATTCATcaggtactagtatctatttaatagatactagtacttatttattagatactagtacttattaaatagcttactaatgtttattcatgtagagttgatgcttaacggataatcaattcactatttgctaatgcttattaaatgattcattattaTAAAAGTGTTACCTGAAAAGTTTTATAAATAGAAGGTATATAAATGACTGTGTTACTGACATTACTACCTTCAGTTTCCAAATTAAGTtgctttgcctttgcttttttttaCCTTGCTTTTTGGAGATGTTTGTGATTTAGCAGTAAAAATAGTTTTTCATCctctttttatgtttctttttactGCAGGACACAGAGCCAGAAGATATTTGCACAAAAGAGATGGAGATGGACATCCTTAGCACTGTTGAAGATGATGTTGCCACTCTTCAGACCAACCTAAATGTAAGGTGCCTGTCTGTGGTTCTGGGAGAGCAAATCATGCTGGTAAAGATCTTCCGACAGCTGTTGTTCTCCTCTTTGGTTTGATTAATTTCCTCATTATGAACTACCCCAAAGAACTGAAACACATCTTTGAAACTATTCAGAAAGTGTTTATTGGCCTTGATCCTCAGTGCTCAGCAAGAGTCCagtctttcaaaaacaaaatgaatttgtTTGTACACTGAAATAGTGTTACTCTTGGTGTTGTCACCAAActtaaattcagttttgattttacattttcaaattttaaaaacatccatttcccaccAATTGATAGATTGGCTGTTGTGTTCAAGCgctcaacataaatgactgtgattggctgagaagtTCACCATTTCACTGCTCTTCACTGATGTTCatggagtgcaaacacagatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaactggagTGTTTCAAAACCAAAACGTCGCATAGTCGATCCATCAGCGTAACACTTGTGTCAGCTTATACACAGACCAGTTGATCAATGTGAAATTCttaagtgtccctgtatctgtggttacactcagtaaacagcagtgagtttggtgaactgatgatcttcacGCCCAATCAgtcttttctgttgagcatgtgaacacaatggcaatatAACAGTGTTTAAAACATGGTCAAcaacgctcaaatgttagcaggaaatggacgtttttaaaattataGAACTGATgggtaacaaaattaaaatatcgtGACAAAACTAATTACTTttgcactttgaaaaaaaatgttgatggtgcaagcattttaaatattacttttgctTAACTCGAGCACTTAAAAGGCAATATAGGATTTGAGGATTTACCTTTTTGTTGCCTCTTTTCCTTCACTGGACTGCAGTACATTTCATTTGGACAGAAAGCTGTTTGCAGAATTGTCAATAAATATATTCTTTGATATTGTG

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00039669 True 4484 lncRNA 0.32 1 32655957 32660440

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_019732 si:dkeyp-72g9.4 coding downstream 168873 32476709 ~ 32487084 (-)
XLOC_019731 zgc:123105 coding downstream 188158 32454896 ~ 32467799 (-)
XLOC_019730 gfpt2 coding downstream 219278 32390707 ~ 32436679 (-)
XLOC_019729 mapk9 coding downstream 281301 32349190 ~ 32374656 (-)
XLOC_019728 clk4b coding downstream 354848 32280175 ~ 32301109 (-)
XLOC_019735 cnot6a coding upstream 97161 32757601 ~ 32781612 (-)
XLOC_019736 slc34a1b coding upstream 346210 33006650 ~ 33032716 (-)
XLOC_019737 zgc:194629 coding upstream 398185 33058625 ~ 33090204 (-)
XLOC_019738 CU019662.1 coding upstream 432891 33093331 ~ 33126697 (-)
XLOC_019739 CU019662.2 coding upstream 476508 33136948 ~ 33137083 (-)
XLOC_019727 NA non-coding downstream 377615 32126914 ~ 32278342 (-)
XLOC_019722 CR450753.1 non-coding downstream 1318172 31337670 ~ 31337785 (-)
XLOC_019714 BX936320.1 non-coding downstream 1767583 30886127 ~ 30888374 (-)
XLOC_019712 NA non-coding downstream 1861367 30792655 ~ 30794590 (-)
XLOC_019709 NA non-coding downstream 1997397 30651065 ~ 30658560 (-)
XLOC_019740 NA non-coding upstream 484812 33145252 ~ 33146525 (-)
XLOC_019742 NA non-coding upstream 804835 33465275 ~ 33477963 (-)
XLOC_019743 NA non-coding upstream 976722 33637162 ~ 33646880 (-)

Expression


Co-expression Network