XLOC_019743


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_019743
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 33637162 ~ 33646880 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00039677
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>TCONS_00039678
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Function

GO:

id name namespace
GO:0055085 transmembrane transport biological_process
GO:0006811 ion transport biological_process
GO:0006820 anion transport biological_process
GO:0022857 transmembrane transporter activity molecular_function
GO:0008509 anion transmembrane transporter activity molecular_function
GO:0015293 symporter activity molecular_function
GO:0015294 solute molecular_function
GO:0005215 transporter activity molecular_function
GO:0015370 solute molecular_function
GO:0015075 ion transmembrane transporter activity molecular_function
GO:0015103 inorganic anion transmembrane transporter activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00039677 False 1121 lncRNA 0.39 5 33637162 33638641
TCONS_00039678 True 9645 lncRNA 0.34 2 33637162 33646880

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_019742 NA coding downstream 159199 33465275 ~ 33477963 (-)
XLOC_019741 rbm22 coding downstream 407212 33211306 ~ 33229950 (-)
XLOC_019740 NA coding downstream 490637 33145252 ~ 33146525 (-)
XLOC_019739 CU019662.2 coding downstream 500079 33136948 ~ 33137083 (-)
XLOC_019738 CU019662.1 coding downstream 510465 33093331 ~ 33126697 (-)
XLOC_019744 ebf1b coding upstream 78099 33724979 ~ 33995710 (-)
XLOC_019745 rnf145b coding upstream 354832 34001712 ~ 34032650 (-)
XLOC_019746 BX510996.1 coding upstream 434838 34081718 ~ 34101917 (-)
XLOC_019747 alg13 coding upstream 586612 34233492 ~ 34261784 (-)
XLOC_019748 dacha coding upstream 717576 34364456 ~ 34658266 (-)
XLOC_019737 zgc:194629 non-coding downstream 546958 33058625 ~ 33090204 (-)
XLOC_019734 NA non-coding downstream 976722 32655957 ~ 32660440 (-)
XLOC_019755 NA non-coding upstream 1998658 35645538 ~ 35650096 (-)
XLOC_019757 NA non-coding upstream 2407604 36054484 ~ 36055407 (-)
XLOC_019765 BX649250.1 non-coding upstream 3426071 37072951 ~ 37073080 (-)
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XLOC_019769 NA non-coding upstream 3947471 37594351 ~ 37632708 (-)

Expression


Co-expression Network