XLOC_020162 (CABZ01077217.1)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_020162
gene name CABZ01077217.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 8313513 ~ 8326972 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00040125
CTCCATCTTCAAGCAGCCAGTGGTGTATGTTAAGCATTGAAGACAAGGCTGTGTGTGGTATCTCTGGCCTTGAAGAACTGTTTGCCTCATTCAACAATTTCAACCTCCAGTATCAGAAAGAGGCAGAAAGTCACCCTTGGGTTCAGAGGTGTGTCTGGTGCTGATGGACTGGAGTCAGTGTCAGTGATGGAGGGAGATTCAATCACTCTATACCCTGGTGTCACTGATATACAGAAAAATATGTTGATTTATAAGTTTGGAGCAGAAGGCGCTTTCATAGCTCTCAAAGATGGAAATCACATCTCAGTAAATTATGATGTTTCTAATGAGGGATTCAAAGGCAGATTACATCTAGATCAGACTGGAGCACTGACCATCAGTGACAGCAAAACCTCAGACTCTGGAGTTTATGAACTAAATATCATAGGAGGAAGAGAAGATCAAGTCAAGAAATTTTGTGTCACTATCTATCcTCGTCTACCTGCTCCTGACATTATCAGAACTTGCCCACAAAATTCATCTTCATCAGTATCTGAACATTTAGAGGTGTCCAGATGTGAGCTGctgtgttcagtggtgaatgtgagtgctgtgagtctctcctggtacaaaggaaacagtatattgtccagcatcagtgtgtctgatctcagcagcagtctctctctacctctggaggtggaaCATCAGGATAACaacacctacagctgtgtgaTAAACAACACCATCAGCAACCAGACCACAAATCTGGACATCACCACACTCTGTCAATCATGTGAAGGTGTGTCAACAAAAGCTTTTTTAAGTCCAAATGTTGTGAAATTCCAAACAAATAACCTCATACAGCAACCTTTATTTCTTTTTAGAATGTCCATGCTGTGGTTCTGTCGAAAGTGTGATGAGATTGGTCATCTCTGCTCTGGTGGGCGTGGCTGCTGCTGCTTTTGTGGTTGAAGACATAAGATCCAGAAAGGGAGAACAGGAGAACAGAGAGGAGACAAGCTGTTAACAATTTTGGCAAATTACACAGCATTCTACTGTAATATGAATTAGGGCTGAGCTAATAATTGAaaattcgatttcgattttggcttcttacgattatgaaaaaacattaatcgagataaaacgATTAATGCATCATATACCACCCCTTTCCAGTTGTatacatttgttgctctgcaaagctcagtttcacgtgtacatgactaaaagcatgtactgtaatgtcacgtctgcagcacgggatgcgcatcattaaCTGATGTACATTTgaatcatttatgtttttaaaagcatgagaGAGAGACTCAAAGaccagcagagcacacacatcctAAGTCATCTTAATgagagcgctttaatggtcaaataagTGTCAAAaatgcggtgtttagtgattattcatattaactctcatttgtgtaataaacaaacgagaatcaaaagacatgtgaatgaGAAACCATAAACAGAATcgtactgctcttaaagtgacagtgcgcaatattcctgctgccgactgtttttatcattaatcaaacaacaaaaggagaaaatcacgAGATATTTAAAGcaaagtttgtttcatatttttattctagtgtaattttccttatttacagggaggaaaataacaatatatacagttgaagtcagaattattagccctcttcaaTTAATAGCGACCCCTCTCCgccatagttttaataactcttataCTCTTTCATAActtttatctttatctttttgTATTATGAGCATAAATGATCAAAAAAACTTTGTGTAAACCTTTATACTTCCTAAATCTACTTTGtaataatatttgttaatatttgcGCTGCACAAATCAATTCAATTTGCTGTTTTTATtgaataaattgtattattattattattgatgcgACTACATCATTGACTCCTCCTCTTTTGAATTCGGTGTACTAGTATTTTATTTGAATACTAACATTTTTACATTCTTGCTAGAAATCACACTTGACAGTGTAGTTGTCAATCATCAGAGATCTAGCCCATGTAGAGTGCTGGAGAACTACAAGTCTGCCAccatatgaactacaactcccttcaggcaccacacacacacacacctgttctggtTTACCTTTGATTACACACAGCATGGGAGCTGCTCAAGAGCTGATCACTCAGACtataggtgcatcccaaatcgcatacttatgcaatattctatgccattttgtagagTAAATaatgtaagtagtgcattcacactgaaagctgtaaaaataataattcactttaattaacctgatgatgcacttattcaagtGCTataatgaagtgtggaatgatggacacacTCGACAGCCGCAGGTTTGCTAATGTTGTGGAAGGGGCAACgctatttattttagattgtgaaagcaaaattctcctaggagagtgattatagcgcctctgatggtgaatgcagttataatcatggcaggtattatttggtactttggtcatttatttcactaatttgacCACCGTCAAACATTAttagggaaatggtttgaatttccacatagtaaaaaaacattagtgtagTGTGGAACGACACTAATTAtacactatgctgttgagtgtgtaagtacataagtacatagtgcataagtacatagtgtataatgtgctatttgggacgcagcttatataAACTGCTCAGATTGACactctcattgctgagtcttgttacaGGTAGCAATTCTAAGCATATTATCCAGCCTAGGCTTTCTGTGTATTAATCCTTGACTTGTTTTTAGTGTCTTGATTCTCTGTTGCCTAGCCTGACTATTTACCTGTTTAAACTACGAATTCGGAATTCGGTTTTGCTtctgtgttgaccattgcctgcctaaCCATTCTCTTTTGAATAAAGTGCTGCACGTGGATCCACAACTTTGCCAGCGTTTCCTTAGTTACAAACTTCTGGAGGTCTGGCCTCAATAAATCAAAATTGACTTTACTTTTTTACACCACTTTGGTAATGTAAATAAGCtctcatttaataagaatatgtcaataactcaattttgacaaaaaatgtcagatagaaccttataattctaaggtgacgaagtgGTTCCATACCTTTgagtttatatattgttttacactGAAAGGGGACATTTTGAACA
>TCONS_00040124
CTCCATCTTCAAGCAGCCAGTGGTGTATGTTAAGCATTGAAGACAAGGCTGTGTGTGGTATCTCTGGCCTTGAAGAACTGTTTGCCTCATTCAACAATTTCAACCTCCAGTATCAGAAAGAGGCAGAAAGTCACCCTTGGGTTCAGAGGTGTGTCTGGTGCTGATGGACTGGAGTCAGTGTCAGTGATGGAGGGAGATTCAATCACTCTATACCCTGGTGTCACTGATATACAGAAAAATATGTTGATTTATAAGTTTGGAGCAGAAGGCGCTTTCATAGCTCTCAAAGATGGAAATCACATCTCAGTAAATTATGATGTTTCTAATGAGGGATTCAAAGGCAGATTACATCTAGATCAGACTGGAGCACTGACCATCAGTGACAGCAAAACCTCAGACTCTGGAGTTTATGAACTAAATATCATAGGAGGAAGAGAAGATCAAGTCAAGAAATTTTGTGTCACTATCTATCcTCGTCTACCTGCTCCTGACATTATCAGAACTTGCCCACAAAATTCATCTTCATCAGTATCTGAACATTTAGAGGTGTCCAGATGTGAGCTGctgtgttcagtggtgaatgtgagtgctgtgagtctctcctggtacaaaggaaacagtatattgtccagcatcagtgtgtctgatctcagcagcagtctctctctacctctggaggtggaaCATCAGGATAACaacacctacagctgtgtgaTAAACAACACCATCAGCAACCAGACCACAAATCTGGACATCACCACACTCTGTCAATCATGTGAAGAATGTCCATGCTGTGGTTCTGTCGAAAGTGTGATGAGATTGGTCATCTCTGCTCTGGTGGGCGTGGCTGCTGCTGCTTTTGTGGTTGAAGACATAAGATCCAGAAAGGGAGAACAGGAGAACAGAGAGGAGACAAGCTGTTAACAATTTTGGCAAATTACACAGCATTCTACTGTAATATGAATTAGGGCTGAGCTAATAATTGAaaattcgatttcgattttggcttcttacgattatgaaaaaacattaatcgagataaaacgATTAATGCATCATATACCACCCCTTTCCAGTTGTatacatttgttgctctgcaaagctcagtttcacgtgtacatgactaaaagcatgtactgtaatgtcacgtctgcagcacgggatgcgcatcattaaCTGATGTACATTTgaatcatttatgtttttaaaagcatgagaGAGAGACTCAAAGaccagcagagcacacacatcctAAGTCATCTTAATgagagcgctttaatggtcaaataagTGTCAAAaatgcggtgtttagtgattattcatattaactctcatttgtgtaataaacaaacgagaatcaaaagacatgtgaatgaGAAACCATAAACAGAATcgtactgctcttaaagtgacagtgcgcaatattcctgctgccgactgtttttatcattaatcaaacaacaaaaggagaaaatcacgAGATATTTAAAGcaaagtttgtttcatatttttattctagtgtaattttccttatttacagggaggaaaataacaatatatacagttgaagtcagaattattagccctcttcaaTTAATAGCGACCCCTCTCCgccatagttttaataactcttataCTCTTTCATAActtttatctttatctttttgTATTATGAGCATAAATGATCAAAAAAACTTTGTGTAAACCTTTATACTTCCTAAATCTACTTTGtaataatatttgttaatatttgcGCTGCACAAATCAATTCAATTTGCTGTTTTTATtgaataaattgtattattattattattgatgcgACTACATCATTGACTCCTCCTCTTTTGAATTCGGTGTACTAGTATTTTATTTGAATACTAACATTTTTACATTCTTGCTAGAAATCACACTTGACAGTGTAGTTGTCAATCATCAGAGATCTAGCCCATGTAGAGTGCTGGAGAACTACAAGTCTGCCAccatatgaactacaactcccttcaggcaccacacacacacacacctgttctggtTTACCTTTGATTACACACAGCATGGGAGCTGCTCAAGAGCTGATCACTCAGACtataggtgcatcccaaatcgcatacttatgcaatattctatgccattttgtagagTAAATaatgtaagtagtgcattcacactgaaagctgtaaaaataataattcactttaattaacctgatgatgcacttattcaagtGCTataatgaagtgtggaatgatggacacacTCGACAGCCGCAGGTTTGCTAATGTTGTGGAAGGGGCAACgctatttattttagattgtgaaagcaaaattctcctaggagagtgattatagcgcctctgatggtgaatgcagttataatcatggcaggtattatttggtactttggtcatttatttcactaatttgacCACCGTCAAACATTAttagggaaatggtttgaatttccacatagtaaaaaaacattagtgtagTGTGGAACGACACTAATTAtacactatgctgttgagtgtgtaagtacataagtacatagtgcataagtacatagtgtataatgtgctatttgggacgcagcttatataAACTGCTCAGATTGACactctcattgctgagtcttgttacaGGTAGCAATTCTAAGCATATTATCCAGCCTAGGCTTTCTGTGTATTAATCCTTGACTTGTTTTTAGTGTCTTGATTCTCTGTTGCCTAGCCTGACTATTTACCTGTTTAAACTACGAATTCGGAATTCGGTTTTGCTtctgtgttgaccattgcctgcctaaCCATTCTCTTTTGAATAAAGTGCTGCACGTGGATCCACAACTTTGCCAGCGTTTCCTTAGTTACAAACTTCTGGAGGTCTGGCCTCAATAAATCAAAATTGACTTTACTTTTTTACACCACTTTGGTAATGTAAATAAGCtctcatttaataagaatatgtcaataactcaattttgacaaaaaatgtcagatagaaccttataattctaaggtgacgaagtgGTTCCATACCTTTgagtttatatattgttttacactGAAAGGGGACATTTTGAACA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000079145

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00040125 False 3164 mRNA 0.37 3 8313513 8326972
TCONS_00040124 True 3079 mRNA 0.38 4 8313513 8326972

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020160 CABZ01077220.1 coding upstream 39134 8272393 ~ 8274379 (+)
XLOC_020159 CABZ01077220.2 coding upstream 47864 8265533 ~ 8265649 (+)
XLOC_020158 CABZ01034698.1 coding upstream 294599 8012532 ~ 8018914 (+)
XLOC_020157 NA coding upstream 384241 7921536 ~ 7929272 (+)
XLOC_020156 si:ch73-44m9.2 coding upstream 518320 7792791 ~ 7795193 (+)
XLOC_020163 CABZ01077217.2 coding downstream 1405 8328377 ~ 8331669 (+)
XLOC_020164 NA coding downstream 12233 8339205 ~ 8356509 (+)
XLOC_020165 si:dkey-19a16.11 coding downstream 38933 8365905 ~ 8369853 (+)
XLOC_020166 NA coding downstream 48794 8375766 ~ 8495359 (+)
XLOC_020167 CABZ01061501.1 coding downstream 80735 8407707 ~ 8440399 (+)
XLOC_020152 NA non-coding upstream 340644 7677231 ~ 7972869 (+)
XLOC_020151 NA non-coding upstream 341169 7676352 ~ 7972344 (+)
XLOC_020171 NA non-coding downstream 243133 8570105 ~ 8574907 (+)
XLOC_020174 NA non-coding downstream 294326 8621298 ~ 8761630 (+)
XLOC_020176 CR450686.2 non-coding downstream 368124 8695096 ~ 8699930 (+)

Expression



Co-expression Network