LOC110523723 (rnf34)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110523723
gene name rnf34
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 36931737 ~ 36957641 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021602665.2
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Function

symbol description
rnf34 Enables several functions, including p53 binding activity; ubiquitin protein ligase activity; and ubiquitin protein ligase binding activity. Involved in several processes, including cellular protein metabolic process; negative regulation of apoptotic process; and negative regulation of signal transduction by p53 class mediator. Located in cytoplasm; nuclear body; and plasma membrane.

NR:

description
E3 ubiquitin-protein ligase RNF34-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021602664.2 False 3000 mRNA 0.48 8 36931738 36957641
XM_021602663.2 True 3038 mRNA 0.49 9 36931747 36957641

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
lrrc75bb LOC106564666 coding upstream 48512 36828476 ~ 36883225 (+)
ggt5b ggt5 coding upstream 125985 36797363 ~ 36805752 (+)
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LOC110523726 LOC105014888 coding downstream 70590 37028231 ~ 37032623 (+)
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Expression


Co-expression Network