XLOC_024385


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024385
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 1946368 ~ 1951444 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00049306
GCGGGATTATCCGGTGTCAGTTTCACGTGAGGCTATATAAATACAGCACGGGTGCAGTGTGACTCTCATACGcggttattaataataacaaaataaaatctttaacaaACATCCCAAGGCATATATTGGCCGATAAGTTCATCCAGTGTGGCCCTAAAAATACATCGACATATAAGTCAGCACTGCTCTTCACTTTTTCCTCCATGCAGCTTGTGACACTACAGAGTTTGGGGTTTCCAGAGAGGAAAAAAAGGTCAGGCCTTACACATGCTCACCGCACACATATCAGGAAAAAGCGTTACTGTGTGGCCGAGGGGTTAAAAAAAGATTTGGGGGGAGCGAGAGAGAGGAACTTCCCTGAGTATCGGCCGCTGCGGTCAACTTTACGATACGGAGAGAAAAAAACTGGGGTGTCAGGCATAAGAGTTATGGAAACCAAACGACAGCTGTTAATATTAGCAGCAAAGATGAAAGGTCTGCAAAATAAACATGACAGACGCACAAACGTAACAACTAGGGTCAGAAATGTACTTCGCTTTTTGAGGAGCTGATATTTCAACgttctttttttttaacgttAGTAATTGTCCTTTTAATTGTATCTACGGTAATCTAAAATTGGTCACCGTGTTCATAAGAAAATTTAAAGGCATCTCATTGGTCGTTGTGGTTTAAAGCCAATCTAAAAGCCTCCGATTGGTCATTGCATTCAAAAGCATATTTAAACACGGCTCTACATGTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAAAGCAATGCCTATGATTGGATGTTATATTCGTAAGCATTTTAAACATTAGCAAATGTTTTTGATTGGTCATTGTATTCGTAACGCAATGCCTGTGATTGGTTGTTATATTCGTAAACATTTGTAAACACCACAAAATGTTTTTGATTGGTCATTGTATTCATAAATCAAAGCCTCTGATTGGTTGTTGCATTCCTAAGCATGTTTAAAGACGGCTctacatgttttttatttgtcgTTGTATTCGTAAAGCAATGCCTATGATTGGATGTTATATTCGTAAGCATTTTAAACATTAGCAAATGTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAACGCAATGCCTGTGATTGGTTGTTACATTTATAAGCATTTGTAAACAAGACTAAATGTTTTTGATTGGTCGTATTCGTAAAGCAATGCCTCTGATTGGTTGTTATATTCGTAAACATTTGTAAACACCACAAAATGTTTTTGATTGGTCATTGTATTCATAAATCAAAGCCTCTGATTGGTTGTTGCATTCCTAAGCATGTTTAAAGACGGCTctacatgttttttatttgtcgTTGTATTCGTAAAGCAATGCCTATGATTGGATGTTATATTCGTAAGCATTTTAAACATGAGCTAATGTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAATGCAATGCCTGTGATTGGTTGTTACATTCATAAGCATTTGTAAACCCGGCTCTAAATGGTTTTGATTGGTTGTTGTATTCGTAAAGCAATGTCTCTGATTGGTTGTTGCATtcattagcatatttaaacaCGACTCCAGATGTTTTTGATTGGTCATTGTATTCATAAAGCAAAGCCTCTGATTGGTTGTTGCATTCCTAAGCAAGTTTAAACACAGCTCTTCATGTTTTTGATTAGTCATTGTATTCGTAAAGCAATTCCTAAGATTGGACGTTATATTCGTAAGCATTTTAAACACGACCAAATGTTTTCGATTGGTCATTGCATTCATAACGCAATGCCTCTGATTGGTTGTTACATTCGCAAGCTTTTGTAAACACGACTCTAAATTTTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAAAGCGATGTCTTTGATTGGTTGTTACATTCATAAGCACATTTAAACACAGCTCTAAATGTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAAAGCATAACCTCTGATTGGTTGTTACGTTCATAAGCGCATTTAAACACAGCTCTAAATGTTTTTGATTGGTCGTTGTATTCGTAAAGCAATGGCTCTGATTGGTTGTTGCATTCATAAGATGTACATTCATCAAACTAATCAAGCTATTCAAGACTCTTGAACACCATGATTaattggatcaggtgtgtttatttagggttggagcaaaactgtgcagagctgcggccctccagcaattgagtttgagacccacgTTGGAACTCGGCATACTACATCCTCCATTTTCTCATGATCAAGTGACCTACCCGCTTCAGTTACATCGcttctcccattcatgaattctctcggggggcatcatgggatagcatagtgtgCATCGGATGCAGACTTTAGAGTCTCAATGGAATTAGTAGGTGATCTGGGTACCTGtcacatactgatttttgaattctatgattTCGGACACAGTACTTGGCTCGTATAcagattttagcatactatattgtcttaatattagttaaaagtctgtaaaaataccacaataaaaACTTGTTAATTAGCCAAGATGACATTTTCCTAGTAAAAtgg

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00049306 True 2510 lncRNA 0.37 2 1946368 1951444

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024384 SLC6A13 coding downstream 225632 1695547 ~ 1720736 (-)
XLOC_024383 mon2 coding downstream 258887 1631828 ~ 1687481 (-)
XLOC_024382 dre-let-7i coding downstream 316619 1629655 ~ 1629749 (-)
XLOC_024381 NA coding downstream 320450 1624880 ~ 1625918 (-)
XLOC_024380 CR354429.1 coding downstream 475183 1464379 ~ 1471185 (-)
XLOC_024386 CR385026.2 coding upstream 22080 1973524 ~ 1974290 (-)
XLOC_024387 wnt7bb coding upstream 51271 2002715 ~ 2081371 (-)
XLOC_024388 CR385026.1 coding upstream 61233 2012677 ~ 2013391 (-)
XLOC_024389 NA coding upstream 175372 2126816 ~ 2165034 (-)
XLOC_024390 NA coding upstream 324081 2275525 ~ 2299749 (-)
XLOC_024375 CU861469.1 non-coding downstream 750256 1195282 ~ 1196112 (-)
XLOC_024369 NA non-coding downstream 1303262 630933 ~ 643106 (-)
XLOC_024391 NA non-coding upstream 357970 2309414 ~ 2313033 (-)

Expression


Co-expression Network