XLOC_024389


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024389
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 2126816 ~ 2165034 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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GO:0043233 organelle lumen cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko05169 Epstein-Barr virus infection
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000097946

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00048222 False 1077 lncRNA 0.48 3 2126816 2131450
TCONS_00048221 False 931 lncRNA 0.49 3 2126816 2131461
TCONS_00049307 False 34146 lncRNA 0.36 2 2126816 2162022
TCONS_00049308 True 38219 lncRNA 0.36 1 2126816 2165034

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024387 wnt7bb coding downstream 45445 2002715 ~ 2081371 (-)
XLOC_024388 CR385026.1 coding downstream 113425 2012677 ~ 2013391 (-)
XLOC_024386 CR385026.2 coding downstream 152526 1973524 ~ 1974290 (-)
XLOC_024385 NA coding downstream 175372 1946368 ~ 1951444 (-)
XLOC_024384 SLC6A13 coding downstream 406080 1695547 ~ 1720736 (-)
XLOC_024390 NA coding upstream 110491 2275525 ~ 2299749 (-)
XLOC_024391 NA coding upstream 144380 2309414 ~ 2313033 (-)
XLOC_024392 mrps35 coding upstream 168224 2333258 ~ 2355107 (-)
XLOC_024393 NA coding upstream 318078 2483112 ~ 2485048 (-)
XLOC_024394 BX957346.1 coding upstream 381309 2546343 ~ 2638817 (-)
XLOC_024382 dre-let-7i non-coding downstream 497067 1629655 ~ 1629749 (-)
XLOC_024381 NA non-coding downstream 500898 1624880 ~ 1625918 (-)
XLOC_024395 BX957346.3 non-coding upstream 507457 2672491 ~ 2685982 (-)

Expression


Co-expression Network