XLOC_034578


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_034578
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 15603053 ~ 15610261 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00069165
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>TCONS_00069164
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00069165 False 6913 lncRNA 0.34 3 15603053 15610261
TCONS_00069164 True 6719 lncRNA 0.34 2 15603053 15610261

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_034577 ANPEP coding downstream 189865 15373412 ~ 15413188 (-)
XLOC_034576 si:ch211-276a23.5 coding downstream 233011 15341333 ~ 15370042 (-)
XLOC_034575 si:dkey-172h23.2 coding downstream 345830 15087193 ~ 15257223 (-)
XLOC_034574 NA coding downstream 518636 14995845 ~ 15084417 (-)
XLOC_034573 NA coding downstream 970214 14591067 ~ 14632839 (-)
XLOC_034579 rcn1 coding upstream 208517 15818778 ~ 15830251 (-)
XLOC_034580 NA coding upstream 286707 15896968 ~ 15900453 (-)
XLOC_034581 elp4 coding upstream 295430 15905691 ~ 16034324 (-)
XLOC_034582 BX957347.2 coding upstream 464955 16075216 ~ 16149267 (-)
XLOC_034583 BX957347.1 coding upstream 504039 16114300 ~ 16114428 (-)
XLOC_034571 dre-mir-7a-2 non-coding downstream 1152433 14450524 ~ 14450620 (-)
XLOC_034569 NA non-coding downstream 1221059 14353514 ~ 14381994 (-)
XLOC_034568 NA non-coding downstream 1250421 14312173 ~ 14352632 (-)
XLOC_034584 NA non-coding upstream 562309 16172570 ~ 16174329 (-)
XLOC_034585 CT030144.2 non-coding upstream 566586 16176847 ~ 16181592 (-)

Expression


Co-expression Network