G2085911


Basic Information

Item Value
gene id G2085911
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 44360820 ~ 44363795 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2385422
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>TU2385419
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>TU2385420
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>TU2385421
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>TU2385423
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>TU2385424
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Function

NR:

description
Kalirin

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2385422 False 2886 lncRNA 0.39 3 44360820 44363795
TU2385419 False 2711 lncRNA 0.39 3 44360886 44363795
TU2385420 False 2554 lncRNA 0.39 3 44360886 44363795
TU2385421 False 2753 lncRNA 0.39 2 44360886 44363795
TU2385423 False 2716 lncRNA 0.39 3 44360886 44363795
TU2385424 True 2878 lncRNA 0.38 2 44360886 44363795

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508097 LOC105006673 coding upstream 127997 44111550 ~ 44232823 (+)
LOC110507242 NA coding upstream 258929 44100049 ~ 44101891 (+)
cldn8 LOC106581534 coding upstream 262784 44095444 ~ 44098036 (+)
zgc:110333 LOC106581535 coding upstream 270605 44088591 ~ 44090215 (+)
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cadm2b LOC106581539 coding downstream 504192 44867987 ~ 45361689 (+)
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G2085973 NA non-coding downstream 60056 44423851 ~ 44424709 (+)
G2085974 NA non-coding downstream 74872 44438667 ~ 44441755 (+)
G2085976 NA non-coding downstream 75960 44439755 ~ 44440818 (+)
G2085314 NA other upstream 241581 44118223 ~ 44119239 (+)
G2085122 NA other upstream 626926 43732395 ~ 43733894 (+)
G2085037 NA other upstream 828242 43532270 ~ 43532578 (+)
G2084659 NA other upstream 1296563 43063288 ~ 43064257 (+)
G2084156 NA other upstream 2099183 42260523 ~ 42261637 (+)
G2085969 NA other downstream 44258 44408053 ~ 44410050 (+)
G2087149 NA other downstream 1433304 45797099 ~ 45798593 (+)
G2087569 NA other downstream 1959289 46323084 ~ 46323694 (+)

Expression


Co-expression Network