G191270


Basic Information

Item Value
gene id G191270
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 2265506 ~ 2390590 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU259686
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>TU259688
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>TU259695
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>TU259699
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>TU259700
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>TU259701
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Function

GO:

id name namespace
GO:0006886 intracellular protein transport biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU259686 True 1478 lncRNA 0.41 2 2318450 2319985
TU259688 False 1325 lncRNA 0.40 3 2318450 2319985
TU259695 False 1240 lncRNA 0.37 2 2319193 2320857
TU259699 False 1213 lncRNA 0.40 3 2306732 2319985
TU259700 False 494 lncRNA 0.50 3 2265506 2390590
TU259701 False 1317 lncRNA 0.41 4 2275594 2319985

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120548117 LOC103362069,LOC108229017,LOC106525817,LOC101169632,LOC101471088,LOC100695262 coding upstream 65049 2193300 ~ 2200457 (+)
trnat-agu_15 NA coding upstream 144041 2121392 ~ 2121465 (+)
trnat-agu_14 NA coding upstream 146686 2118747 ~ 2118820 (+)
trnat-agu_12 NA coding upstream 212505 2052927 ~ 2053001 (+)
trnat-ugu_6 NA coding upstream 219687 2045746 ~ 2045819 (+)
rps27a rps27a coding downstream 114177 2504767 ~ 2508381 (+)
LOC120548433 NA coding downstream 138590 2529180 ~ 2637276 (+)
LOC120548306 NA coding downstream 267267 2657857 ~ 2663678 (+)
LOC120548310 NA coding downstream 438469 2829059 ~ 2829748 (+)
znf365 znf365,LOC100708019,LOC101465348,LOC102787219 coding downstream 733177 3123767 ~ 3137751 (+)
G191245 NA non-coding upstream 32116 2144673 ~ 2233390 (+)
G191242 NA non-coding upstream 36400 2210033 ~ 2229106 (+)
G191219 NA non-coding upstream 58089 2145758 ~ 2207417 (+)
G191246 NA non-coding upstream 65853 2199414 ~ 2199653 (+)
G191247 NA non-coding upstream 67653 2179179 ~ 2197853 (+)
G191306 NA non-coding downstream 31289 2421879 ~ 2435635 (+)
G191307 NA non-coding downstream 32263 2422853 ~ 2425022 (+)
G191309 NA non-coding downstream 46472 2437062 ~ 2495205 (+)
G191310 NA non-coding downstream 54083 2444673 ~ 2453563 (+)
G191323 NA non-coding downstream 105855 2496445 ~ 2500210 (+)
G191236 NA other upstream 160809 2047957 ~ 2104697 (+)
G191230 NA other upstream 261278 2002812 ~ 2004228 (+)
G191212 NA other upstream 316272 1948390 ~ 1949234 (+)
G190785 NA other upstream 485524 1701556 ~ 1779982 (+)
G190758 NA other upstream 649960 1581834 ~ 1615546 (+)
G191565 sptbn1 other downstream 365564 2756154 ~ 2761679 (+)
G191567 sptbn1 other downstream 371460 2762050 ~ 2766062 (+)
G191571 NA other downstream 380043 2770633 ~ 3018448 (+)
G191573 sptbn1,LOC107396444 other downstream 384718 2775308 ~ 2778367 (+)
LOC120548437 NA other downstream 703377 3093967 ~ 3110958 (+)

Expression


Co-expression Network