G191595


Basic Information

Item Value
gene id G191595
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053130.1
NCBI id CM020927.1
chromosome length 36824488
location 2964930 ~ 2965680 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU260221
tctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactgctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactattgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctacatactactctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactgctctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgtt
>TU260222
tctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactgctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactattgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactgctctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgtt
>TU260223
tctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactgctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactattgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgttgtctctctacatactgctctctactgctgtctctctacatactactctctactgctgtctctctacatactactctctactgtt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU260221 False 587 lncRNA 0.41 2 2964930 2965680
TU260222 True 643 lncRNA 0.41 2 2964930 2965680
TU260223 False 531 lncRNA 0.41 2 2964930 2965680

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120548310 NA coding upstream 135182 2829059 ~ 2829748 (+)
LOC120548306 NA coding upstream 301252 2657857 ~ 2663678 (+)
LOC120548433 NA coding upstream 327654 2529180 ~ 2637276 (+)
rps27a rps27a coding upstream 456549 2504767 ~ 2508381 (+)
LOC120548117 LOC103362069,LOC108229017,LOC106525817,LOC101169632,LOC101471088,LOC100695262 coding upstream 764473 2193300 ~ 2200457 (+)
znf365 znf365,LOC100708019,LOC101465348,LOC102787219 coding downstream 158087 3123767 ~ 3137751 (+)
trnar-acg_20 NA coding downstream 184134 3149814 ~ 3149886 (+)
trnah-gug_17 NA coding downstream 184793 3150473 ~ 3150544 (+)
adob ado,LOC107097159,LOC103372108 coding downstream 207925 3173605 ~ 3176172 (+)
kif11 kif11 coding downstream 249564 3215244 ~ 3250866 (+)
G191594 NA non-coding upstream 12312 2952230 ~ 2952618 (+)
G191582 NA non-coding upstream 69864 2835634 ~ 2895066 (+)
G191581 NA non-coding upstream 70725 2825671 ~ 2894205 (+)
G191588 NA non-coding upstream 81578 2882983 ~ 2883352 (+)
G191583 NA non-coding upstream 121919 2842192 ~ 2843011 (+)
G191596 NA non-coding downstream 5304 2970984 ~ 2976251 (+)
G191617 NA non-coding downstream 90222 3055902 ~ 3056236 (+)
G191610 NA non-coding downstream 176377 3142057 ~ 3146849 (+)
G191650 NA non-coding downstream 343368 3309048 ~ 3314217 (+)
G191654 NA non-coding downstream 431715 3397395 ~ 3397727 (+)
G191573 sptbn1,LOC107396444 other upstream 186563 2775308 ~ 2778367 (+)
G191567 sptbn1 other upstream 198868 2762050 ~ 2766062 (+)
G191565 sptbn1 other upstream 203251 2756154 ~ 2761679 (+)
LOC120548303 usp54,LOC106455943,LOC108247408,LOC104941643,LOC107104721 other upstream 648528 2268828 ~ 2316402 (+)
G191236 NA other upstream 860233 2047957 ~ 2104697 (+)
LOC120548437 NA other downstream 128287 3093967 ~ 3110958 (+)
LOC120547552 NA other downstream 198144 3163824 ~ 3339085 (+)
arfgef3 arfgef3,LOC102791283 other downstream 1284925 4250605 ~ 4347579 (+)
G191903 NA other downstream 1322217 4287897 ~ 4288644 (+)
LOC120548449 NA other downstream 1401471 4367151 ~ 4368326 (+)

Expression


Co-expression Network