G230327


Basic Information

Item Value
gene id G230327
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053134.1
NCBI id CM020931.1
chromosome length 29109922
location 25436151 ~ 25494355 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU312407
GTGGAAGCGAGTGTTTTTGCCAAATAGTTAATTCGCagcaggcgtgtgtgtgtgcgcgtgtgcgcgtgtgtgtgtaaaatgttaaattaaataaaccgAATTCAAAGTCCACGTACTAGCTTTCTCCGGAGCTTTCAACAGAATTGTGTAAaaaagtggaccttgagttaagattattttgtcaaatttCTATTTGCAAGGTCACAAAAGGAACTTTTACGCAAGCaagcaatatattttttttttaaatgaatgtagtaTCACTGGGGAATAAAACTGTTAACCGTAGAGAGTTTGGAGTGAATCAGCCACTTGCAGTTTGGTCTACTTGTAAAAACATGTCGAGTGAATCCTTCCATTGATCTAATTTCAGTATTCTAATGCGCCATCATGTCGCACTTAACACATCGTCCACGTTCTGACTTCCCTGCCCTGTCTGTTGCAAAAGACATCAGTCTTTTACACTCAAACTGGACagaatagtgcatttgttggggactattttcagcggtGGATTAATACACAGTTGGTTCACAAGTTGGCATTTACTGCACttagacatgtttttttttcttgtgttattGTTGGCACatggacatactgtatattgttggtTTAGGCCTTtttaatgggatttgttgacattatgaaaaatatagaatattagCCTTATCCTTTTTAAATTGATCCATTAGATATCAGTGCGTGATGTTACAAGCTACCTGTCAACCTTTAGTTCCCATATTACATGAATGCAACATGACCGCTTTATGGGAGGAACACCATCTGCATATCGTTTCTACTTTAGCAGCAGCCAAACAGAAGAGATGGGTGGAAACTAATGACTATTTTTCTTCAGacaaatttatttttctttcaacGTATAACTTGTGCTGCATGAGAGATGTTTGCCGCTGTCGCTACTTAACCGCCGTCTGAATGAATCCGTTGTGATGGTGTAAATATTCTCATTAGTGCATGCTGTCTTTAGACGGAGCTGTGTTTACCGTGACCCTCTCTAATGAATTCTGGATGGAAGATGAGTTTTGAGGAAACGTGGAACGTGAAAAAGTGGACATCTTTTGCAAACCCAGTTCCCTGTAGTATTTCGCTGTCTCCAGTATTAAGTCTGTGAAGGACCCCACAGCCTGTCATGGTTAGTTTGGAATGTCTTGATTTCacgtatatttattttttaatttaatgttaaTCCATTGCAGGCTGACAGCAGCACTGGTATTTTAAGGTTCATAAAGCCTGTGGAATAACTGGTCACCACTATTTctttttcatgtgtgtgtttttttaacccTGTGTTCTCTTGCTGCTGTGCCCCCTAATGCCTCACCCTGCAGGACTACCCACAGTTCCAAAGCACAATAACAGAGTCCTCTGTCTCGTCCTGGATTTCGTTGTAAACAAACTCTTTGCTGATGGCTACAGGGCAGATTTCTGGTGGAATAGAATTGACATTCCTCCGTAGACTACTGCACACTTTGCTTAAGTTACAACCCTAAACGCGTCCTGTGACGAGTCGTATTAACCCCGAGTGGAAACGGCCATGAGAGCAGTGACTGTGCATCCTGGTCGTGGCGAGAATGCCAACGGACTACTAGTGTCATGCCTGTGTTGGACTGACTTCTTTGTTCTGATATTTATTATGcctatttcaataaaaaacaccCAGTGTGTTAaa
>TU312409
gagggggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgtgtgtgtgtaaaatgttaaattaaataaaccgAATTCAAAGTCCACGTACTAGCTTTCTCCGGAGCTTTCAACAGAATTGTGTAAaaaagtggaccttgagttaagattattttgtcaaatttCTATTTGCAAGGTCACAAAAGGAACTTTTACGCAAGCaagcaatatattttttttttaaatgaatgtagtaTCACTGGGGAATAAAACTGTTAACCGTAGAGAGTTTGGAGTGAATCAGCCACTTGCAGTTTGGTCTACTTGTAAAAACATGTCGAGTGAATCCTTCCATTGATCTAATTTCAGTATTCTAATGCGCCATCATGTCGCACTTAACACATCGTCCACGTTCTGACTTCCCTGCCCTGTCTGTTGCAAAAGACATCAGTCTTTTACACTCAAACTGGACagaatagtgcatttgttggggactattttcagcggtGGATTAATACACAGTTGGTTCACAAGTTGGCATTTACTGCACttagacatgtttttttttcttgtgttattGTTGGCACatggacatactgtatattgttggtTTAGGCCTTtttaatgggatttgttgacattatgaaaaatatagaatattagCCTTATCCTTTTTAAATTGATCCATTAGATATCAGTGCGTGATGTTACAAGCTACCTGTCAACCTTTAGTTCCCATATTACATGAATGCAACATGACCGCTTTATGGGAGGAACACCATCTGCATATCGTTTCTACTTTAGCAGCAGCCAAACAGAAGAGATGGGTGGAAACTAATGACTATTTTTCTTCAGacaaatttatttttctttcaacGTATAACTTGTGCTGCATGAGAGATGTTTGCCGCTGTCGCTACTTAACCGCCGTCTGAATGAATCCGTTGTGATGGTGTAAATATTCTCATTAGTGCATGCTGTCTTTAGACGGAGCTGTGTTTACCGTGACCCTCTCTAATGAATTCTGGATGGAAGATGAGTTTTGAGGAAACGTGGAACGTGAAAAAGTGGACATCTTTTGCAAACCCAGTTCCCTGTAGTATTTCGCTGTCTCCAGTATTAAGTCTGTGAAGGACCCCACAGCCTGTCATGGTTAGTTTGGAATGTCTTGATTTCacgtatatttattttttaatttaatgttaaTCCATTGCAGGCTGACAGCAGCACTGGTATTTTAAGGTTCATAAAGCCTGTGGAATAACTGGTCACCACTATTTctttttcatgtgtgtgtttttttaacccTGTGTTCTCTTGCTGCTGTGCCCCCTAATGCCTCACCCTGCAGGACTACCCACAGTTCCAAAGCACAATAACAGAGTCCTCTGTCTCGTCCTGGATTTCGTTGTAAACAAACTCTTTGCTGATGGCTACAGGGCAGATTTCTGGTGGAATAGAATTGACATTCCTCCGTAGACTACTGCACACTTTGCTTAAGTTACAACCCTAAACGCGTCCTGTGACGAGTCGTATTAACCCCGAGTGGAAACGGCCATGAGAGCAGTGACTGTGCATCCTGGTCGTGGCGAGAATGCCAACGGACTACTAGTGTCATGCCTGTGTTGGACTGACTTCTTTGTTCTGATATTTATTATGcctatttcaataaaaaacaccCAGTGTGTTAaa
>TU312410
tgttcttcttaaactacattcgtggggtccaaaaactgggagtacagtatacttgtggggtcccgacagctttgtggggccaaaatgctggaccccacaacattaaagggctgtttgagggttaagacttggttttaggattagggatagaattaggttatggttagggtgagggtaagggataaggttaggcattcagttgtgatggttagggttgggcatcgtttagattttaacgattctgattccaattccgattcttcctttcaattccggttcttatcggttctcgattccgattctttgaggggtggagttgaaacgggtcacatgcttattttcacaaataagaggaaagttttattttgattcaatggtggtttgcagttttacagctttttcaacgtaaaataaagccacactagagcgccgcttactgtgctccatggctgcaacacaacaagcacctggccactacggaaaccaaaacttgcgcatgttaaattgggaagtgatgatcggatttgaaaccaaatcctccaaacgattccaaaacagaaacgattccgatggaatcgtaatttttgaaacgattccgattaggaatcggttctcgatgcccaaccctagtgatggttaaggtaaggggctagggaatgcattatgtcaatgacggtccccacaaagatagtgagacgcacttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtgtgcgcgtgtgtgtgtaaaatgttaaattaaataaaccgAATTCAAAGTCCACGTACTAGCTTTCTCCGGAGCTTTCAACAGAATTGTGTAAaaaagtggaccttgagttaagattattttgtcaaatttCTATTTGCAAGGTCACAAAAGGAACTTTTACGCAAGCaagcaatatattttttttttaaatgaatgtagtaTCACTGGGGAATAAAACTGTTAACCGTAGAGAGTTTGGAGTGAATCAGCCACTTGCAGTTTGGTCTACTTGTAAAAACATGTCGAGTGAATCCTTCCATTGATCTAATTTCAGTATTCTAATGCGCCATCATGTCGCACTTAACACATCGTCCACGTTCTGACTTCCCTGCCCTGTCTGTTGCAAAAGACATCAGTCTTTTACACTCAAACTGGACagaatagtgcatttgttggggactattttcagcggtGGATTAATACACAGTTGGTTCACAAGTTGGCATTTACTGCACttagacatgtttttttttcttgtgttattGTTGGCACatggacatactgtatattgttggtTTAGGCCTTtttaatgggatttgttgacattatgaaaaatatagaatattagCCTTATCCTTTTTAAATTGATCCATTAGATATCAGTGCGTGATGTTACAAGCTACCTGTCAACCTTTAGTTCCCATATTACATGAATGCAACATGACCGCTTTATGGGAGGAACACCATCTGCATATCGTTTCTACTTTAGCAGCAGCCAAACAGAAGAGATGGGTGGAAACTAATGACTATTTTTCTTCAGacaaatttatttttctttcaacGTATAACTTGTGCTGCATGAGAGATGTTTGCCGCTGTCGCTACTTAACCGCCGTCTGAATGAATCCGTTGTGATGGTGTAAATATTCTCATTAGTGCATGCTGTCTTTAGACGGAGCTGTGTTTACCGTGACCCTCTCTAATGAATTCTGGATGGAAGATGAGTTTTGAGGAAACGTGGAACGTGAAAAAGTGGACATCTTTTGCAAACCCAGTTCCCTGTAGTATTTCGCTGTCTCCAGTATTAAGTCTGTGAAGGACCCCACAGCCTGTCATGGACTACCCACAGTTCCAAAGCACAATAACAGAGTCCTCTGTCTCGTCCTGGATTTCGTTGTAAACAAACTCTTTGCTGATGGCTACAGGGCAGATTTCTGGTGGAATAGAATTGACATTCCTCCGTAGACTACTGCACACTTTGCTTAAGTTACAACCCTAAACGCGTCCTGTGACGAGTCGTATTAACCCCGAGTGGAAACGGCCATGAGAGCAGTGACTGTGCATCCTGGTCGTGGCGAGAATGCCAACGGACTACTAGTGTCATGCCTGTGTTGGACTGACTTCTTTGTTCTGATATTTATTATGcctatttcaataaaaaacaccCAGTGTGTTAaagctgtcagtgtgtgtgtgtatgtgtgtccatAGACTACATGTCAGTGTGTCCATCTATTAGAAATGGGGACAGAAAAGCCAAGAGCATTTTCTTACAGGCAAACGTACTTAACAAAGACATTTTCTGGAATCAACTTAACTTTTATCTTTGACTTGAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU312407 False 1696 lncRNA 0.40 2 25475799 25494197
TU312409 False 1671 lncRNA 0.40 2 25436151 25494197
TU312410 True 2374 lncRNA 0.41 2 25491783 25494355

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120553526 NA coding upstream 35944 25392432 ~ 25400207 (+)
ttll12 ttll12 coding upstream 86810 25263996 ~ 25349341 (+)
LOC120553672 LOC103361951,LOC100711848,LOC101487241 coding upstream 175801 25244537 ~ 25260350 (+)
pnpla3 LOC103361965,LOC104964946 coding upstream 194213 25218540 ~ 25241938 (+)
mpped1 mpped1,LOC103131679,LOC106525904 coding upstream 322958 25011234 ~ 25113193 (+)
prl2 LOC104964766,LOC103356682,LOC100697904 coding downstream 52585 25546940 ~ 25553001 (+)
cdnf LOC104964768 coding downstream 74184 25568539 ~ 25574022 (+)
tmbim4 tmbim4 coding downstream 114151 25608506 ~ 25614445 (+)
lemd3 lemd3,LOC104964688,LOC106576661 coding downstream 127088 25621443 ~ 25640090 (+)
hmga2 hmga2 coding downstream 201526 25695881 ~ 25753815 (+)
G230259 NA non-coding upstream 58550 25376347 ~ 25377601 (+)
G230260 NA non-coding upstream 83977 25351877 ~ 25352174 (+)
G230249 NA non-coding upstream 244208 25184812 ~ 25191943 (+)
G230192 NA non-coding upstream 637410 24795953 ~ 24798741 (+)
G230109 NA non-coding upstream 950634 24482310 ~ 24485517 (+)
G230336 NA non-coding downstream 793 25495148 ~ 25495399 (+)
G230337 NA non-coding downstream 5492 25499847 ~ 25500209 (+)
G230339 NA non-coding downstream 9309 25503664 ~ 25504436 (+)
G230401 NA non-coding downstream 101237 25595592 ~ 25616671 (+)
G230404 NA non-coding downstream 123847 25618202 ~ 25619259 (+)
LOC120553523 NA other upstream 62155 25362882 ~ 25373996 (+)
G230148 LOC102781993,LOC101465723 other upstream 657893 24620812 ~ 24778258 (+)
LOC120553083 NA other upstream 1121444 24309542 ~ 24314707 (+)
LOC120553686 LOC105929833,LOC107382334 other upstream 1490511 23934300 ~ 23945640 (+)
adm2a NA other upstream 1587527 23833018 ~ 23848624 (+)
msrb3 msrb3 other downstream 147485 25641840 ~ 25662819 (+)
LOC120553706 NA other downstream 316052 25810407 ~ 25812828 (+)
arhgef39 arhgef39 other downstream 543833 26038188 ~ 26106823 (+)
mrps33 mrps33,LOC106591474 other downstream 878359 26372714 ~ 26381109 (+)
LOC120553759 NA other downstream 1199001 26693356 ~ 26971853 (+)

Expression


Co-expression Network