G127533


Basic Information

Item Value
gene id G127533
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047602.1
NCBI id CM018548.1
chromosome length 30442583
location 5157144 ~ 5163126 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU150724
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>TU150725
GAAAACATAGagtgactctgactcagtggaacaacagaaATCAAGAAAATGAACACGAAAATATGGTGAAATATTTACTGAATATGGATTTACAAGCGTGACAGTAAATAACAAAGAGAATCCAGACTGTCTAGGCTTGGGGGTTGCAGAAAATTTATAATGTACATTTGGCCAAATGCTTTGGGAACCGCTGTCTTAAAGGTACTAACCAAATATttttagggttctagatttaaccttgtTAGAGCCAAAACGTCTCTGAACTTAATTGCTTGGCAGTGTGACAGTCCAGTCCAGTGAACACTGTTGGGAAAGTAAATGTCAGAGGGCAATCTTTAAAGCCTCTCTAAAAATACTCATAGAACCATCATGCTTGATGTATTTACTCTCTATATCACAGTAATATTACATTGTTAACATGAAGACGAAGGACACTCCTTGCCAATAAGGTGGATAGGAAGAGTTGAGTCAACCAGTCCTGCTTTGATTTCCAGTTactgtgtggtggtctggggaTATCACGGTGGCTGAATAAGCCaaataagatgaaaaatattAGGTTTCACCAAAATAATGTCTTCTGGAAGTATCATGTTAGGTAAGGAGACAGTCTAACAAAAGTGGTGGtgaaaacagtcagtctgcatTAATGTGTTGATTTCCTCACCCAGTGAATGTCACTCTTTGATCAAGCtgatggacaggtgtgtgtCGTGAAATGGACACAAGCCAAATCAATTCAGTTTACACACTCGCACTACATAGGACATAACACAATGGCTACTCTACCCTATCCACTGCACAACATGACCAACAGGAAGTCATTTAGGATTCTTCCTGTGGCTCGGCTCGGCTCTGTTCCCTCAACTTTAGCTAATCTGGCTTTTAACTTTCCCCCCAGTACACTTCACAAATATTCATTTCGGTCAGGGTCTATGCTCAAGTGAAAGATGGATTAGTGAAGTATTAGCCAGAGTGCTGCCTTTAAATAGTCTATATTACAGAATCATATTAGGAGCTCATATTTAGCTGATCTGTTATTATAGATAAATCCATGTAGCTAATCTACAGTAAACCGAATCTCTTCTGTATCATCCTTATCATATTTTTCTCCTTACACCTTAACCAACATGGCTATTTTTATAATACAGCTGCCATGCAGTGCTCTACACACTGGCCTTGTCATATTTTAAGCAGAGGTCTGTCTCCGACTCAACTCATGCAAGCTAGAGACCCTTTACTGTATCACTACAGATGATGAAAATAAGCTACTAGAAACAGCCTTATGCTCAGTGAACAATATAGAATGTGTTTTAGGGTCCAACAGgtcaacaaataaatacactatgGCGCGTTCTTTGTTGAAAGCTGACTCATGTTTGGACAGTTTATCGTTCCGTAGGGAAAAATTAATTTTCCATTTTAGACAGCATAAAGATCAGTGGCTTGGCTGAGGAATGGTCAGCACTTTGGGATGGTCCCTTCTTTCCTTCACTAGTGGAATAAAATCCAGCAAGGAAATTAATTCTCTTGAgccttttatttcatttgctcAACTAGCTGATCCAAAGTAACATACAATTGGGGGTTAAGACATCTTGCCCAAGGAGCCAAACGTGACAGCTTAGTGAAGCTGGGGTTTGAACTTATGATCTTACAACCAGGAGGCCagtgccttaaccactgagccatcacACATATGCAAGAGGACATGAACCAGGGCTTCCAAGTGGAACAACTGTCCAATGTTGTGCCCTATACCTGGGCTAACCAGGGCCAGGAGTGTAATTCAATTGACCCTGCTCTCTGGTTGACAAAATGGCATTTCTTCCTCAATCTCTATGTCGATTAGTAGGTTGGTAGCCAATCACTGGCACACTTTACCTCAGTAAAGGCTCTCCTCCAAAATCTGCTTGATGATGTTGATAAAACATCAAAATCATATGATGTTGTACAAGCAGTACTTCCTTAAATACATGTGGTTTTTTGAAGTACATATTATTTTCACCTTCCCTGATGGTATGTACGATAAGTGGAAACCTAGTTAAAGGAGTGAaagaaacaattttttaaaaagtgttcgAGAACCACGCTGAGAACCCAAGTTTAAGGCTTGAGATTAAATATCGCTTAAAAATTCACAATGTGGGATTTTTAAATGAGTAAACAATCCAGAATGCACAAACTACATGAAATAACCAGCAATAAAGAAACAACTTCTCCACAGTAGTCGAGAAATAGATGGCAAAATTATTATCCCGGGGATATTTACCAGCCCAAATATGGTCGTAAACTTTCAGCACATAAGAGTTGTTGCACTTTAGAGCACAGCAAGCACCAAGAATTCATTCTTCATAAAATCAACTGAAAGCTCTTTTTCATTCGAGTCCTTCGTCATTGCTTTTGGTCTTCCTGAGTTGGAAGCTGTGTCTCCCTGCTTACCGCTGTGACCTATGATGTCATCTTTTGAAATAATGGAGCCCTGAGCTCAGAGCAGGAAGATAAATCACAGATCAGATTTTGTGAAAAGTTCAGCTCAATCCAGGAACAATCTCCCCTTAGAGGAAGCCCTGCCACCATTTTAAGAGTTATTTCAATCATTCATAAGCTCAAGGCAAATCAATATGACTAGACCTGAGGGATTGGATTCTCAAACTAATTTGGACCACCATACTGACTCAGCATCTGTCTGTTCAAgttattaatacatttagaaAGAACAGTGTTGCTTCTTTCCTGTCTGTGGGTGTGACTGTAGAAGACTTTATAACTAGTAGTCCAAAGATTTGCCAAACAGAATATGTTTCTCAGCTACAGCAGTCACAGGTCTTAATTAGTAGTTTGACCAGCTTAGCATTACtgttgaacattttttaatgaaaaataacatgCATAATAACataaccacagcaatttgccaacgattacttttttattaatgtaagaCTGGCATATTGTacttttacccatttatagttgcatttaatgttgtggaaggtccAGAAGATAAGTTATAGCTAtatgtttatagcagctatgaacagtcgctctctcaccagtctctttttccctctctcttgaagttaataagaaaaaaagacacagcttgtcatgttactgagaaaccactaTCCTGAATactttcctgtgctggaaaacaaaGTTAGAGCTTTACCTCAGTCTGttacaaaccactgacactggagactcattccattaAACAGCCCTTACATTTCACCCTAAATGTAGCTGATTAGCCAGAACTTAGGGATACACACTGTAGTGTGCTAAATGCGTTTGCCTTCTTCAGACCATAAACTGGTGGGGTTTGTATTTCAACAATTCCCAAGTGGTGCAGATGCCACAAGGAATCCAAGAGAGTTTGACTGACATGCAGTTTGTATGAAGCTATTCACAGCTATAAGCTTTCCTCACATATTATCAATATTATCATCACAGCACTAAAACAAATCTAAGGAAAAATGCACCTTAACTCCATTTTGGGGTAAGACATAAATcatgtaaatttcatttttggccaaaacaATTTTTTGAGAAAATCTGTAACAGACAGGCAGTTCCAGTCCATTATACAAGTTTATTGCTTTGCCCTCACTCCTCTGATTCAAATTAGGAGCTTGATGATTCGCAGAGTTGGTTTAGTTAGCCACAATGTACGCGtgcacacagacaaaaacacacacagacacgctaGCGCTGCCCATTCGTGACTCTGATACACGATGAATCTCAAATGAGATCAATTGCAGCACTGCCATTTGCGTAGTTTCGACGTAATCAAGCCTCACATTTGCACGATATTGAAACAGGACAAAAAGAGCGATTATTCTTAATGAAGACTTTAATAGATGCACTTTTTCAACTTTGGTGGAAGCACAGTGCCAAACATGTAAATTGGCGATACAGACAAAATGCGGCATGCTGGGAAATCAGAAGACAATCTAACCGCGTGCTACTAAATCAGCCAGAGTATTTTGTATGATTTCAAAAAAATAGCTAACATGTCCTAGTGCTACATTTTGAAAatgcagaaacaaaaacagaaaacaaagcaCTAGAATTAAACTGGTTTGAGTTGGAAACCCATGTATTCATTAACTAGTTTACAGACATCAGCGAGAAGTCATTCAATCAAATGGACACACACAACTAAAACCCAAAATGTCACCATAGAAACCTACTACCCCAAGAGTGACAAGTGACCATAACCAGCCACAAATATAGCCTCAAGTCTTTAAACATACAGGGACATTAAGTGCCTGGCACGGTGAGGTTAATGTTTCACCCGCAGCCATTCTTAGAAGAACCTGAACTGTGGTCTGGTGGTCATGGAGAAGATTAAATTCCTCGTACACTTCATGGAGTTAAACAGTCCATGAGGACAGAGCAATGAACTATTTAACCTTTACATATATACATCCCATAATCCTTGTGATCCCCTCAGCTCCACTTAAAGAGTAGCATCACTTTGCTATGATCTTATGAGACTAATGGAGCTAATGCAAAGGATTTCTTAACCCAAGAGAGGCATATTTTGGGTGAGAAAGACTTTCTATGCCTCGACCCCTCTGACTGCCATTCCAAGTGCAAGTTCTCGTACatgcttttatatttacaaCGCCCGCCAGGGTGACGCAGCCGAGCATTGCTTTCGCCATCATTTAGAGTCATCCAGGCCAAACAACGGCTATTGATCTGCGACTCTAAATTGAAAGTAGGCAGTGGGAAAGTAAAACTGGGTGCCATTAAGAGGACGACGCTAAATGCTCTGTCTCTCCTACATCACAAACCTCTAGCAGTTAACGCTCTTGAAAAACCTCGACAGACGCGGCGATGTTTGGAAATGTGATCTGAGCCGCCTCTGTTGCTGCGATCGCAGCTCTGCCTGCTTCACAGACAGCAAGTGAAACCAGCATAGACTGGAATAAACTAGTCCACTGTGCATTTCTATTACTTCTCTGGAGGAGAGAGAGCCATCA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU150724 False 5711 lncRNA 0.40 3 5157144 5163126
TU150725 True 5737 lncRNA 0.40 3 5157144 5163126

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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ntng2a ntng2,ntng2a,LOC107557204,LOC107757289,LOC107674329,LOC107725312,LOC108438355,LOC107664998,LOC106585788 other upstream 1759643 6922769 ~ 6989679 (-)
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Expression


Co-expression Network