AMCG00006138


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00006138
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030142.1
NCBI id CM030142.1
chromosome length 21087710
location 18190224 ~ 18356589 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00006138
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>TU197332
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Function

GO:

id name namespace
GO:0007186 G protein-coupled receptor signaling pathway biological_process
GO:0005834 heterotrimeric G-protein complex cellular_component
GO:0004871 obsolete signal transducer activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00006138 False 207 mRNA 0.52 2 18346744 18347302
TU197332 True 9688 TUCP 0.39 5 18190224 18356589

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00006169 diras1,LOC106573976,LOC105906138,LOC106613605 coding upstream 59728 18116638 ~ 18130496 (+)
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AMCG00006187 NA coding upstream 284600 17879983 ~ 17905624 (+)
AMCG00006189 thop1,mepd coding upstream 313165 17852039 ~ 17877059 (+)
AMCG00006139 NA coding downstream 16345 18372934 ~ 18379731 (+)
AMCG00006177 NA coding downstream 97309 18453898 ~ 18455420 (+)
AMCG00006176 NA coding downstream 100125 18456714 ~ 18467995 (+)
AMCG00006173 LOC106573927,LOC106613609 coding downstream 161793 18518382 ~ 18534722 (+)
AMCG00006175 fcho1,LOC107751067,LOC101065258,LOC102200842,LOC103367496 coding downstream 236038 18592627 ~ 18636029 (+)
G156598 NA non-coding upstream 346248 17842139 ~ 17843976 (+)
G156567 NA non-coding upstream 412354 17774665 ~ 17777870 (+)
G156564 LOC100846954,LOC107575789 non-coding upstream 481503 17707670 ~ 17708721 (+)
G156521 NA non-coding upstream 618692 17567559 ~ 17571532 (+)
G156509 NA non-coding upstream 642863 17535631 ~ 17547361 (+)
G156769 NA non-coding downstream 386013 18742602 ~ 18749749 (+)
G156771 NA non-coding downstream 400337 18756926 ~ 18757205 (+)
G156772 NA non-coding downstream 400677 18757266 ~ 18757542 (+)
G156777 NA non-coding downstream 420603 18777192 ~ 18777554 (+)
G156807 NA non-coding downstream 484214 18840803 ~ 18843866 (+)
G156640 NA other upstream 209587 17973741 ~ 17980637 (+)
AMCG00006190 LOC107695212,LOC107676806 other upstream 425996 17746133 ~ 17764228 (+)
AMCG00006188 adamts10,LOC106584371,LOC108439663 other upstream 455140 17662190 ~ 17735084 (+)
AMCG00006149 NA other upstream 1062591 17123205 ~ 17127633 (+)
G156327 NA other upstream 1561042 16627793 ~ 16629182 (+)
AMCG00006174 NA other downstream 121539 18478128 ~ 18480087 (+)

Expression


Co-expression Network