AMCG00013943


Basic Information

Item Value
gene id AMCG00013943
gene name NA
gene type misc
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030125.1
NCBI id CM030125.1
chromosome length 49972098
location 47752214 ~ 47819723 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>AMCG00013943
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>TU59724
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
AMCG00013943 True 5614 mRNA 0.39 7 47793939 47819723
TU59724 False 4279 lncRNA 0.37 2 47752214 47819593

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00013941 LOC106566646,LOC106571888 coding upstream 21940 47724434 ~ 47730274 (+)
AMCG00013939 lrrn2,LOC108425772 coding upstream 208780 47541233 ~ 47543434 (+)
AMCG00013924 etnk2,LOC106565623,LOC107694884 coding upstream 620038 47123708 ~ 47132176 (+)
AMCG00013917 NA coding upstream 667176 47077860 ~ 47085038 (+)
AMCG00013923 NA coding upstream 725240 47026485 ~ 47026974 (+)
AMCG00013953 NA coding downstream 266236 48085959 ~ 48097083 (+)
AMCG00013952 LOC108250382 coding downstream 279953 48099676 ~ 48143917 (+)
AMCG00013951 NA coding downstream 325675 48145398 ~ 48158245 (+)
AMCG00013960 NA coding downstream 407692 48227415 ~ 48234227 (+)
AMCG00013962 NA coding downstream 417040 48236763 ~ 48239245 (+)
G47810 NA non-coding upstream 168312 47552159 ~ 47583902 (+)
G47804 NA non-coding upstream 206623 47545192 ~ 47545591 (+)
G47797 NA non-coding upstream 330985 47421016 ~ 47421229 (+)
G47791 NA non-coding upstream 344662 47406616 ~ 47407552 (+)
G47767 NA non-coding upstream 493456 47256497 ~ 47258758 (+)
G47936 NA non-coding downstream 239010 48058733 ~ 48059592 (+)
G47937 NA non-coding downstream 240192 48059915 ~ 48060814 (+)
G47958 NA non-coding downstream 342488 48162211 ~ 48162427 (+)
G47959 NA non-coding downstream 344148 48163871 ~ 48164673 (+)
G47960 LOC107654379,LOC107756628,LOC107573300,LOC107751188 non-coding downstream 345072 48164795 ~ 48165036 (+)
AMCG00013927 LOC108435245,LOC102295207,LOC101474852,LOC101474572,LOC102198786 other upstream 524245 47219919 ~ 47227969 (+)
AMCG00013919 LOC102792503,LOC106583503,LOC106565096 other upstream 678506 47037095 ~ 47073708 (+)
AMCG00013879 dennd2d other upstream 1793020 45943571 ~ 45959194 (+)
G47398 NA other upstream 1810308 45934659 ~ 45941906 (+)
AMCG00013872 NA other upstream 1928986 45816372 ~ 45823228 (+)
AMCG00013961 NA other downstream 419977 48239700 ~ 48258433 (+)
G48018 NA other downstream 449031 48268754 ~ 48269272 (+)
G48026 NA other downstream 461340 48281063 ~ 48351285 (+)
AMCG00013971 lamtor5,xip,LOC106566397,LOC107668015 other downstream 714163 48533886 ~ 48546200 (+)
G48142 NA other downstream 935230 48754953 ~ 48760712 (+)

Expression


Co-expression Network