G99596


Basic Information

Item Value
gene id G99596
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030132.1
NCBI id CM030132.1
chromosome length 32980562
location 15999802 ~ 16004030 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU124405
TTATTAGTTTAAGTCTTTATTGAGATTAATATGGCTCTACTTTGAGTTTTTAGTATAATTGTCATGCTTTCCGCTTAGCCAATTAGGGGCTGGAAATGTAAGAGCCATAGTAAAGGAAAAGGTGaattttctgaattaattttattgtttatgtatttattagttcatttaaaaagaatgttatctatattcataattattttgaaacccCCCATTAGATCCCCATCAGTTTAATGTGACTGATGTCAAAGTACTGTCATCAATGCTAATTTTGTAAGCAGGAAGGAGTATATGGAGCAGCACAGTTTTTGaccatgtaaaatataattcttggtattgtttttttatttttcaaagtaaatagtaaaaataagaattgtgttgaaatgtttaaaatgtgtaagaCTCATTGCTTCATATAGACAACCGTggttgcatttttaaagaaagctgCGCCACTACAGTGGTGAAAGTGGGAATTGTTCTAGTGATGATAGTTGGAGTTGTACTTGCAGTGGGAGTTGCAGTTGTTATGGTAGTGCTAGTGGGAGCTGTAGCTGTTGAGTTGGAGTTGTTGAAGTAGTGAGAGTAATGGTAGTGGTGATAGTGGGAGTTGTAGTTATTCTGGTAGTCGGAGTTGTAGTTGTGGTAAGTCAGAGTTGTGATTTAAAGTTGTCATGGTAGTGGGAGATGAAGTTCTGGTGCTACTCAGAGTTGTTGTCATTGTGGGAGTTGTAATTGTGGTAGTCAGAGTTGGAGTTGTGGTTGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGTCATGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGAGGTAGTCACAAAAAAGTTTACAGATAAGAGGAGgtcattcaacccatcatgcttgtttggtgtccattaataaccgagtgatccaagAAACCTGTGCAGTCTATACTTGTGGTGGgagtaagagctgtagttgtggTGTAGAGGAAATGTTGGTAGTGGTGAAATCTGTAGTTGGAGTAATCTGAGTCATAGTTAGGTGGAAGTGGCAGaagtagttgtggtggtagtgggtgttttttttaattgagtggCAATGGGAGTTTATGTTTTAGTGATAGGAGTTGTTGTGCCTGTAGTTGGAGTTCTTGTTTTGGTGGGAGTTGTAGTTGTTGTGGGAGTCTGAGTTGATGTTGTCATGGTATTGATAGTTGTAGTTGAAGTTATGGTTCTCGGAGTTGTAGATGTAGTTGTGGTTGAGGTGGGAGCCATGATGGTGGTGTTAATGGGAGTTGTAGTTGCGGTGAAAGTGGTAGTGGGAGTTATTGTTGTGGTGCTAGTGGGGGTTGTAGTTAATCTGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGTTCTGGTACTGGGTGTTATGTTCTTGTGGTACTGGCAGTTGTaattgtggtggtagtgggaagATTTGTTTTGGTGATAGGGGGAATTGTATTCGTGGCTGTAGTGGGAGTTTTTGTATTGGAAGTAGTGGGAAATTTTGTTGTGGTGGTACTGGGACTTTTTTTTGTAGTGGTATTTGTCTTATATTATTGTTGGTAGAGGGAGTTGTAGTTCTGGTGATAGTGGGAGGTGTAGTTATTGTGGTAGTGGGAGGTGTAGTTGTGGTAGTGGTGGGAGTTGTTGTTGTGGAAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtggggggtgtagttgtggtggtagtgggagttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGTtttagttgtggtggtagtgggaggtGTAGTTGTGGTGATAGTGGGAGGTGTAGTTGTGGTTGTAGTGGGAGTTGTTGTTGTGGTAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtggggggtgtagttgtggtggtagtgggagttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGttgtagttgtggtggtagtgggagGTGTAGTTGTGGTTGTAGTGGGAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtggggggtgtagttgtggtggtagtgggagttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGttgtagttgtggtggtagtgggaggtgtagttgtggtggtagaGGGAGTTGTTGTTGTGCTAGTGGTTGAACttgtagttgtggtggtagtggggggtgtagttgtggtggtagtgggagttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGttgtagttgtggtggtagtgggagttgtagttgtggtggtagtgggagttGTTGTTGTGCTAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtg
>TU124406
TTATTAGTTTAAGTCTTTATTGAGATTAATATGGCTCTACTTTGAGTTTTTAGTATAATTGTCATGCTTTCCGCTTAGCCAATTAGGGGCTGGAAATGTAAGAGCCATAGTAAAGGAAAAGGTGaattttctgaattaattttattgtttatgtatttattagttcatttaaaaagaatgttatctatattcataattattttgaaacccCCCATTAGATCCCCATCAGTTTAATGTGACTGATGTCAAAGTACTGTCATCAATGCTAATTTTGTAAGCAGGAAGGAGTATATGGAGCAGCACAGTTTTTGaccatgtaaaatataattcttggtattgtttttttatttttcaaagtaaatagtaaaaataagaattgtgttgaaatgtttaaaatgtgtaagaCTCATTGCTTCATATAGACAACCGTggttgcatttttaaagaaagctgCGCCACTACAGTGGTGAAAGTGGGAATTGTTCTAGTGATGATAGTTGGAGTTGTACTTGCAGTGGGAGTTGCAGTTGTTATGGTAGTGCTAGTGGGAGCTGTAGCTGTTGAGTTGGAGTTGTTGAAGTAGTGAGAGTAATGGTAGTGGTGATAGTGGGAGTTGTAGTTATTCTGGTAGTCGGAGTTGTAGTTGTGGTAAGTCAGAGTTGTGATTTAAAGTTGTCATGGTAGTGGGAGATGAAGTTCTGGTGCTACTCAGAGTTGTTGTCATTGTGGGAGTTGTAATTGTGGTAGTCAGAGTTGGAGTTGTGGTTGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGTCATGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGAGGTAGTCACAAAAAAGTTTACAGATAAGAGGAGgtcattcaacccatcatgcttgtttggtgtccattaataaccgagtgatccaagAAACCTGTGCAGTCTATACTTGTGGTGGgagtaagagctgtagttgtggTGTAGAGGAAATGTTGGTAGTGGTGAAATCTGTAGTTGGAGTAATCTGAGTCATAGTTAGGTGGAAGTGGCAGaagtagttgtggtggtagtgggtgttttttttaattgagtggCAATGGGAGTTTATGTTTTAGTGATAGGAGTTGTTGTGCCTGTAGTTGGAGTTCTTGTTTTGGTGGGAGTTGTAGTTGTTGTGGGAGTCTGAGTTGATGTTGTCATGGTATTGATAGTTGTAGTTGAAGTTATGGTTCTCGGAGTTGTAGATGTAGTTGTGGTTGAGGTGGGAGCCATGATGGTGGTGTTAATGGGAGTTGTAGTTGCGGTGAAAGTGGTAGTGGGAGTTATTGTTGTGGTGCTAGTGGGGGTTGTAGTTAATCTGGTAGTGGGAGTTGTAGTTGTTCTGGTACTGGGTGTTATGTTCTTGTGGTACTGGCAGTTGTaattgtggtggtagtgggaagATTTGTTTTGGTGATAGGGGGAATTGTATTCGTGGCTGTAGTGGGAGTTTTTGTATTGGAAGTAGTGGGAAATTTTGTTGTGGTGGTACTGGGACTTTTTTTTGTAGTGGTATTTGTCTTATATTATTGTTGGTAGAGGGAGTTGTAGTTCTGGTGATAGTGGGAGGTGTAGTTGTGGTTGTAGTGGGAGTTGTTGTTGTGGTAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtgagGGgtGTAGTTGTGGTGATAGTGGGAGttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGttgtagttgtggtggtagtgggaggtGTAGTTGTGGTGATAGTGGGAGGTGTAGTTGTGGTTGTAGTGGGAGTTGTTGTGGTAGTGGTTGGACttgtagttgtggtggtagtggggggtgtagttgtggtggtagtgggagttTTTGTTGTGGTAGTGGTGGGAGttgtagttgtggtggtagtgggagGTGTAGTTGTGGTTGTAGTGGGAGTTGTTGTTGTGGTAGTGGTTGGACTTGTAGttgttgtggtagtgggagTTtttgttgtggtggtagtgggaggtATAGTTGTGGTGATAGTGGGAGGTATAGTTGTGGTAGTCTGAGCTTTTGTAATGGTGGTACTGGGCGTTGTAGTTGTGGTCATGATTGGAGCTTCAGTTGTGATGGGGGCTGCATTTGTGTCATCCAATAGTGT

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO:

id name namespace
GO:0004055 argininosuccinate synthase activity molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU124405 True 2266 lncRNA 0.42 3 16001183 16004030
TU124406 False 2118 lncRNA 0.41 7 15999802 16004030

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00015667 NA coding downstream 185443 15792513 ~ 15814359 (-)
AMCG00015664 NA coding downstream 442026 15555165 ~ 15557776 (-)
AMCG00015662 NA coding downstream 660740 15338036 ~ 15339062 (-)
AMCG00015658 NA coding downstream 754908 15236134 ~ 15244894 (-)
AMCG00015655 NA coding downstream 891777 15094120 ~ 15108025 (-)
AMCG00015672 NA coding upstream 53772 16057802 ~ 16060001 (-)
AMCG00015676 NA coding upstream 248389 16252419 ~ 16272647 (-)
AMCG00015677 NA coding upstream 311458 16315488 ~ 16324527 (-)
AMCG00015680 NA coding upstream 441942 16445972 ~ 16448187 (-)
AMCG00015683 NA coding upstream 456692 16460722 ~ 16463940 (-)
G99594 NA non-coding downstream 9539 15987084 ~ 15990263 (-)
G99576 NA non-coding downstream 39971 15902451 ~ 15959831 (-)
G99565 NA non-coding downstream 116281 15879418 ~ 15883521 (-)
G99535 NA non-coding downstream 245776 15753816 ~ 15754026 (-)
G99516 NA non-coding downstream 367194 15632395 ~ 15632608 (-)
G99614 NA non-coding upstream 56166 16060196 ~ 16068129 (-)
G99623 NA non-coding upstream 126034 16130064 ~ 16130295 (-)
G99679 NA non-coding upstream 307678 16311708 ~ 16311970 (-)
G99724 NA non-coding upstream 420720 16424750 ~ 16428626 (-)
G99735 NA non-coding upstream 493455 16497485 ~ 16498531 (-)
AMCG00015666 NA other downstream 296512 15687642 ~ 15703290 (-)
G99454 NA other downstream 739318 15259461 ~ 15260484 (-)
AMCG00015660 NA other downstream 747081 15249901 ~ 15252721 (-)
AMCG00015659 NA other downstream 799011 15170615 ~ 15200791 (-)
G99426 NA other downstream 810408 15102617 ~ 15189394 (-)
G99605 NA other upstream 13553 16017583 ~ 16102456 (-)
G99646 NA other upstream 217735 16221765 ~ 16222155 (-)
AMCG00015681 NA other upstream 463269 16467299 ~ 16473177 (-)
AMCG00015691 NA other upstream 520084 16524114 ~ 16535468 (-)
AMCG00015694 NA other upstream 588198 16592228 ~ 16611444 (-)

Expression


Co-expression Network