XLOC_006294 (CABZ01094390.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006294
gene name CABZ01094390.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 51428398 ~ 51431317 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00012289
gatggatggatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatatgcatggatagatagatagatagatagatagatagacggatggacggacggacagatagatagaaatgcatgggatagatgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatatgcatggatagatggatggatggatggatggatggacggacggacggatggacggacggctAGAtagatgtgtgtgagtgtgtagtaATGAtcagtgtgttgtgttgtgttgtgttgtgttgtgttgtgtgtggtCAGAGTGGTGTGTGTTGTGTGCAGCTGTTGTGTGTCCTGCAGCAGGTCTCCtccagcatcagtgtgtgtggtgtgttttcTCTGCTGAACCTGCGGGAGAAGCTGATCTCTGAACAGGGGCTCCGAGACGGCGGCGTACAGACATCACTGAACCGAGAGCTGCACACACTCTCTacgGCCTGCAGTCAGCTGACCATAAACCCCAAACACCTGAGCATTCTGGGAGAAATACCTGCACACTTCAGGATCCTGCTGCTGCAGCACTCTGAGGACAGTTCTGTGCTGTATGGAGGGTTTTATGAGAAGGTTAAAGCCACAGACACACAGAAGGGGAAGACTGTGACAGGTAACCATAtgacacacatttacatataccTGCAGCACTTCTTTAACTATGAAAATAGGCCAAAGTTATG
>TCONS_00012288
gatggatggatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatatgcatggatagatagatagatagatagatagatagacggatggacggacggacagatagatagaaatgcatgggatagatgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatatgcatggatagatggatggatggatggatggatggacggacggacggatggacggacggctAGAtagatgtgtgtgagtgtgtagtaATGAtcagtgtgttgtgttgtgttgtgttgtgttgtgttgtgtgtggtCAGAGTGGTGTGTGTTGTGTGCAGCTGTTGTGTGTCCTGCAGCAGGTCTCCtccagcatcagtgtgtgtggtgtgttttcTCTGCTGAACCTGCGGGAGAAGCTGATCTCTGAACAGGGGCTCCGAGACGGCGGCGTACAGACATCACTGAACCGAGAGCTGCACACACTCTCTacgTTCTGTGCTGTATGGAGGGTTTTATGAGAAGGTTAAAGCCACAGACACACAGAAGGGGAAGACTGTGACAGGTAACCATAtgacacacatttacatataccTGCAGCACTTCTTTAACTATGAAAATAGGCCAAAGTTATG

Function

GO:

id name namespace
GO:0034613 cellular protein localization biological_process
GO:0070727 cellular macromolecule localization biological_process
GO:0043226 organelle cellular_component
GO:0043227 membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0016787 hydrolase activity molecular_function

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117598

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00012289 False 835 lncRNA 0.43 3 51428398 51431317
TCONS_00012288 True 737 lncRNA 0.42 2 51428398 51431317

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006291 CU929144.1 coding upstream 52690 51297553 ~ 51375708 (+)
XLOC_006293 NA coding upstream 95634 51328470 ~ 51332764 (+)
XLOC_006292 NA coding upstream 109664 51317224 ~ 51318734 (+)
XLOC_006290 CABZ01078666.1 coding upstream 325539 51102744 ~ 51102859 (+)
XLOC_006287 dntt coding upstream 406527 50778187 ~ 51021871 (+)
XLOC_006295 NA coding downstream 2517 51433834 ~ 51439893 (+)
XLOC_006296 NA coding downstream 13677 51444994 ~ 51462667 (+)
XLOC_006297 nkx6.2 coding downstream 148534 51579851 ~ 51584264 (+)
XLOC_006298 NA coding downstream 186466 51617783 ~ 51625567 (+)
XLOC_006299 pwwp2b coding downstream 279408 51710725 ~ 51731298 (+)
XLOC_006289 CABZ01083953.1 non-coding upstream 427220 51001059 ~ 51001178 (+)
XLOC_006300 NA non-coding downstream 310237 51741554 ~ 51795401 (+)
XLOC_006307 NA non-coding downstream 689520 52120837 ~ 52136375 (+)

Expression


Co-expression Network