glb1l2 (glb1l2,si:dkey-224e22.2,LOC107554970)


Basic Information

Item Value
gene id glb1l2
gene name glb1l2,si:dkey-224e22.2,LOC107554970
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056716.1
NCBI id CM032085.1
chromosome length 26409628
location 12946841 ~ 12955945 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

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>XR_006246961.1
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Function

symbol description
si:dkey-224e22.2 Predicted to enable beta-galactosidase activity. Acts upstream of or within cilium assembly. Located in ciliary base. Orthologous to several human genes including GLB1L2 (galactosidase beta 1 like 2).
glb1l2 Predicted to enable beta-galactosidase activity. Predicted to be involved in carbohydrate metabolic process. Predicted to be located in extracellular region. Predicted to be active in vacuole.

NR:

description
beta-galactosidase-1-like protein 2 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_043216853.1 False 4079 mRNA 0.38 20 12946848 12955945
XR_006246961.1 False 3989 transcript 0.38 21 12946841 12955945

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
b3gnt2l LOC107758074,LOC107669052,LOC107554988,LOC107670608,LOC107753015,LOC107565088 coding upstream 15673 12926685 ~ 12931168 (+)
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dhx34 dhx34 coding upstream 71151 12868041 ~ 12875690 (+)
st14a LOC107758079,LOC107668533,LOC107554966,LOC107714535,LOC107670627 coding upstream 79118 12854160 ~ 12867723 (+)
ilvbl ilvbl,LOC107758073,LOC107669134,LOC107753009,LOC107670636 coding downstream 668 12956613 ~ 12966494 (+)
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cngb1a cngb1a,LOC107717637 coding downstream 317252 13273197 ~ 13299638 (+)
G125784 NA non-coding upstream 305405 12641192 ~ 12641436 (+)
G125783 NA non-coding upstream 310458 12636156 ~ 12636383 (+)
G125760 NA non-coding upstream 356897 12579725 ~ 12589944 (+)
G125753 NA non-coding upstream 534596 12411865 ~ 12412245 (+)
G125750 NA non-coding upstream 552109 12393511 ~ 12394732 (+)
G125855 si:ch211-71n6.4,LOC107758068,LOC107753016,LOC107670624,LOC107578946,LOC105902995 non-coding downstream 53929 13009874 ~ 13012900 (+)
G125877 NA non-coding downstream 381809 13337754 ~ 13339066 (+)
G125879 NA non-coding downstream 390733 13346678 ~ 13346937 (+)
G125881 wt1b,LOC107717629,LOC107670615,LOC107758040,LOC107602104,LOC107575657,LOC107673204 non-coding downstream 394546 13350491 ~ 13351730 (+)
G125886 NA non-coding downstream 411471 13367416 ~ 13369511 (+)
napab napab,LOC107668964,LOC107758075,LOC107670630,LOC107714540,LOC107565089,LOC108413256 other upstream 21373 12917226 ~ 12925468 (+)
G125836 NA other upstream 62229 12880588 ~ 12884612 (+)
G125830 NA other upstream 124060 12809450 ~ 12822781 (+)
trpc6b trpc6b,trpc6a,LOC107713306,LOC107691992,LOC108429885,LOC108264040 other upstream 1601044 11330221 ~ 11345797 (+)
selenot1b selt1b,LOC107710848,LOC107684611,LOC107557827,LOC108429894 other upstream 1709694 11234331 ~ 11237147 (+)
LOC122362547 LOC107672480,LOC107758042,LOC107554971 other downstream 260539 13216484 ~ 13222148 (+)
rpl35a rpl35a,LOC107673417,LOC107670602 other downstream 471099 13427044 ~ 13430765 (+)
daw1 daw1,LOC107727686,LOC107576612,LOC107717604 other downstream 714344 13670289 ~ 13706114 (+)
G126132 foxa3,LOC107717614,LOC107692498,LOC107602118,LOC107727696,LOC107575381,LOC107670595 other downstream 723100 13679045 ~ 13682571 (+)
lbhl lbhl other downstream 905926 13861871 ~ 13869332 (+)

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