G156496


Basic Information

Item Value
gene id G156496
gene name NA
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 10829167 ~ 10901823 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU231762
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>TU231764
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>TU231765
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>TU231766
attttttttttttTTGGGCTGTTTAAGACCATTTATtgtgctgaaaaacacagaataagacaagtaacaaaaacatttccatcAGCGTTACAgatgtgtaaaaatgtacaaaatcttTTTGCAAGTTTCAGCTCTTCCATTTATTACGTGATATATAAAACAATggatacaaaaaacaaaacaaaaaagaaatactaaAACAGCCCATTATATGGATGGGaaattaatacagaaaaaaaaaggggagCCAATTCCGTCCCCTAGCGTTGGTGTCCTGATCCGGTGTCTGATTCAGGAATGAGGAGAACTCCCCGCCTCCGACTTGCCTCCATCGCTACTTTCACTCGCTTGCCTCATCACCATCTCCCGGGCAATACATGTCACCTGCCCATTGGTCACACTCACCACACCTGACCTGCAGAGAGCCAATCAGATTAAGggatttagaatttaaaaactgATGTCAAACTAGCACCCCTTGTCATGAAATCTGCAATTAAATGTGCATCAGCACTTGGCAAGGCCTTCGTGTTACATGCACCAGCTTGGGAGAAACTCAATCCAGTGACTCACTTCTGCTGAGCTTCCTCAGTAAGAGTTCCCATACCAGGCTGGTTCTGCTTCCCAAAGAAGAAACTGGACCACCAATGCCCAGAATCCTGTTTGGGCAGACCTAAAGCATAATTAAACAGGTCAGAATGAGCAACGCGCCGCCTGCCTAATCTTCTAATGGATTTAGGGCACAATGAGGTAGACACTAACGCAAATTGCAGGTAAAAagtctttaaacaaaaagacatgCAAGCTGATGGACGCACGCAAGCATGAGTCGTTTTTGTAACTGACAAATTCCTCAACAGCTGATTATTCAGAAGCAATCAGACGAGTGTTCAGTTGCGATATGGGTACAAACTTCATTGCATAACGAGCAAATGTCTTCATGTCATGTCAAGATGTTGCAATGAAGTATTGATTGAAGTGGGGGGCTGAAACGAgagtgaaatgaaatgtaactCACCTGGGTGATGTGGAATGACCTCCCCACTGTACTCTGAACTGCCACACGAGCTGCTACTGGATGTAGAGCCAATGcCTTCTGTAGTAGTCGTGAGTAGCAACCAGTGAACCACTAGATGGGATGGCTGCCATTTTACAGACTTGTGTAAATAGTGACTTAGATGGAAACCCTCTTTTGCAGCTCTTGCTGATGGTATTAGAGCACTCTTCTCAATTCAGTCGGAGGCTTTGGGGAGAAAACGCTAGGCGACGGAGCCCATTTGAAAAGGTTGGGATGGATAAGACCCTCCACGTCCTGAAATATCTACCGCAGTGCTGTCTAACAAAAACAACTCGTTTTCCTGCATTTATACAGAGACGAGACGTCGACGACCAGCCGTGATGAAGAAGGC
>TU231767
GCTTTATGTGGCTACAATTTTTATGGTTACGGTTCAAATGTACGCAAAGTACATTTCACTCAGTCTgtgaagtaatttttttaacataaatttgTGTTGTTGGTTGTTTCCAaacttaaaagtgtttttttattttttTATTGGGCTGTTTAAGACCATTTATtgtgctgaaaaacacagaataagacaagtaacaaaaacatttccatcAGCGTTACAgatgtgtaaaaatgtacaaaatcttTTTGCAAGTTTCAGCTCTTCCATTTATTACGTGATATATAAAACAATggatacaaaaaacaaaacaaaaaagaaatactaaAACAGCCCATTATATGGATGGGaaattaatacagaaaaaaaaaggggagCCAATTCCGTCCCCTAGCGTTGGTGTCCTGATCCGGTGTCTGATTCAGGAATGAGGAGAACTCCCCGCCTCCGACTTGCCTCCATCGCTACTTTCACTCGCTTGCCTCATCACCATCTCCCGGGCAATACATGTCACCTGCCCATTGGTCACACTCACCACACCTGACCTGCAGAGAGCCAATCAGATTAAGggatttagaatttaaaaactgATGTCAAACTAGCACCCCTTGTCATGAAATCTGCAATTAAATGTGCATCAGCACTTGGCAAGGCCTTCGTGTTACATGCACCAGCTTGGGAGAAACTCAATCCAGTGACTCACTTCTGCTGAGCTTCCTCAGTAAGAGTTCCCATACCAGGCTGGTTCTGCTTCCCAAAGAAGAAACTGGACCACCAATGCCCAGAATCCTGTTTGGGCAGACCTAAAGCATAATTAAACAGGTCAGAATGAGCAACGCGCCGCCTGCCTAATCTTCTAATGGATTTAGGGCACAATGAGGTAGACACTAACGCAAATTGCAGGTAAAAagtctttaaacaaaaagacatgCAAGCTGATGGACGCACGCAAGCATGAGTCGTTTTTGTAACTGACAAATTCCTCAACAGCTGATTATTCAGAAGCAATCAGACGAGTGTTCAGTTGCGATATGGGTACAAACTTCATTGCATAACGAGCAAATGTCTTCATGTCATGTCAAGATGTTGCAATGAAGTATTGATTGAAGTGGGGGGCTGAAACGAgagtgaaatgaaatgtaactCACCTGGGTGATGTGGAATGACCTCCCCACTGTACTCTGAACTGCCACACGAGCTGCTACTGGATGTAGAGCCAATGcgccctgaaaaaaaaaaaaagtcttataaaGGGAAATTCTCTATTGCTATAGGAGTAAAGCACTGGCAAAGGCAACTTACTTCTGTAGTAGTCGTGAGTAGCAACCAGTGAACCACTAGATGGGATGGCTGCCATTTTACAGACTTGTGTAAATAGTGACTTAGATGGAAACCCTGTGAAGAGATTGAGAAGACATTTAATGCCGAGAGAGAATTTGATGTAAATAACACAACCTAGTTAATAGCTTCTCATCTTAAAATGGATTTTCGTTAATAGAGATAGATTCAGGAAAGGCATTTGAGAGCTTTTATCTCTCACGTGTAGTTTGAAACCTTGTATTGCTTACATATTGGTCTTGTAGCCATTTCTCGTTGTTACACGATTTAATGCCAAACCACAAGATTAATCGAACTGACATTATGCCGTATGAGACATCCATTACAAacactgtgtttttaatcaaacgGCAAGTAACACGAGGAAGTTACAGTAATCCCGTAGGAATTACAGCAGTTGAGATCACAAAGGAAACGTTTTTTACTCAAATGCACACGTGTAATGAAAACATACCCCACTACAGCAAAACACACGATACTAATCGAGGTAACGCTCAGATTCTCTGACCCAAACAATGAGTAACGTTTCCCTTTAAAACTGTGAAGACCACCATCTCACCTCCTTTTGCAGCTCTTGCTGATGGTATTAGAGCACTCTTCTCAATTCAGTCGGAGGCTTTGGGGAGAAAACGCTAGGCGACGGAGCCCATTTGAAAAGGTTGGGATGGATAAGACCCTCCACGTCCTGAAATATCTACCGCAGTGCTGTCTAACAAAAACAACTCGTTTTCCTGCATTTATACAGAGACGAGACGTCGACGACCAGCCGTGATGAAGAAGGC
>TU231768
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>TU231769
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU231769 False 2082 lncRNA 0.41 4 10829167 10901823

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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trnae-cuc_40 NA coding downstream 246 10902069 ~ 10902140 (+)
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slc17a9b slc17a9b,slc17a9,LOC107563661,LOC107560897,LOC106600547 coding downstream 37572 10939395 ~ 10948900 (+)
rnd1a rnd1a,LOC107657046,LOC107737660,LOC107563659,LOC107560900,LOC107672025,LOC103027302,LOC108435239 coding downstream 139257 11041080 ~ 11049656 (+)
prim1 prim1,LOC107741309,LOC107671973 coding downstream 156336 11058159 ~ 11062247 (+)
G156432 NA non-coding upstream 100937 10727933 ~ 10728230 (+)
G156431 NA non-coding upstream 102003 10726918 ~ 10727164 (+)
G156417 NA non-coding upstream 126074 10702729 ~ 10703093 (+)
G156413 NA non-coding upstream 132609 10696302 ~ 10696558 (+)
G156398 NA non-coding upstream 155019 10666861 ~ 10674148 (+)
G156551 NA non-coding downstream 131968 11033791 ~ 11035495 (+)
G156572 NA non-coding downstream 222269 11124092 ~ 11126634 (+)
G156568 NA non-coding downstream 247040 11148863 ~ 11152047 (+)
G156590 NA non-coding downstream 309218 11211041 ~ 11243036 (+)
G156592 NA non-coding downstream 317212 11219035 ~ 11313603 (+)
G156414 LOC107707743,LOC107747988,LOC107671949,LOC107559475 other upstream 128272 10698798 ~ 10700895 (+)
G156399 LOC107707753,LOC107672006,LOC107603149 other upstream 256921 10563344 ~ 10572246 (+)
LOC122329061 fkbp1ab,fkbp1a,LOC107707744,LOC107657066,LOC107747971,LOC108435222,LOC107559476,LOC100705189,LOC105013763,LOC101476936 other upstream 274447 10551097 ~ 10554720 (+)
LOC122328447 LOC107603155,LOC107707751,LOC107672009 other upstream 310416 10514979 ~ 10518751 (+)
LOC122328383 tbx15,tbx18,LOC107712261,LOC107708785,LOC107656541 other upstream 402005 10415663 ~ 10427162 (+)
G156497 trim101,LOC107671958,LOC107560876,LOC107719918,LOC107656995,LOC107747989 other downstream 12081 10913904 ~ 10923988 (+)
LOC122328437 LOC107737657,LOC107560901,LOC107671993,LOC108435244,LOC108275530 other downstream 175331 11077154 ~ 11085604 (+)
G156586 NA other downstream 272598 11174421 ~ 11177033 (+)
kctd6b kctd6b,rpl10,rl10,LOC107671957,LOC107570288,LOC107737715,LOC107560935,LOC108436290,LOC103399204,LOC107672042 other downstream 795591 11697414 ~ 11746570 (+)
LOC122328549 smim4,LOC107560937,LOC107671967,LOC107737614,LOC107712735,LOC107699582,LOC107570283 other downstream 829157 11730980 ~ 11732361 (+)

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